Page 26 - 《广西植物》2022年第12期
P. 26
２ ０ １ ６ 广 西 植 物 ４２ 卷
Ｘ 轴表示蛋白编码基因和基因间隔区的名字ꎻ Ｙ 轴表示核苷酸多样性值ꎮ
Ｘ ａｘｉｓ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈｅ ｎａｍｅｓ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎ￣ｃｏｄｉｎｇ ｇｅｎｅｓ ａｎｄ ｇｅｎｅｓ ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃ ｒｅｇｉｏｎｓꎻ Ｙ ａｘｉｓ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｅａｃｈ ｗｉｎｄｏｗ.
图 ６ 台湾芙蓉、‘牡丹粉’‘金秋颂’与‘单瓣白’之间的核苷酸多态性比较分析
Ｆｉｇ. ６ Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｖａｒｉａｂｉｌｉｔｙ ａｍｏｎｇ Ｈｉｂｉｓｃｕｓ ｔａｉｗａｎｅｎｓｉｓꎬ Ｈ. ｍｕｔａｂｉｌｉｓ
ｃｖ. Ｍｕｄａｎｆｅｎꎬ Ｈ. ｍｕｔａｂｉｌｉｓ ｃｖ. Ｊｉｎｑｉｕｓｏｎｇ ａｎｄ Ｈ. ｍｕｔａｂｉｌｉｓ ｃｖ. Ｄａｎｂａｎｂａｉ
红色和白色分别表示较高和较低的 ＲＳＣＵ 值ꎮ 图的右边是物种间的系统发育关系ꎮ
Ｒｅｄ ａｎｄ ｗｈｉｔｅ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｈｉｇｈｅｒ ａｎｄ ｌｏｗｅｒ ＲＳＣＵ ｖａｌｕｅｓꎬ ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ. Ｒｉｇｈｔ ｏｆ ｔｈｅ ｆｉｇｕｒｅ ｓｈｏｗｓ ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ａｍｏｎｇ ｓｐｅｃｉｅｓ.
图 ７ １５ 个物种 (含 ３ 个品种) 所有 ｃｐＤＮＡ 蛋白编码区 (ＣＤＳ) 同义密码子的相对使用度 (ＲＳＣＵ)
Ｆｉｇ. ７ ＲＳＣＵ ｖａｌｕｅｓ ｏｆ ａｌｌ ｐｒｏｔｅｉｎ￣ｃｏｄｉｎｇ (ＣＤＳ) ｇｅｎｅｓ ｆｏｒ ｃｐＤＮＡ ｆｒｏｍ １５ ｓｐｅｃｉｅｓ (ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｔｈｒｅｅ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ)
含量和 ＩＲ 区边界的情况在较大程度上说明了木 延伸和准确性、ｍＲＮＡ 的剪切和蛋白质的折叠( 任
芙蓉与台湾芙蓉的亲缘关系非常之近ꎬ而木槿和 桂萍等ꎬ２０１９)ꎮ 因此ꎬ密码子偏好性在一定程度
朱槿的亲缘关系则相对较远ꎮ 上也能反映出亲缘关系ꎮ 文中密码子偏好性聚类
同义密码子是由突变产生的ꎬ进化压力导致 结果将台湾芙蓉与木芙蓉 ３ 个品种聚在一起ꎬ‘ 金
这些同义密码子的使用频率发生变化( Ｈａｎｓｏｎ ＆ 秋颂’与‘单瓣白’ 的密码子偏好性无差异ꎬ‘ 牡丹
Ｃｏｌｌｅｒꎬ ２０１７)ꎮ 密码子偏好性是物种对其碱基组 粉’和台湾芙蓉相比前者编码亮氨酸密码子 ＵＵＡ
成、ｔＲＮＡ 丰度和环境选择压力长期适应的结果 的偏好性略高ꎬ其中台湾芙蓉还在缬氨酸和丝氨
(Ｎｏｖｏａ ＆ ｄｅ Ｐｏｕｐｌａｎａꎬ ２０１２ꎻ Ｂｅｈｕｒａ ＆ Ｓｅｖｅｒｓｏｎꎬ 酸的密码子偏好上表现出差异ꎬ从密码子偏好性
２０１２)ꎮ 此外ꎬ密码子偏好性会影响翻译的起始、 上我们能判断出木芙蓉和台湾芙蓉的亲缘关系很
