Page 8 - 《广西植物》2021年第4期
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࿗ ँ ԡ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
以获得原生境中促进兰科植物种子萌发的促生菌 ዶ۪᧕ 和形态学分析相结合的方法应用到大西洋
ྉାʢࣼႿʛʢᔀᡷᡷ ᔀᡷ ᑕᖔԡԡሕɯᤥ 该方法的优点是突破了 雨林兰科植物保护计划中ᖔ探讨了 Ꭾ 种新热带兰
种子共生萌发研究的时空限制ᖔ对兰科植物的异 花的菌根真菌及其特异性ᤥ
地栽培有非常好的指导作用ᤥ ԣॹᇺ ʗᦵટዛ 片段高通量测序技术
经典的研究方法常用于 菌根真菌的分类鉴 ʢ᧕શዶ 片段高通量测序技术ᖔ又称扩增子高通
定ܦ共生验证等研究ᤥ 经过分离培养后得到的菌 量测序ᤥ 从兴起至今已经历了几代测序平台ᖔ如
根真菌ᖔ可以使用诱导产孢法和菌丝融合群分类 ࿗ጢ࿗ 测序平台ܦᥘᔽ༁ᔀी 测序平台ܦ̀ᔽ༁ᔀी 测序平台等ᖔ
法ᖔ结合菌落形态特征ܦ菌丝显微结构ܦ菌丝细胞 随着测序策略的发展ᖔ读长不断增长ᖔ使得基于高
核数目ܦ菌丝隔膜超微结构等进行分类鉴定ᤥ 然 通量测序平台的测序研究物种多样性的准确性大
而ᖔ经典的研究方法往往很难将菌根真菌鉴定到 幅度提高ྉ ᓂࣼᆍ ᔀᡷ ᑕᖔԡϟɯᤥ 利用高通量测序平
种ᖔ同时也容易出现鉴定不准确的现象ᖔ并且可能
台进行测序ᖔ具有费用低ܦ测序深度高ܦ利于鉴定
存在大量菌根真菌不能被分离培养的现象ᤥ 现经
低丰度群落物种的优点ᖔ已成为研究真菌群落多
典分类方法多用于前期处理ᖔ与分子技术相结合
样性的首选之策ྉ᧕ᔀ੫ႿᑕႿ ᪲ ᨃዹၤቝᑕႿᖔԡϟϟɯᤥ 常用
进行兰科植物菌根真菌的鉴定ܦ多样性ܦ特异性ܦ
于此项技术的 ʢ᧕શዶ 片段ᖔ对于真菌来说ᖔ有位于
营养交流ܦ时空格局ܦ代谢产物等研究ᤥ
核糖体 ϟऐ୩ 与 ጢ ऐ୩ 之间的 ᧧ఋ୩ϟ 和位于 ጢ ऐ୩ 与
ԣॹԣ 早期分子生物学方法
ऐ୩ 之间的 ᧧ఋ୩ᖔ它们都属于中度保守区域ᖔ适用
ԡ 世纪 ጢԡ 年代ᖔ分子生物学的兴起为菌根真
于种 及种以下分类单元的研究 ྉۼᑕࣼʛ ᔀᡷ ᑕᖔ
菌的研究带来了春天ᖔ多种分子标记开始应用到
ԡϟ࿗ɯଫ对于细菌来说ᖔ适宜的扩增片段有 ϟᤃ୩ 的
菌根真菌的研究领域ᖔ早期的分子生物学技术主
࿗ܦሕͱ࿗ܦ࿗ͱጢ 区等ྉɟࣼ ᔀᡷ ᑕᖔԡϟሕɯᤥ
要有限制性片段长度多态性技术ྉèᓂ۪ɯܦ末端限
近年来ᖔ应用扩增子测序的方法研究兰科菌
制性片段长度多态性技术ྉ ఋ᥋èᓂ۪ɯܦ᧕શዶ 微阵列
根 真菌或内生真 菌的研究陆续出现ᤥ 如
ྉ芯片ɯ 技术ྉᥘᔽዹʢᆍᑕʢʢᑕᢃɯܦ随机扩增多态性 ᧕શዶ
ȮᑕዹीࣼᔀቝᢃႿ ᔀᡷ ᑕྉԡϟ࿗ɯ使用 ࿗ጢ࿗ 焦磷酸测序法ᖔ对
技术ྉዶ۪᧕ɯܦ扩增限制性片段长度多态性技术
地中海草原两个 ጢ ቝ ġ ጢ ቝ 的样方中小尺度空
ྉዶèᓂ۪ɯܦ变性 ᣰ 温度梯度凝胶电泳技术 ྉ᧕᥈᥈ጶ ᣰ
间同域分布的 Ꭾ 种兰科植物的菌根真菌特征进行
ఋ᥈᥈ጶ ɯܦ 实时荧光定量 ۪ऊ 技术 ྉ ᔀᑕ᥋ᡷᔽቝᔀ
了研究ᤥ ۪ᔀʢᆍᡷᡷᆍ ᔀᡷ ᑕྉԡϟ࿗ɯ利用 ࿗ጢ࿗ 焦磷酸测序
۪ऊɯܦ磷脂脂肪酸图谱分析技术ྉ ۪ᓂèዶ༁ɯܦ荧光
法对 分布于地中海 绿 色 草 甸 上 的 兰 花 ᓣʗᐹᡓᔠᐹ
原位杂交技术ྉè᧧୩̀ɯᖔ以及早期的 ʢ᧕શዶ 测序技
צᅳቂᓣʗᐹዞᓣᐹ 和其菌根真菌 ௴ࣩᤀᐹႥᓣᤀᤀᐹ ዞᐹᤀᅳᡓᅳʗᐹ 之间
术等ᤥ
上述分子技术方法常以组合的形式结合经典 的体 外 共 生 系 统 进 行了研究ᤥ ȮᑕዹीࣼᔀቝᢃႿ ᔀᡷ ᑕ
研究方法应用到兰科菌根真菌多样性ܦ特异性ܦ时 ྉԡϟᤃɯ使用 ࿗ጢ࿗ 焦磷酸测序法研究了 ϟ࿗ 种掌裂
空变化ܦ互作网络ܦ系统发育等诸多方面的研究 兰属ྉᦵᐹዞᡙᡥᤀᅳʗ၊ᔠऊᐹɯ兰科植物中菌根真菌组合的生
态和地理变异ᤥ ऊᔀᑕᆍ༁ ᔀᡷ ᑕྉԡϟᎮɯ利用 ᧧ࣼቝᔽႿᑕ
中ᤥ 如 ାᆍࣼ੫ᆍࣼʢᔀ ᔀᡷ ᑕྉԡԡጢɯ 通过 ᧧ఋ୩᥋۪ऊܦèᓂ۪
分析和原球茎定殖试验的方法对澳大利亚东南昆 ᥘᔽ༁ᔀी 平台对 ᧧ఋ୩ 区进行了高通量测序ᖔ研究了厄
士兰地区兰科 ዛዞᔠᐹႥᡙ၊ࣩܦࣷᐹᤀᐹʐᓣႥᔠᐹ 和 ۗᡙᓣʗᅳᡙᡥᤀᔠ 植 瓜多尔南部山区雨林中三种同域附生热带兰科植
物内生真菌的多样性及菌根真菌的特异性进行了 物 ྉ ࣷᡥʗᡙᅳዞ၊ᔠᤀࣩቂ ஏᤀᓣଝࣩᅳࣩቂܦ ࣷॹ ቂᡥᐹႥᡙ၊ࣩቂ 和
研究ᤥ ఋᑕᢃᆍʢ ᔀᡷ ᑕ ྉ ԡԡሕɯ 利 用 显微观察ᖔ 结合 ᤹ᐹଝᔠᤀᤀᐹʗᔠᐹ ዞᐹᤀᐹႥᡙ၊ᐹɯ菌根真菌群落的特征ᖔ结果发
èᓂ۪ 分析ܦ᧧ఋ୩ 和 ᓂ୩В 核糖体基因片段的测序方 现了 菌根真菌群落建群种 ྉ Ҵᔀᢃ༁ᡷᆍႿᔀ ቝᢃዹᆍʢʢၤᔽझᑕ
法对沙漠分布的非光合兰花 ̵ᓣଝᐹᤀᓣዞᡙʗᔠ ᡓᔠዞᐹᡙᐹ 与 ࣼႿ੫ᔽɯ的存在ᤥ ऊᔀᑕᆍ༁ ᔀᡷ ᑕྉԡϟऐɯ利用同样的技
其菌根真菌进行了研究ᖔ利用 èᓂ۪ 型对他们之间 术方法对上述三种兰科植物的内生真菌群落组成
的进化关系进行了探讨ᤥ ۪ᔀʢᔀᔽʢᑕ ᔀᡷ ᑕ ྉ ԡԡጢɯ 将 的驱动因素进行了研究ᤥ