Page 57 - 《广西植物》2020年第3期
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3 期 李菲等: 桐花树内生和根际细菌多样性及抗血栓活性研究 3 3 7
前处理和分离工作ꎮ 阳性对照药物:血塞通片( 云南维和药业股份
1.1.2 羊血实验试剂 无菌脱纤维羊血( 初筛羊 有限公司)ꎬ购买于一心药业ꎮ
血)和抗凝羊血(复筛羊血)ꎬ均购买于南宁茂接微 1.1.3 培 养 基 ( 1) 分 离 培 养 基: AGG、 M5、 P7、
生物科技有限公司ꎮ M10、M4 和 P3ꎬ详情信息见表 1ꎮ
表 1 细菌分离培养基配方
Table 1 Conponents of culture media for bacterial isolation
分离培养基 主要成分 其他成分
Isolated culture medium Main component Other components
AGG 可溶性淀粉 10.0 gꎬ葡萄糖 1.0 gꎬ甘油 10 mL 琼脂 14.0 g 复合盐母液 10 mL
Soluble starch 10.0 gꎬ glucose anhydrous 1.0 gꎬ glycerol 10 mL
Agar 14.0 g Compound ion
M5 海藻糖 5.0 gꎬ脯氨酸 1.0 gꎬ土壤浸出液 20 mL 去离子水 1 000 mL concentrate 10 mL
Trehalose 5.0 gꎬ proline 1.0 gꎬ soil extract 20 mL
Deionized-water 1 000 mL
P7 L-天门冬酰胺 1.0 gꎬ酪氨酸 0.5 gꎬ甘油 10 mL pH 7.2~ 7.4
L-Asparagine 1.0 gꎬ tyrosine 0.5 gꎬ glycerol 10 mL
M10 可溶性淀粉 10.0 gꎬ水解酪素 0.5 g
Soluble starch 10.0 gꎬ hydrolyzed casein 0.5 g
M4 L-天门冬酰胺 1.0 gꎬ海藻糖 5.0 gꎬ甘油 10 mL
L-Asparagine 1.0 gꎬ trehalose 5.0 gꎬ glycerol 10 mL
P3 粗燕麦粉 20.0 g
Crude oat 20.0 g
注: 复合盐母液 KNO 3 1.0 gꎬ K 2 HPO 4 0.5 gꎬ MgSO 4 7H 2 O 0.5 gꎬ NaCl 0.5 gꎬ NH 4 NO 3 0.1 gꎬ FeSO 4 0.01 gꎬ ZnSO 4 7H 2 O
0.001 gꎬ MnCl 2 H 2 O 0.001 gꎬ 去离子水 10 mLꎮ
Note: Compound ion concentrate KNO 3 1.0 gꎬ K 2 HPO 4 0.5 gꎬ MgSO 4 7H 2 O 0.5 gꎬ NaCl 0.5 gꎬ NH 4 NO 3 0.1 gꎬ FeSO 4 0.01 gꎬ
ZnSO 4 7H 2 O 0.001 gꎬ MnCl 2 H 2 O 0.001 gꎬ deionized ̄water 10 mL.
(2)纯化培养基(改良 ISP2):麦芽提取物 2.0 并及时观察菌株的生长情况ꎬ挑取肉眼可见菌落
gꎬ葡萄糖 2.0 gꎬ酵母提取物 2.0 gꎬ琼脂 15.0 gꎬ去 进行纯化培养ꎬ记录其形态特征和相同菌落数ꎬ以
离子水 1 000 mLꎮ 30%(V / V)甘油 ̄ISP2 混合液作为保护剂ꎬ将纯化
(3)发酵培养基:改良 ISP2 液体培养基ꎮ 好的菌株制成冻存管保藏于-70 ℃ ꎮ
1.2 菌株的分离纯化 1.3 16S rRNA 系统发育分析
1.2.1 样品预处理 参照李菲等(2018) 预处理方 采用 Chelex ̄100 树脂( 周双清等ꎬ2010) 快速
法ꎬ代表性地选择桐花树各组织进行细菌的分离 提取细 菌 的 DNA 作 为 PCR 模 板ꎬ 并 根 据 Walsh
实验ꎮ 首先ꎬ用 5%次氯酸钠溶液浸泡 3 ~ 5 minꎬ用 (1991) 的方法对其进行 PCR 扩增ꎮ 引物为 27F
无菌水冲洗多次ꎻ其次ꎬ用 0.2%吐温 20 溶液浸泡 和 1522Rꎬ参照李菲等(2018) 的方法设定 PCR 反
10 minꎬ用无菌水冲洗多次ꎻ最后ꎬ用 75%的酒精溶 应条件ꎮ 扩增产物经 1%琼脂糖 ̄TAE 凝胶电泳检
液浸泡 5 minꎬ用无菌水冲洗多次ꎮ 消毒后的组织 测合格后ꎬ委托北京擎科新业生物技术有限公司
样品ꎬ分别用无菌手术刀进行切碎ꎻ取约 1 g 的样 进行测序分析ꎮ 序列经 BioEdit Sequence Alignment
品进行充分研磨ꎬ加入 9 mL 无菌水与样品混匀ꎬ Editor 软件整理后ꎬ利用 EzTaxon 服务器进行在线
即为初始的组织悬液ꎬ再依次稀释到 10 和 10 的 比对( Kim et al.ꎬ 2009)ꎻ以同源性最高菌株的有
 ̄4
 ̄3
组织悬液ꎬ待用ꎮ 效序列作为参比对象ꎬ构建 Neighbor ̄Joining 系统
桐花树根际样品的收集ꎬ轻轻刮下根须表面 发育树ꎬ各分支置信值检测设为 Boostrap1 000 次ꎬ对
附着的土壤ꎬ平铺于无菌平皿中ꎬ经 65 ℃ 热风干 各菌株的系统发育地位进行分析(Li et al.ꎬ 2017)ꎮ
燥 30 minꎮ 称取 2.0 g 样品装于 20 mL 无菌水中 1.4 细菌对抗血栓活性的筛选
 ̄2  ̄3
摇匀ꎻ制成 10 和 10 稀释度的样液ꎬ待涂布处理ꎮ 1.4.1 羊血培养基制备 以改良 ISP2 固体培养基为
1.2.2 细菌的分离纯化 取 200 μL 梯度稀释的样 基础培养基ꎬ121 ℃ 高温蒸汽灭菌 20 minꎮ 待培养
液接种于 6 种复合营养培养基中ꎬ28 ℃ 培养数周ꎬ 基冷却至 55 ℃ꎬ添加 10%脱纤维无菌羊血ꎬ摇匀后