Page 160 - 《广西植物》2021年第4期
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ᤃ ࿗ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
相关性ᤥ ᓂࣼ ᔀᡷ ᑕྉԡԡᎮɯ 对大肠杆菌和酵母细胞 生 物 合 成酶基因 ̵ᤇ̵ቴ௴ܦ ̵ᤇቴۗۗܦ ̵ᤇቴጛÞܦ
蛋白质组进行定量时发现ᖔ细胞内蛋白质丰度与 ̵ᤇ̵᤹ᤩቴϟܦ̵ᤇ̵ቴ௴ϟܦ̵ᤇᤩዛۗᦵ̵ 在这 ϟԡ 个橡胶树
相应的 ቝશዶ 丰 度 具有较高相关性 ྉ 大肠杆菌 种质中的相对表达差异ᖔ以及这些基因间的表达
ቴ ᢉ ԡ࿗Ꭾᖔ酵母 ቴ ᢉ ԡᎮሕɯᤥ ᓂᑕࣼʢᔀႿᡷ ᔀᡷ ᑕྉԡϟԡɯ研 相关性ྉ杨署光等ᖔԡԡɯଫ该研究进一步利用这些
究了 Ꭾ 个代表物种的蛋白质和 ቝશዶ 丰度ᖔ发现 基因的 ी۪ऊ 结果ᖔ分析这些基因间的丰度差异ᤥ
蛋白质丰度与其 ቝશዶ 丰度存在 ԡሕᤃ ጲ ԡᎮԡ 的正
相关性ᤥ ୩ዹၤऔᑕႿၤᘨࣼ༁༁ᔀʢ ᔀᡷ ᑕ ྉ ԡϟϟɯ 在研究小鼠 表 ϓই 实验材料
શ᧧̀ሕఋሕ 细胞内定量蛋白质组时发现蛋白质丰度 ఋᑕᤦᔀ ϟজ ۪ᑕႿᡷ ቝᑕᡷᔀʢᔽᑕ ᆍ ᔀᡱᔀʢᔽቝᔀႿᡷ
与相 应 ቝશዶ 丰 度 存 在 较强的相关性 ྉ ቴ ᢉ 种质 生物学重复 样品
᥈ᔀʢቝᡱᑕ༁ቝ ାᔽᆍᆍ੫ᔽዹᑕ ʢᔀᡱᔀᡷᔽᡷᔽᆍႿ ୩ᑕቝᡱᔀ
ԡ࿗ϟɯᤥ ᥘᑕʢीࣼᔀʢᑕᡷ ᔀᡷ ᑕ ྉԡϟɯ对裂殖酵母的增殖
۪ϟԡᎮ ሕ ϟᖔ ᖔ ሕ
细胞和静止细胞进行定量蛋白质组研究ᖔ发现细
᧧ᥘᤃԡԡ ሕ ࿗ᖔጢᖔᤃ
胞内蛋白质丰度与其相应 ቝશዶ 丰度具有一定相
ᔀ ҴᔀႿᤃऐ ሕ Ꭾᖔऐᖔँ
关性ྉቴ ᢉ ԡጢጢɯᤥ 综上所述ᖔ在细胞群体水平上ᖔ
ᔀ ҴᔀႿ ጢጢ ሕ ϟԡᖔ ϟϟᖔ ϟ
蛋白质丰度与其相应 ቝશዶ 丰度存在较强的相关
ᔀ ҴᔀႿ ጢሕ ሕ ϟሕᖔ ϟ࿗ᖔ ϟጢ
性ᖔቝશዶ 丰度可以解释蛋白质丰度差异的主要
ᨃ ᣰ ऊᥘ ᣰ ϟԡ ࿗࿗ ᣰ ϟᤃԡ ሕ ϟᤃᖔ ϟᎮᖔ ϟऐ
部分ྉ约 ࿗ԡᠮɯᤥ
ᥘఋ ᣰ ᧧ఋ ᣰ ϟሕ ँ ᣰ ऐ ሕ ϟँᖔ ԡᖔ ϟ
茉莉酸信号途径调控巴西橡胶树的橡胶生物
ᨃ ᣰ ऊ ᣰऐ ࿗ ᣰϟԡ࿗ ᖔ ሕ
合成ྉ᧕ᔀႿ੫ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟऐɯᖔ橡胶产量与茉莉酸信号
ᨃ ᣰ ᧧ᣰ ϟԡሕ ϟԡᎮ ࿗ ࿗ᖔ ጢᖔ ᤃᖔ Ꭾ
途径关键环节基因和橡胶生物合成酶基因的表达
ᨃ ᣰ ऊᥘ ᣰ ϟԡ ࿗࿗ ᣰ ࿗ጢ࿗ ሕ ऐᖔ ँᖔ ሕԡ
正相关ྉ杨署光等ᖔԡϟँᑕᖔᤦɯᤥ 目前的 ी۪ऊ 基因
表达分析主要关注基因间ܦ样本组织间或处理条
件下基因的相对表达量ᖔ很少关注功能相关基因 ϓॹԣ 方法
的丰度差异ᤥ 在基因相对表达分析中ᖔ常对目的 根据 ᥈ᔀႿାᑕႿҴྉ ȮèᎮᎮጢ࿗ऐऐɯ 的全长 ዹ᧕શዶ 序列
基因和内参基因作均一化处理ᖔ从而掩盖了不同 设计 ዛࣷ௴ᧇટϟ 的 ी۪ऊ 引物ᖔè᧥᥈ఋఋऊఋዶऊዶዶ᥈ఋ᥈ऊ
基因间的真实丰度差异ᖔ因此ᖔ在基因表达分析 ఋఋఋ᥈ዶఋ᥈᥈ऊ᥈ዶᖔ᧥᥈ऊዶ᥈ऊऊዶఋዶዶऊዶఋ᥈ዶዶዶऊ᥈ऊ
中ᖔ既要关注基因的相对表达量ᖔ也要关注基因间 ዶዶఋዶ᥈ଫ引物的扩增效率为 ँᎮᠮᖔी۪ऊ 产物为
的丰度差异ᖔ这有助于更全面地理解基因的功能ᤥ ϟँԡ ᤦᡱᤥ
σऊी ዛዞᡙᔠႥϟऊीͱ ᥈ᔀႿᔀ ऊी ɼ 计算每个样品
该研究将每个样品中 ዛࣷ௴ᧇટϟ 的基因丰度设为 ϟᖔ 根据ᥥዶ ᢉ ᢉ
分析 ϟጢ 个橡胶生物合成调控相关基因以及常用 中各基因的丰度ྉᑕᤦࣼႿʛᑕႿዹᔀᖔዶɯᖔ即将每个样品中
作内参基因的基因 ϟऐ 的丰度差异ᖔ以期能更全 ዛࣷ௴ᧇટϟ 的丰度均设为 ϟྉ ዶ ᢉ σऊी ᢉ ዛዞᡙᔠႥϟऊीͱ ዛዞᡙᔠႥϟऊी ᢉ
面地理解这些相关基因在橡胶生物合成调控中的 ᢉ ϟɯᤥ
ԡ
地位和作用ᤥ ϓॹᇺ 数据处理
采用 ᥈ʢᑕᡱၤ۪ᑕʛ ۪ʢᔽ༁ቝ ጢ 作图ଫ采用 ୩۪୩୩ 软件
ϟজ 材料与方法 的 ᧕ࣼႿዹᑕႿ 检验进行多重比较分析ᤥ
ϓॹϓ 材料 জ 结果与分析
实验材料ྉ表 ϟɯ和实验设计与先前的报道相
同ᖔ先前报道了 ँ 个茉莉酸信号途径关键环节基 ԣॹϓ 基因转录的平均丰度
因 ̵ᤇࣷ᧣ᧇϟܦ ̵ᤇȣዛԮϟܦ ̵ᤇȣዛԮܦ ̵ᤇȣዛԮሕܦ ̵ᤇ᤹ɔࣷϟܦ 总的来说ᖔ在群体水平上ᖔϟᤃ 个基因的转录丰
̵ᤇ᤹ɔࣷܦ̵ᤇ᤹ɔࣷሕܦ̵ᤇ᤹ɔࣷ࿗ܦ̵ᤇ᤹ɔࣷጢ 和 ᤃ 个橡胶 度差异很大ྉ图 ϟɯᤥ 从高到低排序为 ϟऐᢦቴۗۗᢦ
