Page 20 - 《广西植物》2025年第12期
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2 1 6 2 广 西 植 物 45 卷
示ꎬ梅衣科、蜈蚣衣科( Physciaceae Zahlbr.)、石蕊 心机( Eppendorf Centridfuge 5417R) 以 14 000 r
 ̄1
科( Cladoniaceae Zenker) 和 茶 渍 科 ( Lecanoraceae min 离心 5 minꎬ上清液即为样品的基因组 DNAꎬ
Körb.)为该区域的优势科ꎮ 然而ꎬ目前尚无学者对 将 DNA 转移至收集管后稀释 10 倍ꎮ PCR 扩增以
上述地衣类群开展分类研究ꎬ本底数据缺乏ꎮ 本 ITS1f( Gardes & Brunsꎬ 1993) 和 ITS4a ( Larena et
研究针对该区域属种多样性最高、生物量最大且 al.ꎬ1999) 为引物ꎬ扩增体系总体积为 25 μL( 2 ×
具有多领域开发潜力的梅衣科地衣开展分类研 Trio Taq Master Mix 12.5 μL、ddH O 9.5 μLꎬ引物各
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究ꎬ澄清该科的物种组成和资源分布ꎬ明确物种鉴 1 μLꎬ模板 DNA 1 μL)ꎮ 扩增程序:94 ℃ 预变性 5
定特征ꎬ对长江三角洲及邻近区域梅衣科地衣的 minꎬ35 次循环(94 ℃ 变性 15 sꎬ53 ℃ 退火 15 sꎬ72
药用、生态及经济价值评估和可持续利用具有重 ℃ 延伸 1 min)ꎬ72 ℃ 延伸 10 minꎬ4 ℃ 保存( 何宣
要意义ꎮ 宣和贾泽峰ꎬ2023)ꎮ 扩增产物送至通用生物( 安
徽)股份有限公司进行纯化和双向测序ꎮ
1 材料与方法 1.5 序列比对和系统发育分析
公司返回序列在 NCBI 上使用 BLAST 工具进
1.1 研究材料 行 比 较 分 析 ( https: / / blast. ncbi. nlm. nih. gov /
研究标本于 2021—2024 年间采自安徽省大别 Blast. cgi)ꎬ 确 定 为 地 衣 型 真 菌 序 列 后ꎬ 采 用
山区各市县ꎬ现存放于安徽师范大学生命科学学 Geneious Prime 软件对双向序列进行拼接并去除
院植物标本馆( AHUB) 和中国科学院昆明植物研 两侧模糊碱基ꎮ 在 GenBank 中下载了 41 条同科
究所地衣标本馆(KUN ̄L)ꎮ ITS 参 考 序 列 和 2 条 外 类 群 大 叶 鳞 型 衣
1.2 形态特征观察 [ Gypsoplaca macrophylla ( Zahlbr.) Timdal] 序 列
地衣体形态特征观察和 拍 照 在 体 式 显 微 镜 (Arup et al.ꎬ2007)ꎬ与本研究获得的 45 条梅衣科
OLYMPUS SZ61TR 和相机 MS60 ̄2 下完成ꎬ显微特 序列 共 同 组 成 矩 阵 ( 表 1 )ꎮ 使 用 MAFFT v. 7
征观 察 在 正 置 偏 光 显 微 镜 OLYMPUS BX43 下 (Katoh et al.ꎬ2019)的 E ̄INS ̄i 策略进行序列比对ꎬ
完成ꎮ 最终用于建树的矩阵有 544 个碱基位点ꎮ 本研究
1.3 化学方法 采用最大似然法( maximum likelihoodꎬML)ꎬ使用
本研究采用显色反应和薄层层析( thin layer IQ ̄TREE 的 在 线 版 本 ( http: / / iqtree. cibiv. univie.
chromatographyꎬTLC)方法检测地衣化学物质ꎮ 显 ac.at/ ꎻTrifinopoulos et al.ꎬ2016) 构建系统发育树ꎬ
色反应试剂为 K(10%KOH 溶液) 和 C [ Ca( ClO) 将 ITS 划 分 为 ITS1、 5. 8S 和 ITS2 3 个 分 区ꎬ IQ ̄
2
溶液]ꎬ使用 0.1 mm 毛细管点于地衣体表面及髓 TREE 推测的各分区最适模型为 ITS1( SYM+G4)、
层ꎬ观察颜色变化ꎮ 薄层层析根据文献资料中梅 5.8S(K2P+I)、ITS2( TIM3e+G4)ꎬ设置 1 000 次重
衣科地衣化学物质的特性( Jayalal et al.ꎬ2012ꎻ陈 复 计 算ꎮ 采 用 SH ̄aLRT ( SH ̄aLRT support )
健斌ꎬ2015)ꎬ采用 A 溶剂系统(甲苯 ∶ 二氧杂环己 ( Guindon et al.ꎬ 2010 )、 aBayes ( aBayes support)
烷 ∶ 乙 酸 = 180 ∶ 45 ∶ 5ꎬ 体 积 比) ( Culberson & ( Anisimova et al.ꎬ 2011 ) 和 UFBoot ( Ultrafast
Kristinssonꎬ1970) 和 C 溶 剂 系 统 ( 甲 苯 ∶ 乙 酸 = bootstrap approximation) ( Minh et al.ꎬ2013) 3 种方
100 ∶ 15ꎬ体积比)(Orange et al.ꎬ2001)ꎮ 法评 估 各 分 支 节 点 支 持 率ꎬ SH ̄aLRT (%) ≥ 80、
1.4 DNA 提取、PCR 扩增和测序 aBayes≥0.95 或 UFBoot(%)≥95 的分支被认为得
采用 Chelex(弱阳离子螯合树脂) 法提取地衣 到良好支持ꎬ并以该次序呈现在系统发育树上( 图
体的基因组 DNAꎮ 分取 1 mm 大小的新鲜标本地 1)ꎮ 使用 MEGA 7 将 系 统 发 育 树 可 视 化ꎬ 并 在
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衣体尖端装入 2 mL EP 管ꎬ使用植物组织研磨仪 PowerPoint 2021 中进行美化编辑ꎮ
®
(MP FastPrep  ̄24) 将样品研磨成粉后ꎬ加入 100
μL 10%Chelex 溶液(5 g Chelex 100 Resin 粉末溶 2 结果与分析
®
于 50 mL ddH O)ꎬ涡旋振荡 10 ~ 30 sꎮ 其后ꎬ在 95
2
℃ 下 的 金 属 浴 锅 ( JOANLAB DB100) 中 放 置 20 2.1 系统发育学分析结果
minꎬ每 5 min 涡旋振荡一次ꎬ随后采用高速冷冻离 本研究新产生梅衣科 4 属 15 种的 ITS 序列 45

