Page 43 - 《广西植物》2020年第3期
P. 43
3 期 候师师等: 海南西海岸四种真红树根系土壤放线菌物种多样性及其延缓衰老活性初筛 3 2 3
(Lakowski & Hekimiꎬ1998)ꎬ所有数据采用 SPSS Sta ̄
表 2 从根系土壤分离的 22 株可培养放线菌
tistics 17.0 进行统计分析ꎬ并用 Excel 2013 软件做
Table 2 The 22 strains of culturable actinobacteria
表、绘图ꎬ评价放线菌发酵产物延缓衰老的生物活性ꎮ
isolated from rhizosphere soil
用 M9 缓冲液将虫体洗净ꎬ离心弃去上清液ꎻ
 ̄1
以 1 ∶ 3 的比例将裂解液(1 mL 5 molL 的 NaOH 16S rRNA
基因序列
和 0.5 mL 5%的 NaClO 混匀使用) 加入虫体中ꎬ震 相似性 来源
菌株编号 相近种
16S rRNA Source
荡离心后ꎮ 分别将 20 μL 大肠杆菌发酵液、30 μL Strain code Origin sequence
线虫 pellet、150 μL M9 Buffer 加入 96 孔板的各个 identity
(%)
孔中ꎬ设置阴性对照ꎮ 置于 20 ℃ 生化培养箱中培
IMDGX 6012 Amycolatopsis lexingtonensis 97.75 1-14
养 48 h 后可得 L4 期线虫ꎮ
粗提物样品用 1% 的 DMSO 溶液超声溶解成 IMDGX 6028 A. niigatensis 98.15 1-14
浓度为 500 μgmL 药液ꎬ将培养好的 L4 期线虫 IMDGX 6118 Curtobacterium albidum 98.32 1-14
 ̄1
IMDGX 6326 C. citreum 98.44 1-14
挑至 加 有 50 μL 药 液 的 NGM 培 养 基 ( Brennerꎬ
1974)ꎬ置于 20 ℃ 生化培养箱中进行培养ꎬ每组 2 IMDGX 6119 Demequina salsinemoris 98.45 2-2
个平板ꎬ每个平板 20 条 L4 期线虫ꎬ此时培养天数 IMDGX 6131 Isoptericola jiangsuensis 99.87 1-14
记为 0 dꎮ 此后ꎬ隔天对培养的线虫进行计数ꎬ观 IMDGX 6173 Lysinimicrobium pelophilum 99.74 2-2
察并记录线虫生存、死亡及剔除的数量ꎬ将线虫转 IMDGX 6428 Microbacterium aurantiacum 98.80 1-4
移至新的培养皿ꎬ直至线虫全部死亡ꎮ
IMDGX 6137 M. saccharophilum 99.33 2-3
IMDGX 6101 Rhodococcus equi 99.49 1-3
2 结果与分析
IMDGX 6017 Sinomonas flava 99.10 1-14
IMDGX 6086 Streptomyces coelicoflavus 99.49 2-2
2.1 红树植物根系放线菌多样性分析
IMDGX 6215 S. corchorusii 99.09 7-7
根据菌落形态特征及 16S rRNA 基因序列分
IMDGX 6184 S. drozdowiczii 99.48 1-14
析结果ꎬ本研究从 7 份红树林根系土壤中共分离
鉴定得到 22 株放线菌ꎬ由 9 个属组成ꎬ隶属于 4 目 IMDGX 6014 S. fuscichromogenes 99.87 1-14
7 科ꎬ链霉菌属( Streptomyces) 分离出 11 株菌为优 IMDGX 6030 S. longwoodensis 99.49 1-14
势菌群ꎬ详细物种信息如表 2 所示ꎮ 菌株 IMDGX IMDGX 6220 S. nogalater 98.95 7-7
6012、IMDGX 6028、 IMDGX 6118、 IMDGX 6326、 IMDGX 6093 S. roseolus 99.34 7-7
IMDGX 6119 分 别 与 有 效 发 表 菌 株 Amycolatopsis IMDGX 6037 S. sundarbansensis 98.93 1-4
lexingtonensis、A. niigatensis、Curtobacterium albidum、 IMDGX 6040 S. tunisiensis 99.34 2-2
C. citreum、Demequina salsinemoris 的最高相似率为 IMDGX 6013 S. viridobrunneus 99.09 1-14
97.75%、98.15%、98.32%、98.44%、98.45%ꎮ 根据
IMDGX 6182 S. xantholiticus 100.00 1-4
放线菌 16S rRNA 基因序列相似性小于 98.65%的
菌株 属 于 潜 在 新 物 种 的 归 类 原 则 ( Kim et alꎬ
2014)ꎬ以上五株根系放线菌可能为潜在的新物 短小杆菌属( Curtobacterium)、Sinomona、链霉菌属
(Streptomyces)ꎬ分离菌株数量最多且菌属最为丰
种ꎮ IMDGX 6119 分离于白骨壤根系土壤(2-2)ꎬ
其余四株潜在新菌株均来自于红海榄根系土壤 富ꎮ 其次是从 2-2 土壤样品分离得到 4 株菌株隶
属于 3 个属ꎬ包括 Demequina、Lysinimicrobium 和链
(1-14)ꎮ
2.2 22 株放线菌在不同红树土壤样品、培养基中的 霉菌属(Streptomyces)ꎮ 而 2-1 土壤样品未分离得
分布 到放线菌ꎮ
22 株根系细菌在 7 份不同植物根系土壤样品分 7 种分离培养基对红树根系土壤放线菌分离
布情况如图 1ꎮ 从 1-14 土壤样品分离获得 10 株菌株 效果见图 2ꎮ 研究结果表明 M11 和 P3 培养基更
隶属于 4 个属ꎬ 包括拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)、 适合于海洋放线菌分选ꎬ其中从 M11 培养基共分