Page 69 - 《广西植物》2021年第4期
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࿗ 期 郑威等᧥ 龙眼 ᦵᤀۗɔ 基因在根和叶中的表达及其生物信息学分析 ጢ ጢ ϟ
图 ሕজ ᧕۪୩ɟ 蛋白保守结构域分析
èᔽ੫ ሕজ ዶႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ዹᆍႿ༁ᔀʢᔀʛ ʛᆍቝᑕᔽႿ ᆍ ᧕۪୩ɟ
表 ϓই ۗ᧣ቴ௴ 对 ᦵᤀۗɔ 蛋白的亚细胞定位分析
ఋᑕᤦᔀ ϟজ ዶႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ༁ࣼᤦዹᔀࣼᑕʢ ᆍዹᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ
᧕۪୩ɟ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᤦᢃ ۪୩ᨃఋ
定位 分值
ᓂᆍዹᑕᔽझᑕᡷᔽᆍႿ ୩ዹᆍʢᔀ
膜外 ԡሕᎮԡ
ᨃࣼᡷ༁ᔽʛᔀ
细胞核 ԡϟऐԡ
શࣼዹᔀࣼ༁
溶酶体 ԡϟँԡ
ᓂᢃ༁ᆍ༁ᆍቝᔀ
内质网ྉ膜ɯ ԡϟԡԡ
ጶႿʛᆍᡱᑕ༁ቝᔽዹ ʢᔀᡷᔽዹࣼࣼቝ ྉቝᔀቝᤦʢᑕႿᔀɯ
图 ࿗জ ୩ᔽ੫Ⴟᑕ۪ ࿗ϟ 预测 ᧕۪୩ɟ 蛋白的信号肽
èᔽ੫ ࿗জ ۪ʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᆍ ༁ᔽ੫Ⴟᑕ ᡱᔀᡱᡷᔽʛᔀ ᆍ ᧕۪୩ɟ
ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᤦᢃ ୩ᔽ੫Ⴟᑕ۪ ࿗ϟ
图 ᤃজ ۪ʢᆍᡷ୩ዹᑕᔀ 预测 ᧕۪୩ɟ 蛋白的亲疏水性
èᔽ੫ ᤃজ ۪ʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᆍ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᔽᔽዹᔽᡷᢃ ᑕႿʛ
ၤᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹᔽᡷᢃ ᆍ ᧕۪୩ɟ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᤦᢃ ۪ʢᆍᡷ୩ዹᑕᔀ
图 ጢজ ఋᥘ̀ᥘᥘ 对 ᧕۪୩ɟ 蛋白的跨膜性分析
èᔽ੫ ጢজ ఋʢᑕႿ༁ቝᔀቝᤦʢᑕႿᔀ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ
᧕۪୩ɟ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᤦᢃ ఋᥘ̀ᥘᥘ 测ᖔ结果如图 Ꭾ 所示ᤥ᧕۪୩ɟ 蛋白中有 ሕጢ 个氨基
酸残基呈现 ም᥋螺旋结构ᖔ占肽链氨基酸总数的
表明ᖔ᧕۪୩ɟ 最大正分值ྉᤃᎮऐɯ 位于肽链中的第 ጢጢँጢᠮଫ࿗ँ 个氨基酸残基呈延伸链结构ᖔ占肽链
ᤃ 位氨基酸ᖔ最小负分值ྉ ͱሕԡɯ 位于第 ጢᎮ 位氨 氨基酸总数的 ϟϟᤃᎮᠮଫϟᎮ 个氨基酸残基呈 Ꮗ᥋转
基酸ᖔ整条肽链的亲水性氨基酸数量大于疏水性 角结构ᖔ占肽链氨基酸总数的 ࿗ԡጢᠮଫϟϟँ 个氨基
氨基酸数量ᖔ推测 ᧕۪୩ɟ 为可溶性亲水蛋白ᤥ 酸残基呈无规则卷曲结构ᖔ占肽链氨基酸总数的
ԣॹ ᦵᤀۗɔ 蛋白的二级结构分析 ऐሕሕᠮᤥ ᧕۪୩ɟ 蛋白的主要结构为 ም᥋螺旋和无规
采用 ୩ᨃ۪ᥘዶ 对 ᧕۪୩ɟ 蛋白二级结构进行预 则卷曲ᖔ该结构有助于蛋白质的稳定性ᤥ