Page 42 - 《广西植物》2020年第12期
P. 42
ϟ 期 时小东等᧥ 基于藜麦转录组的脂肪酸生物合成途径解析 ϟ Ꭾ Ꭾ
表 ই 藜麦 ϓ᎒ 个 ዛࣷࣷᐹᓣ 编码基因
ఋᑕᤦᔀ ࿗জ ᓂᔽ༁ᡷ ᆍ ጢᎮ ዶऊऊᑕ༁ᔀ ੫ᔀႿᔀ༁ ᔽႿ ीࣼᔽႿᆍᑕ
染色体定位 蛋白长度 脂肪系数
基因 ᧧᧕ 基因名 相对分子质量 等电点 不稳定指数֒ 总平均亲水性
ऊၤʢᆍቝᆍ༁ᆍቝᑕ ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ ዶᔽᡱၤᑕᡷᔽዹ
᥈ᔀႿᔀ ᧧᧕ ᥈ᔀႿᔀ Ⴟᑕቝᔀ ᥘऔ ᡱ᧧ ᧧Ⴟ༁ᡷᑕᤦᔽᔽᡷᢃ ᔽႿʛᔀ ֒ ᥈ዶɟ
ᆍዹᑕᡷᔽᆍႿ ᔀႿ੫ᡷၤ ᔽႿʛᔀ
ͅዞÞᤇᤃᤃ ᐹዞዞࣷ ऊၤʢϟ࿗ ጢሕँ ጢऐ ሕϟँ ᤃऐ࿗ ሕጢᤃሕ ऐጢ࿗ ͱԡϟԡ
ͅዞÞᤇᎮᤃ ᐹዞዞࣷ ऊၤʢԡሕ ጢ࿗Ꭾ ጢँ ᤃ࿗ԡ Ꭾϟऐ ሕ࿗ऐϟ ऐऐϟ ͱԡϟᤃ
ͅዞÞᤇऐ ᐹዞዞዛ ऊၤʢԡϟ Ꭾጢ ऐϟ ࿗ऐ ऐँϟ ሕሕᤃ࿗ ँጢ࿗ሕ ͱԡ࿗ϟ
ͅዞÞᤇᤃ ᐹዞዞዛ ऊၤʢԡϟ ጢϟሕ ጢᎮ ϟँᎮ ऐሕጢ ࿗ԡᤃ ϟԡϟϟँ ԡԡ
ͅዞÞᤇᤃᎮ ᐹዞዞዛ ऊၤʢԡϟ ᤃँϟ Ꭾऐ ጢऐ ँϟ࿗ ሕᤃ࿗ጢ ँϟ ͱԡ࿗Ꭾ
ͅዞÞᤇᤃऐ ᐹዞዞዛ ऊၤʢϟԡ Ꭾሕᤃ ऐ ጢँϟ ऐᤃሕ ሕጢँᤃ ँሕ࿗ᤃ ͱԡ࿗ሕ
ͅዞÞᤇᎮ ᐹዞዞዛ ऊၤʢϟԡ ᎮᎮ ऐϟ ࿗ϟ ऐँ࿗ ሕᎮጢϟ ऐँᤃሕ ͱԡጢϟ
ͅዞÞᤇᎮᎮ ᐹዞዞዛ ऊၤʢԡጢ Ꭾϟ Ꭾँ ऐ࿗ऐ ऐጢ࿗ ሕᤃጢሕ ँϟ࿗ ͱԡጢ
ͅዞÞᤇᎮँ ᐹዞዞዛ ऊၤʢԡ ጢᤃԡ ᤃ ሕጢϟ ऐԡऐ ሕጢऐϟ ँԡᎮँ ͱԡጢԡ
ͅዞÞᤇϟԡ ᐹዞዞᦵ ऊၤʢԡϟ ሕᤃँ ࿗ϟ Ꭾᤃ Ꭾᤃᤃ ࿗ጢጢँ ँँԡऐ ԡϟԡ
ͅዞÞᤇϟሕ ᐹዞዞᦵ ऊၤʢԡᎮ ሕጢሕ ሕऐ ጢ࿗ ࿗ँᎮ ሕᎮ࿗ ँᎮ ԡԡϟ
ͅዞÞᤇᤃሕ ᐹዞዞᦵ ऊၤʢԡሕ ሕᎮ ጢ ऐጢϟ ࿗Ꭾጢ ࿗ϟሕሕ ँ࿗ᤃ࿗ ԡԡጢ
ͅዞÞᤇ࿗ ᐹዞዞଧ ऊၤʢԡऐ Ꭾሕ ऐ Ꭾऐ࿗ ᤃ࿗࿗ ᤃᎮሕ ᎮऐँᎮ ͱԡሕԡ
ͅዞÞᤇሕጢ ᐹዞዞଧ ऊၤʢϟԡ ᤃ ሕ ᤃሕ࿗ ጢᎮᎮ Ꭾϟᤃϟ Ꭾጢጢऐ ͱԡጢ
ͅዞÞᤇ࿗ᤃ ᐹዞዞଧ ऊၤʢϟԡ Ꭾሕ ऐ ऐϟँ ᤃጢሕ ᤃᤃऐ ऐሕᤃ ͱԡᤃ
ͅዞÞᤇጢ ᐹዞዞଧ ऊၤʢԡँ ሕ ሕ ሕ ጢᎮᎮ ᤃᎮᎮ࿗ Ꭾँ࿗ ͱԡϟँ
ͅዞÞᤇऐᎮ ᐹዞዞଧ ऊၤʢԡऐ ጢᤃ ᤃ Ꭾँँ ँሕऐ Ꭾᤃԡ Ꭾऐጢँ ͱԡԡ
列结构分析表明ᖔ 含有相对保守的 ዶ୩ ֒ 结构
᥈۪શɟ୩᧧୩ఋዶऊዶఋ୩શྉè ᣰ ̀ ᣰ ɟɯऊ᧧ଫ同时ᖔ藜麦 ዶ୩֒ ሕজ 讨论与结论
序列 શ 端氨基酸序列存在差异性ᖔऊ 端氨基酸序
列相对保守ྉ图 ሕɯᤥ 虽然藜麦全基因组数据已经报道ᖔ但藜麦分
将基因在种子中表达量与其他组织中的表达 子生物学研究基础相对薄弱ᖔ功能基因数据仍有
量进行两两对比发现ᖔ除 ͅዞÞᤇሕԡ 外ᖔ其他 ዶ୩ 编 待深 入地研究 ྉ Ȯᑕʢᔽ༁ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟᎮଫ Իᆍࣼ ᔀᡷ ᑕᖔ
码基因在种子中均发现存在上调表达ଫ与叶片相 ԡϟᎮɯᤥ 转录组测序技术成本低ᖔ灵敏度高ᖔ可在
比ᖔϟ 个基因ྉͅዞÞᤇँɯ 在种子中出现下调表达ᖔ这 短时间内获得大量基因表达数据ᖔ相比其他高通
是挖掘到的唯一的下调表达基因ྉ 表 ጢɯᤥ 对差异 量基因表达数据获得方法具有明显的优势ᖔ已经
表达基因进行分析ᖔ与根相比ᖔϟԡ 个基因为上调表 在油桐ܦ核桃等产油植物的脂肪酸合成途径挖掘
达ଫ与茎相比ᖔऐ 个基因为上调表达ଫ在叶和花中存 中得到成功运用ྉ 陈昊等ᖔԡϟሕଫ 杨丽等ᖔԡϟᎮɯᤥ
在上调表达的基因数目为 ࿗ 个和 ᤃ 个ᤥ 与其他 ࿗ 本研究利用藜麦 ጢ 种组织ྉ 根ܦ茎ܦ叶ܦ花和种子ɯ
个组织相比ᖔ在种子中 ͅዞÞᤇϟጢܦͅዞÞᤇ࿗ጢܦͅዞÞᤇᎮጢܦ 转录组数据ᖔ 测序数据 ͐ሕԡ 碱基百分比 均 大 于
ͅዞÞᤇጢϟ 基因均表现为上调表达ᤥ 上述结果表明ᖔ ँᠮᖔ对比参考基因组效率大于 ँᠮᖔ表明序列测
在种子中 ዶ୩ 编码基因表达量相对其他组织中 序质量达到转录组分析的要求ᤥ 同时ᖔ通过基因
高ᖔ有利于种子中脂肪酸链的延长ᖔ为油脂合成提 组对比分析ᖔ挖掘得到了Ꭾ ࿗ᤃϟ个新基因序列ᖔ并有
供条件ᤥ ጢ ᤃሕ个新基因得到注释ᖔ 新基因的挖掘可能与品