Page 119 - 《广西植物》2021年第7期

ϟ ϟ ࿗ ऐ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
表 ԣই 根据酶切方案设计预测相关信息 两金ྉ除 ାᓂɟϟ 外ɯଫା 组为细柄百两金ྉ 除 ାᓂᣮጢܦ
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ԰জ ᧧Ⴟ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᑕዹዹᆍʢʛᔽႿ੫ ᡷᆍ ᡷၤᔀ ାᓂᣮᤃܦାᓂᣮऐ 外ɯଫऊ 组为贵州朱砂根ྉԻ୩᥈ϟͱऐɯܦ湖
ᔀႿझᢃቝᔀ ʛᔽ੫ᔀ༁ᡷᔽᆍႿ ቝᔀᡷၤᆍʛ
北朱砂根ྉԻ୩̀ɯ和红凉伞ྉ̀ᓂɯᖔ说明这三个种或变
酶 插入片段大小 ୩ᓂዶè 个数 种的遗传背景差异较小ଫ᧕ 组为江西朱砂根ྉԻ୩Ȯϟͱ
ጶႿझᢃቝᔀ ᧧Ⴟ༁ᔀʢᡷ ༁ᔽझᔀ ୩ᓂዶè Ⴟࣼቝᤦᔀʢ
ᤃɯᖔ与其余群体关系较远ᖔ有明显的分群现象ᤥ
̀ᑕᔀᎏշ୩ዹᑕ᧧᥋̀è ࿗ϟ࿗ጲ ࿗ᤃ࿗ ԰԰԰ ጢԡँ
ሕজ 讨论与结论
表 ᇺই 水稻日本晴测序读长比对结果统计表
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ዶ᤟ᔽ੫ႿቝᔀႿᡷ ʢᔀ༁ࣼ᤟ᡷ༁ ᔽႿ ᧣ʗᡥऊᐹ ໧ᐹᡙᔠצᐹ ༁༁ᡱ঎ ᢝᐹᡓᅳႥᔠዞᐹ 近几年ᖔ኏ዶ۪᧕ܦ᧧୩୩኏ 等分子标记已应用到八
爪金龙种质资源的评价和遗传分析ᖔ采用 ኏ዶ۪᧕
双端比对 正常酶 部分酶 分子标记技术对朱砂根遗传多样性进行分析ᖔ朱
۪ᑕᔽʢᔀʛ᥋ 未比对 切比例 切比例
样品 ᔀႿʛ ВႿቝᑕᡱᡱᔀʛ શᆍʢቝᑕ᤟ ۪ᑕʢᡷ 砂根群体在 ᧕શዶ 水平上存在着丰富的遗传多态
୩ᑕቝᡱ᤟ᔀ ቝᑕᡱᡱᔀʛ ʢᔀᑕʛ༁ ʛᔽ੫ᔀ༁ᡷᔽᆍႿ ʛᔽ੫ᔀ༁ᡷᔽᆍႿ
ʢᔀᑕʛ༁ ྉᠮɯ ᡱʢᆍᡱᆍʢᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍᡱᆍʢᡷᔽᆍႿ 性ྉ江香梅等ᖔ԰ԡԡᤃɯᤥ 骆亮等 ྉ ԰ԡ԰ԡɯ 分析了 ԰ԡ
ྉᠮɯ ྉᠮɯ ྉᠮɯ
个朱砂根野生居群的 ԰ጢጢ 个样品的遗传多样性ᖔ
水稻日本晴 发现 ጢ 条 ᧧୩୩኏ 引物共扩增出 ँᤃ 条多态性条带ᤥ
᧣ʗᡥऊᐹ ໧ᐹᡙᔠצᐹ ༁༁ᡱ঎ ᢝᐹᡓᅳႥᔠዞᐹ ँᤃ঎ँᤃ ԰঎ԡጢ ँጢ঎Ꭾँ ࿗঎԰ϟ
但由于八爪金龙无参考基因组ᖔ常规方法开发的
特异分子标记数量不多ᤥ 单核苷酸多态性ྉ༁ᔽႿ੫᤟ᔀ
ྉ图 ጢɯᖔ交叉验证错误率最小时为最优分群组ᤥ Ⴟࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ᡱᆍ᤟ᢃቝᆍʢᡱၤᔽ༁ቝᖔ୩શ۪ɯ 是一种较为有效的
当 ᣽ ᢉ ᤃ 时ᖔ交叉验证错误率最小ᖔ因此最佳分群 分子标记ྉᓂᔽࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟ԰ɯᖔ可用于动植物的群体
数为 ᤃᖔ将 ࿗԰ 份八爪金龙种质资源分为 ᤃ 个亚组ᖔ 遗传和进化关系研究ᤥ 赵俊生等ྉ԰ԡϟᤃɯ 利用 ୩શ۪
表明八爪金龙种间遗传差异较大ᖔ形成明显的种 分子标记分析化橘红的种质资源ᖔ从中筛选出 ԰ϟ
群遗传分化ᤥ 当 ᣽ ᢉ ԰ 时ᖔ百两金和朱砂根明显分 个多态性 ୩શ۪ 位点ᖔ为化橘红种质资源鉴定提供
开ଫ当 ᣽ ᢉ ሕ 时ᖔ朱砂根ܦ百两金和江西武功山朱砂 了有效的分子标记ᤥ 孙清明等ྉ ԰ԡϟሕɯ 利用 ୩શ۪
根区分开ଫ当 ᣽ ᢉ ࿗ 时ᖔ将细柄百两金ܦ原变种百两 分子标记对 ሕᤃሕ 份荔枝种质资源进行亲缘关系鉴
金ܦ江西武功山朱砂根和贵州朱砂根区分开ଫ当 定ᖔ为荔枝新种质的亲本来源鉴定提供分子标记ᤥ
᣽ ᢉ ጢ 时ᖔ将细柄百两金ܦ原变种百两金ܦ江西武功 简化基因组测序ྉ୩ᓂዶè᥋༁ᔀी ɯ技术能够在无参
山朱砂根ܦ贵州朱砂根和湖北朱砂根区分开ଫ当 基因组物种中实现 ୩શ۪ 特异性分子标记开发ᖔ可
᣽ ᢉ ᤃ 时ᖔ将细柄百两金ܦ原变种百两金ܦ江西武功 用于植物遗传多样性的研究ᤥ 有研究利用 ୩ᓂዶè᥋
山朱砂根ܦ贵州朱砂根ܦ湖北朱砂根区分开和红凉 ༁ᔀी 技术已经构建了枸杞果实和叶片性状的 ୩શ۪
伞区分开ᖔ但存在基因渗入的情况ᤥ 高密度遗传图谱ྉԻၤᑕᆍ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯ和丹参高密度
ԣॹ᎒ ۗࣷዛ 分析 遗传连锁图ྉᓂᔽࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟᤃɯᤥ ᧕ࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ྉ԰ԡϟँɯ采
用 ጶ᧧᥈ጶશ୩ᨃèఋ 软件对 ԰ ԰ँँ ᤃ࿗ԡ 个 ୩શ۪ 位点 用 ୩ᓂዶè᥋༁ᔀी 方法ᖔ对 Ꭾ 个中国本地山楂属植物和
进行 ۪ऊዶ 分析ᖔ得到 ࿗԰ 份八爪金龙主成分聚类分 ԰ 个欧洲ܦϟ 个北美外来山楂属植物的 ጢሕ 个家系
析结果ྉ图 ᤃɯᤥ 通过 ۪ऊዶ 分析将个体聚为三维ᖔ 进行了分析ᖔ共鉴定出ँሕሕ ࿗ጢԡ个 ୩શ۪ᖔ用于物种基
۪ऊϟ 代表第一主成分ᖔ۪ऊ԰ 代表第二主成分ᖔ۪ऊሕ 代 因组进化研究ᤥ 姜涛等ྉ԰ԡ԰ԡɯ 利用 ୩ᓂዶè᥋༁ᔀी 测
表第三主成分ᖔ且 ۪ऊϟܦ۪ऊ԰ܦ۪ऊሕ 的方差贡献率分 序技术对 ሕँ 份连翘种质资源遗传多样性和 ୩શ۪
别为 ሕँ঎԰ϟᠮܦϟऐ঎ጢऐᠮܦᎮ঎Ꭾϟᠮᤥ 从图 ᤃ 可以看出ᖔ样 分子标记进行研究ᖔ共获得 ϟऐԡ ँᎮ࿗ ϟ 个 ୩શ۪ 分子
品间存在差异ᖔ来自同一地方的朱砂根ᣰ 百两金基 标记ᖔ将连翘资源分为 ࿗ 组ᖔ为其遗传结构分类提

本上聚在一起ᖔ说明它们之间的亲缘关系比较近ᤥ 供新的信息ᤥ 唐晓敏等ྉ԰ԡ԰ԡɯ 利用 ୩ᓂዶè᥋༁ᔀी 技
图中不同颜色表示所属的群体ᖔ能够反映个体的聚 术对广金钱草样品进行测序ᖔ开发得到 ୩શ۪ 多态
类情况ᖔ群体之间的距离能够反映亲缘关系的远 标记 ԰԰ԡ Ꭾԡ࿗ 个ᖔ为种质保护和遗传改良提供参

近ᤥ 群体之间的距离越远说明遗传背景越远ᖔ将 ࿗԰ 考ᤥ 本研究利用 ୩ᓂዶè᥋༁ᔀी 技术对 ࿗԰ 份八爪金龙
份材料大致分为 ዶܦାܦऊܦ᧕ 四组ᤥዶ 组为原变种百 种质资源进行测序ᖔ共开发得到 ԰ ԰ँँ ᤃ࿗ԡ 个 ୩શ۪