Page 102 - 《广西植物》2023年第2期

２ ９ ６ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 １ 马铃薯 ＴＣＰ 转录因子基因的特征 保守性ꎮ 从图 ２ 可以看出ꎬＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００００５９７
Ｔａｂｌｅ １ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ＴＣＰ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ 和 ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００３３０７８ 与拟南芥 ＡＴ３Ｇ４７６２０.１
ｆａｃｔｏｒ ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｓｏｌａｎｕｍ ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ
(ＡｔＴＣＰ１４) 亲缘关系较近ꎻＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００１５３７７
基因 氨基酸 与拟 南 芥 ＡＴ３Ｇ１５０３０. １ ( ＡｔＴＣＰ４) 亲 缘 关 系 较 近ꎻ
染色体 长度 数目 外显子
基因号 位置 数目 ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００４０５４、 ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００５７０５ 和
Ｇｅｎｅ Ａｍｉｎｏ
Ｇｅｎｅ ＩＤ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ Ｅｘｏｎ
ｌｅｎｇｔｈ ａｃｉｄ ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００００８２３ 与 ＡＴ１Ｇ６８８００.１(ＡｔＴＣＰ１２)亲
ｌｏｃａｔｉｏｎ ｎｕｍｂｅｒ
(ｂｐ) ｎｕｍｂｅｒ
缘关系最近ꎻＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００４０８２ 和 ＰＧＳＣ０００３ＤＭ
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００００５９７ ３ １ ３２５ ４１４ ３
Ｇ４０００２４６３２ 与 拟 南 芥 ＡＴ５Ｇ０８０７０. １ ( ＡｔＴＣＰ１７) 和
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００００８２３ ５ １ ０６５ ３５４ １
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００１３６２ ２ ８５２ ２８３ ２ ＡＴ５Ｇ６０９７０. １ ( ＡｔＴＣＰ５ ) 亲 缘 关 系 较 近ꎻ
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００４５１９７、 ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２４２５４ 和
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００３３８２ ５ １ １１６ ３７１ ３
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００９２７６ １１ １ １７０ ３８９ １ ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２２７３８ 与 拟 南 芥 ＡＴ２Ｇ４５６８０. １
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００９４０６ ７ ９３６ ３１１ ３ (ＡｔＴＣＰ９)、 ＡＴ５Ｇ５１９１０. ２ ( ＡｔＴＣＰ１９) 和 ＡＴ５Ｇ５１９１０. １
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００１２３９６ ７ １ ２０３ ４００ ２
(ＡｔＴＣＰ１９) 亲缘关系较近ꎻＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００９４０６
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００１５３７７ １２ １ ２６６ ４２１ １
与拟南芥 ＡＴ２Ｇ３１０７０.１(ＡｔＴＣＰ１０)亲缘关系较近ꎮ
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００１６３６３ １ １ ３４７ ４４８ ６
２.５ 马铃薯 ＴＣＰ 转录因子的 ＧＯ 功能注释分析
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２０２４７ ２ ６９９ ２３２ ２
ＧＯ 功能注释分析结果表明ꎬ２４ 条 ＴＣＰ 转录
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２１５６８ ９ ６０６ ２０１ １
因子序列分别被注释到分子功能(１５ 条)、生物过
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２２７３８ ８ １ １２５ ３７４ １
程(２２ 条)和细胞组分(１８ 条)ꎮ 所有 ＴＣＰ 序列被
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２２９６４ ２ １ ００５ ３３４ １
进一步富集到 ２６ 个功能类别ꎬ其中 ＤＮＡ 结合功能
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２４２５４ ３ １ １０１ ３６６ １
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２４９２８ １ １ ６０５ ５３４ １ (１１ 个)、细胞核功能(１７ 个)、蛋白质结合功能(６
个)、转录因子活性(１３ 个)、转录调控(１２ 个)、叶
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２６１０５ ６ ９８４ ３２７ １
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２６５６８ ２ ２ １３７ ２１８ ３ 形态发生(８ 个)、细胞分化(８ 个)、发育正向调控
(８ 个)、防御反应调控(６ 个) 等功能组包含的序
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００３３０７８ ６ １ ４２５ ４１０ ２
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００４０２３２ ２ ８４０ ２７９ １
列较多ꎻ细胞大小调控(４ 个)、叶片衰老的负调控
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００４０５４ ６ ９４０ ２７９ ２
(４ 个)、叶绿体功能(３)、次生枝形成调控(３ 个)、
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００４０８２ ６ ９１８ ３０５ ２
核心启动子近端序列特异性 ＤＮＡ 结合(２)、核心
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４００００５７０５ ３ １ １３７ ３７８ １
启动子结合(２ 个)、脱落酸响应(２ 个)、营养期向
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００２４６３２ ３ １ ６４０ ３４４ １
生殖期过渡的调节(１ 个)、细胞增殖(２ 个)、细胞
ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００４５１９７ １ ８４３ ２８０ １
分裂素响应(２ 个)、赤霉素响应(２ 个)、种子休眠
结束中胚发育(２ 个)、种子萌发调控(２ 个)、花序
只 包 含 有 基 序 １ꎻ 第 四 类 只 有 １ 个 基 因
发育(２ 个)、根发育(２ 个)、生理节律调控(１ 个)
(ＰＧＳＣ０００３ＤＭＧ４０００３３０７８)ꎬ包含有基序 １、２、３ꎮ 和解剖结构形态发生(１ 个) 功能组包含的序列较
进一步分析保守的基序( ｍｏｔｉｆ) 序列特征ꎬ发现 ２４ 少ꎮ 其中ꎬ生物过程主要集中在转录调控、发育正
个 ＴＣＰ 转录因子均具有典型的 ｂａｓｉｃ－Ｈｅｌｉｘ￣Ｌｏｏｐ￣ 向调控、叶形态发生和细胞分化ꎬ细胞组分主要富
Ｈｅｌｉｘ (ｂＨＬＨ) 结构域ꎮ 集在细胞核的功能ꎬ分子功能集中在 ＤＮＡ 结合和
２.４ 马铃薯 ＴＣＰ 转录因子的蛋白进化分析 转录因子活性 (图 ３)ꎮ
为解析马铃薯 ＴＣＰ 蛋白的进化关系并预测 ２.６ 马铃薯 ＴＣＰ 转录因子在低氮肥胁迫和不同组
其功能ꎬ利用 ＭＥＧＡ ７.０.１４ 软件分析马铃薯 ＴＣＰ 织中的表达分析
家族蛋白和拟南芥 ＴＣＰ 家族蛋白( ＰｌａｎｔＴＦＤＢ 数 基于马铃薯转录组数据ꎬ获得了 ２４ 个马铃薯
据库) 的进化关系( 图 ２) ꎮ 图 ２ 结果表明ꎬ２４ 个 ＴＣＰ 转录因子在不同转录组文库中的表达量ꎬ并
马铃薯 ＴＣＰ 家族蛋白与拟南芥的 ＴＣＰ 蛋白聚集 绘制表达热图(图 ４)ꎮ 从图 ４ 可以看出ꎬ低氮肥胁
在一 起 且 分 别 归 属 于 １０ 个 亚 类ꎬ 说 明 马 铃 薯 迫处理后ꎬ ２４ 个 ＴＣＰ 转录因子在叶中虽被抑制
ＴＣＰ 家族蛋白与拟南芥 ＴＣＰ 蛋白具有比较高的 或被诱导表达但都未达到显著性差异水平ꎬ 只有