Page 20 - 《广西植物》2025年第12期
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2 1 6 2                                广  西  植  物                                         45 卷
            示ꎬ梅衣科、蜈蚣衣科( Physciaceae Zahlbr.)、石蕊                心机( Eppendorf Centridfuge 5417R) 以 14 000 r
                                                                   ̄1
            科( Cladoniaceae Zenker) 和 茶 渍 科 ( Lecanoraceae     min 离心 5 minꎬ上清液即为样品的基因组 DNAꎬ
            Körb.)为该区域的优势科ꎮ 然而ꎬ目前尚无学者对                         将 DNA 转移至收集管后稀释 10 倍ꎮ PCR 扩增以
            上述地衣类群开展分类研究ꎬ本底数据缺乏ꎮ 本                             ITS1f( Gardes & Brunsꎬ 1993) 和 ITS4a ( Larena et
            研究针对该区域属种多样性最高、生物量最大且                              al.ꎬ1999) 为引物ꎬ扩增体系总体积为 25 μL( 2 ×
            具有多领域开发潜力的梅衣科地衣开展分类研                               Trio Taq Master Mix 12.5 μL、ddH O 9.5 μLꎬ引物各
                                                                                            2
            究ꎬ澄清该科的物种组成和资源分布ꎬ明确物种鉴                             1 μLꎬ模板 DNA 1 μL)ꎮ 扩增程序:94 ℃ 预变性 5
            定特征ꎬ对长江三角洲及邻近区域梅衣科地衣的                              minꎬ35 次循环(94 ℃ 变性 15 sꎬ53 ℃ 退火 15 sꎬ72
            药用、生态及经济价值评估和可持续利用具有重                              ℃ 延伸 1 min)ꎬ72 ℃ 延伸 10 minꎬ4 ℃ 保存( 何宣

            要意义ꎮ                                               宣和贾泽峰ꎬ2023)ꎮ 扩增产物送至通用生物( 安
                                                               徽)股份有限公司进行纯化和双向测序ꎮ
            1  材料与方法                                           1.5 序列比对和系统发育分析
                                                                   公司返回序列在 NCBI 上使用 BLAST 工具进
            1.1 研究材料                                           行 比 较 分 析 ( https: / / blast. ncbi. nlm. nih. gov /
                 研究标本于 2021—2024 年间采自安徽省大别                     Blast. cgi)ꎬ 确 定 为 地 衣 型 真 菌 序 列 后ꎬ 采 用
            山区各市县ꎬ现存放于安徽师范大学生命科学学                              Geneious Prime 软件对双向序列进行拼接并去除
            院植物标本馆( AHUB) 和中国科学院昆明植物研                          两侧模糊碱基ꎮ 在 GenBank 中下载了 41 条同科
            究所地衣标本馆(KUN ̄L)ꎮ                                    ITS 参 考 序 列 和 2 条 外 类 群 大 叶 鳞 型 衣
            1.2 形态特征观察                                         [ Gypsoplaca macrophylla ( Zahlbr.) Timdal] 序 列
                 地衣体形态特征观察和 拍 照 在 体 式 显 微 镜                    (Arup et al.ꎬ2007)ꎬ与本研究获得的 45 条梅衣科
            OLYMPUS SZ61TR 和相机 MS60 ̄2 下完成ꎬ显微特                  序列 共 同 组 成 矩 阵 ( 表 1 )ꎮ 使 用 MAFFT v. 7
            征观 察 在 正 置 偏 光 显 微 镜 OLYMPUS BX43 下                (Katoh et al.ꎬ2019)的 E ̄INS ̄i 策略进行序列比对ꎬ
            完成ꎮ                                                最终用于建树的矩阵有 544 个碱基位点ꎮ 本研究
            1.3 化学方法                                           采用最大似然法( maximum likelihoodꎬML)ꎬ使用
                 本研究采用显色反应和薄层层析( thin layer                    IQ ̄TREE 的 在 线 版 本 ( http: / / iqtree. cibiv. univie.
            chromatographyꎬTLC)方法检测地衣化学物质ꎮ 显                   ac.at/ ꎻTrifinopoulos et al.ꎬ2016) 构建系统发育树ꎬ
            色反应试剂为 K(10%KOH 溶液) 和 C [ Ca( ClO)                 将 ITS 划 分 为 ITS1、 5. 8S 和 ITS2 3 个 分 区ꎬ IQ ̄
                                                          2
            溶液]ꎬ使用 0.1 mm 毛细管点于地衣体表面及髓                         TREE 推测的各分区最适模型为 ITS1( SYM+G4)、
            层ꎬ观察颜色变化ꎮ 薄层层析根据文献资料中梅                             5.8S(K2P+I)、ITS2( TIM3e+G4)ꎬ设置 1 000 次重
            衣科地衣化学物质的特性( Jayalal et al.ꎬ2012ꎻ陈                 复 计 算ꎮ 采 用 SH ̄aLRT ( SH ̄aLRT support )
            健斌ꎬ2015)ꎬ采用 A 溶剂系统(甲苯 ∶ 二氧杂环己                      ( Guindon et al.ꎬ 2010 )、 aBayes ( aBayes support)

            烷 ∶ 乙 酸 = 180 ∶ 45 ∶ 5ꎬ 体 积 比) ( Culberson &       ( Anisimova et al.ꎬ 2011 ) 和 UFBoot ( Ultrafast
            Kristinssonꎬ1970) 和 C 溶 剂 系 统 ( 甲 苯 ∶ 乙 酸 =        bootstrap approximation) ( Minh et al.ꎬ2013) 3 种方
            100 ∶ 15ꎬ体积比)(Orange et al.ꎬ2001)ꎮ                 法评 估 各 分 支 节 点 支 持 率ꎬ SH ̄aLRT (%) ≥ 80、
            1.4 DNA 提取、PCR 扩增和测序                               aBayes≥0.95 或 UFBoot(%)≥95 的分支被认为得
                 采用 Chelex(弱阳离子螯合树脂) 法提取地衣                     到良好支持ꎬ并以该次序呈现在系统发育树上( 图
            体的基因组 DNAꎮ 分取 1 mm 大小的新鲜标本地                        1)ꎮ 使用 MEGA 7 将 系 统 发 育 树 可 视 化ꎬ 并 在
                                        2
            衣体尖端装入 2 mL EP 管ꎬ使用植物组织研磨仪                         PowerPoint 2021 中进行美化编辑ꎮ
                         ®
            (MP FastPrep  ̄24) 将样品研磨成粉后ꎬ加入 100
            μL 10%Chelex 溶液(5 g Chelex 100 Resin 粉末溶           2  结果与分析
                                         ®
            于 50 mL ddH O)ꎬ涡旋振荡 10 ~ 30 sꎮ 其后ꎬ在 95
                         2
            ℃ 下 的 金 属 浴 锅 ( JOANLAB DB100) 中 放 置 20            2.1 系统发育学分析结果
            minꎬ每 5 min 涡旋振荡一次ꎬ随后采用高速冷冻离                           本研究新产生梅衣科 4 属 15 种的 ITS 序列 45
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