Page 53 - 《广西植物》2021年第8期

ऐ 期 张 玉 秀 等 ᧥ 莪术基原植物 ᧕શዶ 条形码序列的筛选与鉴定 ϟ ԰ ᤃ Ꭾ
表 ᇺই 不同 ᦵટዛ 条形码序列的评估
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ጶ׹ᑕ᤟ࣼᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ʛᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ᧕શዶ ᤦᑕʢዹᆍʛᔽႿ੫ ༁ᔀीࣼᔀႿዹᔀ༁
参数
᧧ఋ୩ ᧧ఋ୩԰ ቂᐹᡙᣞ ᡓ໧ᤇዛ᤬ᡙʗႥ̵ ᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦ ᡙʗႥᒦ᤬ᡙʗႥÞ ʗᡓᅳଧ
۪ᑕʢᑕቝᔀᡷᔀʢ
样本数量 ϟ࿗ ϟ࿗ ϟ࿗ ϟ࿗ ϟ࿗ ϟ࿗ ϟ࿗
શᆍ঎ ᆍ஦ ᔽႿʛᔽ׹ᔽʛࣼᑕ᤟
۪ऊ኏ 成功率 ϟԡԡ ϟԡԡ ϟऐ঎Ꭾጢ ϟԡԡ ϟԡԡ ϟԡԡ ϟԡԡ
۪ऊ኏ ༁ࣼዹዹᔀ༁༁ ʢᑕᡷᔀྉᠮɯ
测序成功率 ԡ Ꭾ঎ϟ࿗ Ꭾጢ ϟԡԡ ϟԡԡ ϟԡԡ ϟԡԡ
୩ᔀीࣼᔀႿዹᔽႿ੫ ༁ࣼዹዹᔀ༁༁ ʢᑕᡷᔀ ྉᠮɯ
序列长度 ԰࿗ᤃ ᤃϟँ ᤃ࿗԰ ᤃ࿗԰ጲ ᤃ࿗ጢ ሕ԰ጢ ጲ ሕ԰ᤃ ሕ࿗ϟ
୩ᔀीࣼᔀႿዹᔀ ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ ྉᤦᡱɯ
变异位点数 ϟ ԡ ϟ ϟ ϟ ԡ
શᆍ঎ ᆍ஦ ׹ᑕʢᔽᑕᤦ᤟ᔀ ༁ᔽᡷᔀ༁

码序列 ᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦᤥ
核基因 ᧧ఋ୩ 和 ᧧ఋ୩԰ 在莪术类植物间的测序成
功率很低ᖔऊၤᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ྉ԰ԡϟ࿗ɯ 认为这主要是由于多
倍体杂交和多年人工栽培造成的ᤥ 虽可通过构建
单克隆载体的方式得到 ᧧ఋ୩԰ 序列ᖔ但这无疑增加
了成本和难度ᖔ且在姜黄属内能提供分辨率仅为
࿗ᤃ঎Ꭾᠮྉ ऊၤᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟ࿗ɯᤥ ቂᐹᡙᣞ 是植物 ᧕શዶ 条
形码研究的核心条形码序列之一ྉ ᓂᔀᔽ༁ᡷᔀʢ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ
ϟँँऐɯᖔ但它在本研究的样本中 ۪ऊ኏ 扩增效率最
低ྉϟऐ঎Ꭾጢᠮɯᖔ类似的问题在其他植物中也多有报

道ྉ ୩ᑕ༁༁ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡᎮଫ ̀ᆍ᤟᤟ᔽႿ੫༁औᆍʢᡷၤ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡँଫ
ऊၤᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟ࿗ɯᤥ ऊၤᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ྉ԰ԡϟ࿗ɯ利用多对引
物和多次摸索后ᖔ将姜黄属 ቂᐹᡙᣞ 序列扩增成功率
图 ϟজ 基于 શȮ 法ྉᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦ 数据ɯ构建的系统树 提高至 ऐጢ঎ ࿗ᠮᖔ却发现姜黄属 ቂᐹᡙᣞ 序列不存在
èᔽ੫঎ ϟজ ۪ၤᢃ᤟ᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᡷʢᔀᔀ ዹᆍႿ༁ᡷʢࣼዹᡷᔀʛ ᤦᑕ༁ᔀʛ ᆍႿ ᤦᑕʢዹᆍʛᔀ ੫ᑕᡱྉऊၤᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟ࿗ɯᤥ 我们利用其序列
શȮ ቝᔀᡷၤᆍʛ༁ ྉᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦ ʛᑕᡷᑕɯ
进行分析ᖔ发现 ቂᐹᡙᣞ 序列不能将莪术不同基原植
物分开ᤥ 从 ۪ऊ኏ 扩增效率和测序成功率考虑ᖔ我
全球 生物分类研究的热点和方向 ྉ 陈士林 等ᖔ 们认为 ቂᐹᡙᣞܦ᧧ఋ୩ 和 ᧧ఋ୩԰ 这三条序列不适宜作为
԰ԡϟሕɯᤥ 由于植物的核苷酸进化速率低于动物ᖔ且 莪术基原植物鉴定的候选序列ᤥ
植物存在更多杂交和多倍化的进化事件ᖔ植物中 ᡓ໧ᤇዛ᤬ᡙʗႥ̵ܦʗᅳᡓଧܦᡙʗႥᒦ᤬ᡙʗႥÞ 和 ᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦ 这四条
没有一个单独的片段能像动物 ऊᨃ᧧ 一样成为高效 序列在本研究中的扩增和测序成功率均为 ϟԡԡᠮᖔ

和通用条形码ᤥ 因此ᖔ筛选一个或多个适合植物 但前三个序列在这些样本中极度保守ܦ进化速率
分类的 ᧕શዶ 条形码序列成为十分重要的研究内 慢ᖔ其种间差异为零或差异极小ᖔ而 ᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦ 存在
容ྉऊၤᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟԡଫ ᥈ʢᆍࣼᡱ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟϟɯᤥ 本研究 丰富的变异ᤥ 因此ᖔ我们将其作为莪术不同基原
在 ᧧ఋ୩ܦ ᧧ఋ୩԰ܦ ᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦܦ ቂᐹᡙᣞܦ ᡓ໧ᤇዛ᤬ᡙʗႥ̵ܦ ᡙʗႥᒦ᤬ᡙʗႥÞ 植物鉴定的适宜序列ᤥ 在此基础上ᖔ本研究基于
和 ʗᡓᅳଧ 等 Ꭾ 条 ᧕શዶ 条形码候选序列中ᖔ从 ۪ऊ኏ ᐹᡙᡓଧ᤬ʗᤇዞᒦ 序列ᖔ通过计算遗传距离和构建 શȮ 系统

扩增的难易程度ᖔ测序成功率和变异程度等方面ᖔ 树ᖔ将β中国药典ଭ 中莪术的三种基原植物明显区
筛选到了一条适宜鉴定莪术基原植物 ᧕શዶ 条形 分开ᖔ同时鉴定结果说明海南和江西引种的样品