Page 16 - 《广西植物》2020年第3期
P. 16
2 9 6 广 西 植 物 40 卷
素 100 mgL (阳性对照)ꎬDMSO 0 mgL (空白
 ̄1
 ̄1
表 2 26 株可培养内生放线菌的物种组成
对照)涂布于含有 OP50 的 NGM 平板上ꎬ每块平板
Table 2 Species of culturable 26 endophytic actinobacteria
挑去 20 条处于 L4 期的线虫ꎬ每组取 5 个平板ꎬ置
于 20 ℃ 下恒温箱 培 养ꎬ此 时 记 为 寿 命 实 验 第 0 16S rRNA
基因序列
天ꎮ 每天观察并记录线虫存活的数量ꎮ DMSO 在 相似性
菌株编号 相近种
线虫寿命实验中的安全剂量为 2%ꎬ本研究未超过 Strain code Origin 16S rRNA
sequence
identity
安全使用剂量ꎬ不会影响实验结果ꎮ
(%)
活性菌株粗提物液质谱图:取具有延缓线虫
IMDGX 6028 Amycolatopsis niigatensis 97.76
衰老活性的菌株粗提物 5 mgꎬ配制成一定浓度的
溶液来进行液质联用( HPLC ̄MS) 谱图扫描ꎬ液相 IMDGX 6049 Brachybacterium sacelli 97.23
IMDGX 6169 Streptomyces antibioticus 99.61
色谱柱为 Luna 5u C18(2) 100A 150 mm × 4.60
mm 5 micronꎬ流动相为甲醇-水(含 0.1%甲酸)ꎬ流 IMDGX 6193 S. marokkonensis 98.70
 ̄1 IMDGX 6225 Gordonia hongkongensis 99.74
速为 1 mLmin ꎬ分析时间为 50 minꎬ梯度洗脱ꎮ
质谱采 用 电 喷 雾 离 子 源 ( ESI 源)ꎬ 源 喷 射 电 压 IMDGX 6247 Streptomyces albaduncus 99.61
(IS)为 4 500 Vꎬ雾化温度为 180 ℃ ꎮ 根据质谱图 IMDGX 6364 Pseudonocardia carboxydivorans 100
信息分子离子峰ꎬ通过查阅 SciFinder 来初步推断 IMDGX 6578 Nocardioides simplex 99.35
代谢产物类型ꎮ IMDGX 6046 Brevibacterium iodinum 98.80
1.3 统计分析
IMDGX 6048 Brachybacterium paraconglomeratum 99.74
所有数据采用 SPSS Statistics 17.0 进行统计分
IMDGX 6118 Curtobacterium albidum 99.33
析ꎬ图表采用 Excel 2013 和 Graphpad prim 5 绘制ꎬ
IMDGX 6119 Demequina salsinemoris 99.10
通过 DNA Star 软件进行序列整理和 MEGA5.0 软
IMDGX 6131 Isoptericola jiangsuensis 99.49
件构建系统发育树及聚类分析ꎬDataAnalysis 进行
IMDGX 6137 Microbacterium saccharophilum 98.15
液质联用分析ꎮ
IMDGX 6150 Streptomyces carpaticus 98.95
2 结果与分析 IMDGX 6173 Lysinimicrobium pelophilum 98.32
IMDGX 6195 Streptomyces novaecaesareae 100
2.1 红树林伴生植物内生放线菌多样性分析 IMDGX 6239 Nocardiopsis prasina 98.44
根据菌落形态特征进行初步排重后ꎬ选择 62 IMDGX 6270 Brevibacterium permense 97.75
株菌进行 16S rRNA 基因扩增和序列比对分析ꎬ结 IMDGX 6313 Microbacterium arborescens 99.09
果表明 62 株细菌中 26 株为放线菌ꎬ分布于 6 个目 IMDGX 6316 M. proteolyticum 99.48
9 个科 15 个属ꎮ 26 株内生放线菌在 15 个属的多
IMDGX 6326 Curtobacterium citreum 99.49
样性分布如图 1 所示ꎬ链霉菌属( Streptomyces) 分
IMDGX 6329 Streptomyces drozdowiczii 99.35
离出 5 株菌ꎬ占所分离放线菌株总数的 19.23%ꎮ
IMDGX 6458 Nocardiopsis synnemataformans 99.49
此次研究分离到的稀有放线菌包括拟诺卡菌属
IMDGX 6469 Micrococcus yunnanensis 99.87
(Nocardiopsis)、短状杆菌属(Brachybacterium)、短小
杆菌 属 ( Curtobacterium)、 Demequina、 戈 登 氏 菌 属 IMDGX 6469 ̄1 Yimella lutea 98.39
(Gordonia)、类诺卡氏菌属(Nocardioides)、Lysinimi ̄
crobium、细杆菌属(Microbacterium)、假诺卡氏菌属 根据放线菌菌株与典型菌株比对ꎬ16S rRNA 基因
(Pseudonocardia)、微球菌属(Micrococcus)、原小单孢 序列相似性小于 98.5%的菌株是新种的可能性为
菌属(Promicromonospora)、拟无枝酸菌属(Amycola ̄ 80%(徐丽华等ꎬ2007)ꎮ 16S rRNA 基因序列相似
topsis)、Yimella、北里孢菌属(Kitasatospora)ꎬ占分离放 性比对 分 析 结 果 显 示 菌 株 IMDGX 6028、 IMDGX
线菌总数的 80.76%ꎮ 6049、 IMDGX 6137、 IMDGX 6173、 IMDGX 6270、
26 株可培养内生放线菌的物种组成见表 2ꎮ IMDGX 6239 和 IMDGX 6469 ̄1 与 有 效 发 表 菌 株