Page 209 - 《广西植物》2023年第5期

９ ７ ６ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 １ 云南樱花品种‘红霞’的叶绿体基因组 ｂ / ｆ 复 合 物 ( ｐｅｔＢ、 ｐｅｔＬ、 ｐｅｔＮ、 ｐｅｔＧ、 ｐｅｔＤ、 ｐｅｔＡ )、
Ｔａｂｌｅ １ Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ ｃｈｅｅｒｙ ＲｕｂｉｓＣＯ 大亚基( ｒｂｃＬ)、成熟酶( ｍａｔＫ)、光系统 Ｉ
ｃｕｌｔｉｖａｒ Ｃｅｒａｓｕｓ‘Ｈｏｎｇｘｉａ’ ｉｎ Ｙｕｎｎａｎ
(ｐｓａＩ、ｐｓａＡ、ｐｓａＢ、ｐｓａＪ、ｐｓａＣ)、核糖体蛋白( ＳＳＵ)
鸟嘌呤和胞嘧啶
起点 终点 长度 ( ｒｐｓ２、 ｒｐｓ１１、 ｒｐｓ３、 ｒｐｓ８、 ｒｐｓ１６、 ｒｐｓ１９、 ｒｐｓ１５、 ｒｐｓ４、
区域 Ｇｕａｎｉｎｅ ａｎｄ
Ｓｔａｒｔ Ｅｎｄ Ｌｅｎｇｔｈ
Ｒｅｇｉｏｎ Ｃｙｔｏｓｉｎｅ ｒｐｓ１２、ｒｐｓ１４、 ｒｐｓ７、 ｒｐｓ１８)、 光 系 统 Ⅱ ( ｐｓｂＭ、 ｐｓｂＨ、
(ｂｐ) (ｂｐ) (ｂｐ)
(％)
ｐｓｂＩ、ｐｓｂＥ、ｐｓｂＣ、ｐｓｂＪ、ｐｓｂＺ、ｐｓｂＬ、ｐｓｂＫ、ｐｓｂＡ、ｐｓｂＮ、
全基因组 １ １５７ ８３２ １５７ ８３２ ３６.７３
ｐｓｂＢ、ｐｓｂＴ、 ｐｓｂＤ、 ｐｓｂＦ)、 其 他 基 因 ( ａｃｃＤ、 ｃｅｍＡ、
Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ
大单拷贝区 １ ８５ ９５０ ８５ ９５０ ３４.６１ ｃｃｓＡ)ꎮ
ＬＳＣ
此外ꎬ共检测到‘ 红霞’ 叶绿体基因组的 ＳＳＲ
反向重复区 ８５ ９５１ １１２ ３３１ ２６ ３８１ ４２.５６
ＩＲＡ 序列 ２４７ 个(图 ３)ꎬ包括 １６３ 个复杂重复序列( 绿
小单拷贝区 １１２ ３３２ １３１ ４５１ １９ １２０ ３０.２０ 色短杆)和 ８４ 个简单重复序列( 其中两碱基重复
ＳＳＣ
序列 ７３ 个ꎬ黑色短杆ꎻ四碱基重复序列 １０ 个ꎬ黄
反向重复区 １３１ ４５２ １５７ ８３２ ２６ ３８１ ４２.５６
ＩＲＢ 色短杆ꎻ六碱基重复序列 １ 个)ꎮ

叶绿体基因组图谱的内圈为 ＭＩＳＡ(Ｖ.１.０)识别的微卫星序列ꎬ外圈是用 ＣＰＧＡＶＡＳ２(Ｖ.２)绘制ꎬ显示质体上的基因结构ꎬ基因的
颜色根据它们的功能分类来区分ꎮ
Ｔｈｅ ｉｎｎｅｒ ｃｉｒｃｌｅ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｍａｐ ｉｓ ｔｈｅ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ｂｙ ＭＩＳＡ (Ｖ.１.０)ꎬ ａｎｄ ｔｈｅ ｏｕｔｅｒ ｃｉｒｃｌｅ ｉｓ ｄｒａｗｎ ｂｙ
ＣＰＧＡＶＡＳ２( Ｖ. ２)ꎬ ｓｈｏｗｉｎｇ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｎ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅ. Ｔｈｅ ｃｏｌｏｒ ｏｆ ｇｅｎｅｓ ｉｓ ｄｉｓｔｉｎｇｕｉｓｈｅｄ ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ ｔｈｅｉｒ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ
ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ.
图 ３ 云南樱花品种‘红霞’的叶绿体基因组
Ｆｉｇ. ３ Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ ｃｈｅｅｒｙ ｃｕｌｔｉｖａｒ Ｃｅｒａｓｕｓ ‘Ｈｏｎｇｘｉａ’ ｉｎ Ｙｕｎｎａｎ