Page 53 - 《广西植物》2021年第4期
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毕艳ᖔ 郑伟ᖔ 周涛ᖔ 等 太子参谷胱甘肽᥋୩᥋转移酶基因家族生物信息学及表达分析 ЏȮ 广西植物ᖔ ԡϟᖔ ࿗ϟྉ࿗ɯ᧥ ጢሕጢͱጢ࿗ጢ
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太子参谷胱甘肽转移酶基因家族
生物信息学及表达分析
毕জ 艳 ᕷ 郑জ 伟 ᕷ 周জ 涛 ᕷ 江维克 ᕷ 杨昌贵 ᕷ 肖承鸿 ᕷ 周太敏 ϟ
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ྉϟ 贵州中医药大学ᖔ 贵阳 ጢጢԡԡጢଫ 天津中医药大学ᖔ 天津 ሕԡԡϟँሕ ɯ
摘জ 要ᧅ ᥈୩ఋ༁ ྉ੫ࣼᡷᑕᡷၤᔽᆍႿᔀ᥋୩᥋ᡷʢᑕႿ༁ᔀʢᑕ༁ᔀ༁ɯ是一个普遍存在于植物体内ᖔ多基因家族编码的多功能蛋白酶ᤥ
为研究 ᤩ௴ 基因家族在太子参中对其生长发育以及活性成分合成调控的潜在功能ᖔ该文基于隐马尔可夫
模型在太子参中鉴定到 ሕԡ 个谷胱甘肽᥋୩᥋转移酶ྉۗ၊ᤩ௴ɯ 的基因家族成员ᤥ 结果表明᧥ሕԡ 个 ۗ၊ᤩ௴ 基因
同时具有高度保守的 શ᥋端结构域和复杂多变的 ऊ᥋端结构域ᖔ分属于 ᤃ 个亚家族ᖔ有 ϟԡ 个 ቝᆍᡷᔽ 区ᖔ其中 ቝᆍᡷᔽ
ϟܦቝᆍᡷᔽ ܦቝᆍᡷᔽ ሕ 同属于所有家族ᖔቝᆍᡷᔽ ࿗ 仅属于 ఋࣼᑕ 亚家族ᤥ۪ၤ᥈୩ఋ 蛋白质三级结构有明显的相似之处ᖔશ
端主要由 ሕ 个 ም 螺旋和 ࿗ 个 Ꮗ 折叠构成 ᏇምᏇምᏇᏇም 结构域ᖔऊ 端均由 ም 螺旋构成ᖔ不同亚家族的 ऊ 端 ም 螺旋
数目及组合方式各不相同ᖔ但始终维持相似的三维结构ᤥ ۗ၊ᤩ௴ 基因在太子参植物中具有不同的组织表达
特异性ᖔۗ၊ᤩ௴Іϟܦۗ၊ᤩ௴Іऐܦۗ၊ᤩ௴Іँ 等在太子参块根中优势表达ᖔۗ၊ᤩ௴Þ 在茎和叶中优势表达ᤥ 水分
胁迫处理后有 ࿗ 个基因积极响应干旱胁迫ᖔۗ၊ᤩ௴Ԯϟ 的响应最为明显ଫ同时也有 ۗ၊ᤩ௴Іऐܦۗ၊ጛÞଧϟᤶሕ 等 ࿗
个基因随土壤含水量增加呈上调表达ᤥ 该文鉴定出 ሕԡ 个 ۗ၊ᤩ௴ 基因ᖔ并分析了其在太子参中的表达模式ᖔ
为 ۗ၊ᤩ௴ 基因家族在太子参活性成分的合成调控及逆境响应等生理过程中的功能研究奠定理论基础ᤥ
关键词ᧅ 太子参ᖔ᥈୩ఋ༁ᖔ 基因家族ᖔ 生物信息学分析ᖔ 表达分析
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ϟজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡϟɯԡ࿗᥋ԡጢሕጢ᥋ϟϟ
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收稿日期ᧅ ԡԡͱԡጢͱϟँ
基金项目ᧅ 国家自然科学基金ྉऐϟ࿗ᤃԡጢᎮँɯଫ贵州省科技创新人才团队项目ྉ黔科合平台人才 Џԡϟँጢᤃϟϟɯଫ贵州省高层次创新型人
才ྉ黔科合平台人才 Џԡϟऐጢᤃሕऐɯଫ现代农业产业技术体系建设专项ྉऊዶ୩᥋ϟɯଫ名贵中药资源可持续利用能力建设项目ྉԡᤃԡሕԡɯ
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作者简介ᧅ 毕艳ྉϟँँ࿗ͱɯᖔ硕士研究生ᖔ研究方向为中药及民族药资源分类鉴定与质量控制研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯϟᤃϟϟጢऐϟँሕ݀ ीीዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 周涛ᖔ教授ᖔ研究方向为中药资源学ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯᡷᑕᆍझၤᆍࣼऐऐ݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ