Page 40 - 《广西植物》2021年第4期
P. 40
၊ᡙᡙᡓ᧥ᣑ ᣑ ँँँॹࣩᔠ၊ᐹᔠᐹͱᢝᅳࣩʗႥᐹᤀॹዞᅳቂ
জ ᤩࣩᔠ၊ᐹᔠᐹজ ዶᡱʢ ԡϟᖔ ϓྉ࿗ɯ᧥ ጢͱጢሕ࿗
ᦵ᧣ᧇᧅ ϓԔॹϓϓ࣮ᇺϓᣑ ࣩᔠ၊ᐹᔠᐹॹଝऊँԣԔԣԔԔࣽԔԔᣤ
解盛ᖔ 李国旗ᖔ 宋立肖ᖔ 等 罗布麻 ࣷᓣዛ 基因家族的生物信息学分析 ЏȮ 广西植物ᖔ ԡϟᖔ ࿗ϟྉ࿗ɯ᧥ ጢͱጢሕ࿗
ᣮ᧧ጶ ୩ᖔ ᓂ᧧ ᥈͐ᖔ ୩ᨃશ᥈ ᓂᣮᖔ ᔀᡷ ᑕ ାᔽᆍᔽႿᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ዛᡓᅳዞᡥႥࣩቂ צᓣႥᓣᡙࣩቂ ࣷᓣዛ ੫ᔀႿᔀ ᑕቝᔽᢃ ЏȮ ᥈ࣼᔽၤᑕᔽᑕᖔ ԡϟᖔ ࿗ϟྉ࿗ɯ᧥
ጢͱጢሕ࿗
罗布麻 ࣷᓣዛ 基因家族的生物信息学分析
解জ 盛 ϟᕷ ᕷ 李国旗 ϟᕷ᥍ ᕷ 宋立肖 ϟᕷ ᕷ 谢博勋 ϟᕷ ᕷ 王雅芳 ϟᕷ ᕷ 刘জ 星 ϟᕷ
ྉϟ 宁夏大学 西北土地退化与生态恢复国家重点实验室培育基地ᖔ 银川 Ꭾጢԡԡϟଫ
宁夏大学 西北退化生态系统恢复与重建教育部重点实验室ᖔ 银川 Ꭾጢԡԡϟ ɯ
摘জ 要ᧅ 植物体中纤维素是细胞壁形成的主要成分ᖔ不仅参与细胞形态的建成ᖔ调控细胞发育ᖔ还参与细胞
内多种细胞信号转导途径ᖔ进而影响植物体的生长发育ᤥ 纤维素合酶是植物体合成纤维素的主要酶类ᤥ 为
了探究 ࣷᓣዛ 基因家族对罗布麻生长发育及纤维素合成的调控机理ᖔ该文通过生物信息学分析方法ᖔ从基因
家族鉴定ܦ结构分析ܦ蛋白理化性质与多级结构预测ܦ亚细胞定位ܦ信号肽ܦ进化关系和顺式作用元件等方
面ᖔ对罗布麻 ࣷᓣዛ 基因家族进行系统鉴定和分子特征分析ᤥ 结果表明᧥基于全基因组测序ᖔ罗布麻 ࣷᓣዛ 基
因家族鉴定含有 ϟጢ 个成员ᖔ分布在罗布麻 ϟϟ 条染色体中的 ऐ 条上ᖔ其编码蛋白的氨基酸数量为 Ꭾሕԡ ጲ
ϟϟጢऐᖔ相对分子质量 ऐϟ ऐԡ ऐϟ ጲ ϟሕԡ ϟሕ ϟऐ Ҵ᧕ᑕᖔ 理论等电点 ᤃ ϟऐ ጲ ऐ ऐሕᤥ 除了 ዶऊᔀ༁ዶሕܦ ዶऊᔀ༁ዶጢܦ
ዶऊᔀ༁ዶᎮܦዶऊᔀ༁ዶϟԡ 和 ዶऊᔀ༁ዶϟϟ 蛋白为稳定蛋白ᖔ其余成员均为不稳定蛋白ଫ除了 ዶऊᔀ༁ዶϟ 蛋白为疏水性
蛋白ᖔ其余成员均为亲水性蛋白ᤥ 该家族成员包含 ሕጲ ϟ࿗ 个外显子ᖔऐ ጲ ϟጢ 个保守基序ᤥ 编码蛋白主要分布
于质膜与高尔基体上ᖔ无信号肽ᖔ二级结构以无规则卷曲与 ም᥋螺旋为主要构成元件ᤥዶऊᔀ༁ዶϟጢ 蛋白的跨膜
结构域和三级结构与其他成员存在显著不同ᤥ 罗布麻 ࣷᓣዛ 基因进化时主要受纯化选择作用ᤥ 对上游 ϟ ጢԡԡ
ᤦᡱ 区域顺式作用元件分析ᖔ结果显示罗布麻 ࣷᓣዛ 基因受到光ܦ温度ܦ水分ܦ氧气等环境因子及生长素ܦ赤霉
素ܦ脱落酸ܦ乙烯ܦ水杨酸等植物激素调控ᤥ 该研究为进一步探究罗布麻 ࣷᓣዛ 基因家族的生物学功能ܦ提高
纤维品质与品种改良奠定理论基础ᤥ
关键词ᧅ 罗布麻ᖔ 纤维发育ᖔ 生物信息学分析ᖔ ࣷᓣዛ 基因家族ᖔ 生长发育
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡϟɯԡ࿗᥋ԡጢ᥋ϟሕ
ଧᔠᅳᔠႥஏᅳʗቂᐹᡙᔠዞ ᐹႥᐹᤀᡥᔠ ᅳஏ ዛᡓᅳዞᡥႥࣩቂ צᓣႥᓣᡙࣩቂ
ࣷᓣዛ ᓣႥᓣ ஏᐹቂᔠᤀᡥ
ϟᖔ ϟᖔ᥍ ϟᖔ ϟᖔ ϟᖔ ϟᖔ
ᣮ᧧ጶ ୩ၤᔀႿ੫ ᖔ ᓂ᧧ ᥈ࣼᆍीᔽ ᖔ ୩ᨃશ᥈ ᓂᔽᔽᑕᆍ ᖔ ᣮ᧧ጶ ାᆍࣼႿ ᖔ ۼዶશ᥈ ɟᑕᑕႿ੫ ᖔᓂ᧧В ᣮᔽႿ੫
ྉϟ ଧʗᓣᓣʐᔠႥ ଧᐹᓣ ஏᅳʗ ᡙᐹᡙᓣ ᣞᓣᡥ ᒦᐹᤇᅳʗᐹᡙᅳʗᡥ ᅳஏ ᒦᐹႥʐ ᦵᓣʗᐹʐᐹᡙᔠᅳႥ ᐹႥʐ ጛዞᅳᤀᅳᔠዞᐹᤀ ቴᓣᡙᅳʗᐹᡙᔠᅳႥ ᔠႥ ટᅳʗᡙ၊ँᓣᡙ ࣷ၊ᔠႥᐹᖔ ટᔠႥଝᔠᐹ ІႥᔠצᓣʗᔠᡙᡥᖔ
ɟᔽႿዹၤࣼᑕႿ Ꭾጢԡԡϟᖔ ऊၤᔽႿᑕଫ ᣞᓣᡥ ᒦᐹᤇᅳʗᐹᡙᅳʗᡥ ஏᅳʗ ቴᓣዞᅳצᓣʗᡥ ᐹႥʐ ቴᓣᡙᅳʗᐹᡙᔠᅳႥ ᅳஏ ᦵᓣʗᐹʐᓣʐ ጛዞᅳᡥᡙᓣቂ ᔠႥ ટᅳʗᡙ၊۩ᓣᡙᓣʗႥ
ࣷ၊ᔠႥᐹ ᅳஏ ᤹ᔠႥᔠᡙʗᡥ ᅳஏ ጛʐࣩዞᐹᡙᔠᅳႥᖔ ટᔠႥଝᔠᐹ ІႥᔠצᓣʗᔠᡙᡥᖔɟᔽႿዹၤࣼᑕႿᎮጢԡԡϟᖔऊၤᔽႿᑕ ɯ
收稿日期ᧅ ԡԡͱϟԡͱϟँ
基金项目ᧅ 宁夏自然科学基金项目ྉԡԡዶዶऊԡሕԡᎮᤃɯଫ宁夏大学西部一流大学重点实验室建设专项ྉ ᥈ԻᣮᥘԡϟᎮԡԡϟɯ Џ ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ
ᤦᢃ શᑕᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ èᆍࣼႿʛᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ શᔽႿ੫ᔽᑕྉԡԡዶዶऊԡሕԡᎮᤃɯଫ ୩ᡱᔀዹᔽᑕ ۪ʢᆍ੫ʢᑕቝ ᆍʢ ᔀᢃ ᓂᑕᤦᆍʢᑕᡷᆍʢᢃ ऊᆍႿ༁ᡷʢࣼዹᡷᔽᆍႿ ᆍ ᡷၤᔀ èᔽʢ༁ᡷ ऊᑕ༁༁ ВႿᔽᔀʢ༁ᔽᡷᢃ
ᔽႿ ۼᔀ༁ᡷ ऊၤᔽႿᑕᖔ શᔽႿ੫ᔽᑕ ВႿᔽᔀʢ༁ᔽᡷᢃ ྉ᥈ԻᣮᥘԡϟᎮԡԡϟɯᤥ
作者简介ᧅ 解盛ྉϟँँᤃͱɯᖔ硕士研究生ᖔ主要从事植物资源生态研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯᢼ༁ၤᔀႿ੫ᑕᔽ݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ
᥍
通信作者ᧅ 李国旗ᖔ博士ᖔ研究员ᖔ主要从事植物生态学等研究工作ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯ੫ࣼᆍीᔽᔀᔀ݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ