Page 86 - 《广西植物》2020年第7期
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9 8 2 广 西 植 物 40 卷
续表 1
氨基酸大小
基因名称 染色体定位 蛋白登录号
Peptide length
Gene name Chromosomal localization Protein accession No.
(aa)
EgWRKY85 707..1876 - XP_010911458.1 232
EgWRKY86 30951..33207 - XP_010910323.1 133
EgWRKY87 1118523..1122926 + XP_010904958.1 251
EgWRKY88 1154550..1156525 + XP_010942101.1 316
EgWRKY89 776067.. 784882 - XP_010942092.1 535
EgWRKY90 1132053.. 1196544 - XP_010943606.1 709
EgWRKY91 1056488.. 1082285 - XP_010905300.1 672
EgWRKY92 298091..311193 + XP_010906869.1 551
EgWRKY93 157052..174713 + XP_010908244.1 545
EgWRKY94 231238..253849 - XP_010908581.1 641
EgWRKY95 245494.. 250181 + XP_010908962.1 478
图 1 所示ꎮ 油棕 WRKY 蛋白主要分为三大类ꎬ即 2004)ꎬ黄瓜基因组中有 132 个 WRKY 转录因子
Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类ꎮ 其中ꎬ根据 WRKY 保守结构域所处 (谷彦冰等ꎬ2015)ꎬ棉花基因组中有 116 个 WRKY
的位置ꎬ将第 I 类分为 I N 和 I C 两个亚类ꎻ第Ⅱ类 转录因子( Dou et al.ꎬ 2014)ꎬ橡胶树基因组中含
含有 1 个锌指结构和 1 个 WRKY 保守结构域ꎬ根 有 81 个 WRKY 转录因子(Li et al.ꎬ 2014)ꎬ桑树基
据锌指结构的不同ꎬ又将其分为Ⅱ a、Ⅱ b、Ⅱ c 及 因组 中 含 有 54 个 WRKY 转 录 因 子 ( Baranwal et
Ⅱ d 四个亚类ꎻ第Ⅲ类是含有 2 个 WRKY 保守结 al.ꎬ 2016)及鹰嘴豆基因组中含有 70 个 WRKY 转
构域ꎮ 录因子(Waqas et al.ꎬ 2019)ꎮ 本研究通过分析油
2.4 油棕 WRKY 外显子及内含子 棕基因 组 数 据ꎬ 挖 掘 出 95 个 WRKY 转 录 因 子ꎬ
通过油棕基因组数据分析得到 WRKY 转录因 WRKY 家族中转录因子的数目不仅与物种的基因
子基因 外 显 子 和 内 含 子 的 结 构 分 布 示 意 图 ( 图 组相关ꎬ而且与植物在长期进化过程中所受的外
2)ꎮ EgWRKY 转录因子家族成员所含内含子数的 界环境影响有关ꎮ 油棕 WRKY 转录因子数目与其
范围为 0 ~ 12 个ꎬ平均每个 EgWRKY 含内含子数 他物种相比ꎬ属于中等数目的类型ꎬ该结果可推测
为 2.99 个ꎮ 其中ꎬEgWRKY42 含有内含子数最多 油棕在自然进化过程中ꎬWRKY 基因家族受到了
(12 个)ꎬ转录因子基因长度变化范围为 477 bp 一定的外界环境压力ꎮ
(EgWRKY08) 至 89 167 bp( EgWRKY71)ꎬ平 均 大 本研究通过预测油棕 WRKY 蛋白的二级结
小为 5 992 bpꎬ图 2 中阴影部分的数字代表该外显 构ꎬ发现其以 α ̄螺旋及无规卷曲为主ꎬ这与丁蒙蒙
子 翻 译 成 部 分 WRKY 保 守 结 构 域 的 长 度ꎮ 等(2018)报道结果相一致ꎮ 本研究对油棕 WRKY
EgWRKY 基因家族的结构变化较大ꎬ说明在长期 保守结构域进行系统进化分析ꎬ将油棕 WRKY 家
进化过程中油棕基因组经历了较大的变异选择ꎮ 族蛋白分为三大类ꎬ即 I、Ⅱ、Ⅲ类ꎬ其中Ⅱ类又分
为四个亚类ꎮ 本研究中油棕 95 个 WRKY 家族成
3 讨论与结论 员均含有 WRKYGQK 保守基序ꎬⅡ类均含有 1 个
锌指结构及 1 个 WRKY 保守结构域ꎬ根据锌指结
随着高通量测序技术的成熟ꎬWRKY 作为调 构和位置的不同又分为四个亚类ꎬ类似分类在拟
控植物多种生理过程的转录因子家族之一ꎬ已在 南芥及 桑 树 等 物 种 中 发 现ꎬ 该 结 果 可 推 测 植 物
多个物种中被挖掘及鉴定ꎬ如拟南芥基因组中含 WRKY 基因家族在结构上具有高度保守性ꎮ 油棕
有 72 个 WRKY 转 录 因 子 ( Ulker & Somssichꎬ 作为热带地区重要的油料作物之一ꎬ 低温气候严