Page 120 - 《广西植物)》2021年第1期
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ϟ ϟ ᤃ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
ԡϟऐɯᤥ 本研究利用母系遗传的 ዹᡱ᧕શዶ 和双亲遗 对于 ሕ 个叶绿体 ᧕શዶ 分子片段ᖔ利用 ۪ዶВ۪ ᔀʢ
传的 Ⴟ᧕શዶ 直接测序的方法ᖔ以期探究枳属和富 ࿗ԡᤦϟԡ ྉ୩औᆍᆍʢʛᖔ ԡԡሕɯ 软件进行序列联合并进行
民枳的分类地位ᤥ 同质性检验ᖔ若 ۗᢦԡԡጢ 则说明片段的一致性好ᖔ可
以用于联合分析ᤥ 因为 个核基因ྉ᧧ఋ୩ 和 ዞ၊ʗጢɯ外
ϟজ 材料与方法 显子片段都存在双峰的个体ᖔ 且一致性检验 ۗ ጐ
ԡԡጢᖔ因此ᖔ未将核基因进行联合分析ᤥ
ϓॹϓ 材料
本研究共采集枳属和柑橘属植物的 ࿗Ꭾ 份分子 表 ϓই 本研究材料的采集信息
ఋᑕᤦᔀ ϟজ ୩ᑕቝᡱᔽႿ੫ ᔽႿᆍʢቝᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ ᔀᑕ ᡷᔽ༁༁ࣼᔀ༁ ᔽႿ ᡷၤᔽ༁ ༁ᡷࣼʛᢃ
材料ᖔ其中包括 ँ 份栽培于中国科学院昆明植物
物种名称 采集位置ྉ样品数目ɯ
研究所的富民枳新鲜植物叶片材料ᖔ这 ँ 株富民
୩ᡱᔀዹᔽᔀ༁ ୩ᑕቝᡱᔀ ༁ᔽᡷᔀ༁ ྉ༁ᑕቝᡱᔀ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ༁ɯ
枳于 ϟँँ 年从富民枳的原生地富民县大营镇老 富民枳 中国科学院昆明植物研究所 ྉँɯ
青山冬瓜岭引种ྉϟԡ࿗ँ࿗ᤃጢ ጶᖔጢጢऐሕ શᖔ海拔 ۗᅳႥዞᔠʗࣩ ᡓᅳᤀᡥᐹႥʐʗᐹ ࣼႿቝᔽႿ੫ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀ ᆍ ାᆍᡷᑕႿᢃᖔऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ
ᆍ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉँɯ
ϟऐԡ ቝɯଫऐ 份枳的新鲜植物叶片材料ᖔ其中 份 枳 中国科学院昆明植物研究所ᖔ四川达州市 ྉऐɯ
来自中国科学院昆明植物研究所ଫሕ 份红河大翼橙 ۗॹ ᡙʗᔠஏᅳᤀᔠᐹᡙᐹ ࣼႿቝᔽႿ੫ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀ ᆍ ାᆍᡷᑕႿᢃᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
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低温冷藏植物叶片材料ྉ 中国科学院昆明植物研 红河大翼橙 云南省红河州 ྉሕɯ
究所资源室龚洵课题组ɯଫᤃ 份枳橙的新鲜植物叶 ࣷᔠᡙʗࣩ ၊ᅳႥ၊ᓣᓣႥᔠ ̀ᆍႿ੫ၤᔀᖔ ɟࣼႿႿᑕႿ ۪ʢᆍᔽႿዹᔀ ྉሕɯ
枳橙 中国农业科学院柑橘研究所 ྉᤃɯ
片材料ଫ࿗ 份柚新鲜植物叶片材料ଫᤃ 份柑橘新鲜 ࣷᔠᡙʗࣩ ġ ᔠႥᔠᡙᅳʗࣩቂ ऊᔽᡷʢࣼ༁ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
植物叶片材料ଫሕ 份香橼新鲜植物叶片材料ଫሕ 份 ዶ੫ʢᔽዹࣼᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉᤃɯ
柚 中国农业科学院柑橘研究所 ྉ࿗ɯ
金柑新鲜植物叶片材料ଫ 份箭叶橙新鲜植物叶片 ࣷॹ ቂᐹଝᔠቂᐹ ऊᔽᡷʢࣼ༁ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
材料和 ሕ 份宜昌橙新鲜植物叶片材料ᤥ 另外采集 ዶ੫ʢᔽዹࣼᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉ࿗ɯ
柑橘 中国农业科学院柑橘研究所 ྉᤃɯ
ϟ 份九里香ྉࣩ᤹ʗʗᐹᡥᐹ ᓣଝᅳᡙᔠዞᐹɯ新鲜植物叶片材料作 ࣷॹ ʗᓣᡙᔠዞࣩᤀᐹᡙᐹ ऊᔽᡷʢࣼ༁ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
为本研究的外类群ᤥ 采集的新鲜叶片立即放入硅 ዶ੫ʢᔽዹࣼᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉᤃɯ
香橼 中国农业科学院柑橘研究所 ྉሕɯ
胶干燥ᖔ将干燥好的叶片在ͱԡ ቩ 冰箱保存备用ᤥ ࣷॹ ቂᓣʐᔠዞᐹ ऊᔽᡷʢࣼ༁ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
ዶ੫ʢᔽዹࣼᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉሕɯ
植物材料采集信息见表 ϟᤥ
ϓॹԣ 方法 金柑 中国农业科学院柑橘研究所 ྉሕɯ
ࣷॹ ᢝᐹᡓᅳႥᔠዞᐹ
ऊᔽᡷʢࣼ༁ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
采用改良的 ऊఋዶା 法 从 植物材料中提取总 ዶ੫ʢᔽዹࣼᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉሕɯ
箭叶橙 中国农业科学院柑橘研究所 ྉɯ
᧕શዶ ྉ᧕ᆍᢃᔀᖔ ϟँँϟɯᤥ 通过查阅文献ᖔ从常用于植
ࣷॹ ၊ᡥᡙʗᔠଝ ऊᔽᡷʢࣼ༁ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
物系统学ܦ群体遗传学和保护生物学等的 ᧕શዶ 分 ዶ੫ʢᔽዹࣼᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉɯ
子片段中进行筛选ᖔ共筛选到 ሕ 个 ዹᡱ᧕શዶ 片段和 宜昌橙 中国农业科学院柑橘研究所 ྉሕɯ
ࣷॹ ዞᐹצᐹᤀᓣʗᔠᓣᔠ ऊᔽᡷʢࣼ༁ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀᖔ ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ
个 Ⴟ᧕શዶ 片段ྉ 唐政ᖔ ԡϟ࿗ଫ 杨晓明ᖔ ԡϟᎮɯᖔ其 ዶ੫ʢᔽዹࣼᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉሕɯ
引物信息见表 ᤥ 对于目的条带清晰ᖔ特异性好的 九里香 中国科学院西双版纳植物园 ྉϟɯ
ࣩ᤹ʗʗᐹᡥᐹ ᓣଝᅳᡙᔠዞᐹ ᣮᔽ༁ၤࣼᑕႿ੫ᤦᑕႿႿᑕ ఋʢᆍᡱᔽዹᑕ ାᆍᡷᑕႿᔽዹᑕ ᥈ᑕʢʛᔀႿᖔ
۪ऊ 扩增产物ᖔ送昆明硕擎生物有限公司进行双 ऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ ዶዹᑕʛᔀቝᢃ ᆍ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ༁ ྉϟɯ
向测序以保证测序的准确性ᖔ测序使用与扩增相
同的 引 物ᖔ 测序序列已上传到 શऊା᧧ᖔ 接受号为 জজ 以芸香科九里香做为外类群ᖔ采用最大似然
ᥘશጢऐጢጢϟ᥋ᥘશጢऐጢᤃጢጢ 和 ᥘશᤃሕऐँ࿗᥋ᥘશᤃሕँԡሕᎮᤥ 法ྉቝᑕᔽቝࣼቝ ᔽҴᔀᔽၤᆍᆍʛᖔᥘᓂɯ 和贝叶斯法ྉ ାᑕᢃᔀ༁ᔽᑕႿ
ϓॹᇺ 数据分析 ᔽႿᔀʢᔀႿዹᔀᖔା᧧ɯ构建系统发育树以进行枳属和富民
᧕શዶ 分 子 片段经过测序后ᖔ 利用 ୩ጶ͐ᥘዶશ 枳的分类地位研究ᤥᥘᓂ 分析所需模型及树的构
ྉ୩औᔽႿʛᔀ ᪲ ۪ᑕ༁ᡷᔀʢᔀʢᖔ ϟँँᎮɯ 软件进行序列的编辑 建均在软件 ᥘጶ᥈ዶ ᔀʢ ጢ ྉ ఋᑕቝʢᑕ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟϟɯ 中
和拼 接ᤥ 然 后 将 拼 接好的序列用 ାᔽᆍጶʛᔽᡷ ᔀʢ 执行ᖔ 树 的 构建选用 શᔀᑕʢᔀ༁ᡷ᥋શᔀᔽ੫ၤᤦᆍʢ᥋᧧ႿᡷᔀʢዹၤᑕႿ੫ᔀ
Ꭾԡ࿗ϟ ྉ̀ᑕᖔ ϟँँँɯ 进行序列的比对和手工校对ᤥ ྉશશ᧧ɯ 搜索方法ᖔ 支持率的估计采用ϟ ԡԡԡ次重复