Page 57 - 《广西植物》2021年第4期
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࿗ 期 毕 艳 等 ᧥ 太子参谷胱甘肽᥋୩᥋转移酶基因家族生物信息学及表达分析 ጢ ሕ ँ
ዛ ۗ၊ᤩ௴ 基因家族的系统进化树分析ᖔ采用 ᥘጶ᥈ዶᎮԡ 软件利用邻位相连法ྉશȮɯ 构建系统进化树ᖔ不同颜色表示不同亚家族ଫ
ଧ ۗ၊ᤩ௴ 基因家族的 ቝᆍᡷᔽ 分析ᖔ利用 ᥘጶᥘጶ 分析 ۗ၊ᤩ௴ 基因家族的 ቝᆍᡷᔽᖔ不同颜色的模块表示不同的 ቝᆍᡷᔽᤥ
ዛ ۪ၤᢃᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᡷʢᔀᔀ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ۗ၊ᤩ௴ ੫ᔀႿᔀ ᑕቝᔽᢃᖔ ᥘጶ᥈ዶᎮԡ ༁ᆍᡷऔᑕʢᔀ औᑕ༁ ࣼ༁ᔀʛ ᡷᆍ ዹᆍႿ༁ᡷʢࣼዹᡷ ᡱၤᢃᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᡷʢᔀᔀ ࣼ༁ᔽႿ੫ Ⴟᔀᔽ੫ၤᤦᆍʢ ᢼᆍᔽႿᔽႿ੫ ྉશȮɯ
ቝᔀᡷၤᆍʛ ᧕ᔽᔀʢᔀႿᡷ ዹᆍᆍʢ༁ ᔽႿʛᔽዹᑕᡷᔀʛ ʛᔽᔀʢᔀႿᡷ ༁ࣼᤦᑕቝᔽᔽᔀ༁ଫ ଧ ᥘᆍᡷᔽ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ۗ၊ᤩ௴ ੫ᔀႿᔀ ᑕቝᔽᢃᖔ ࣼ༁ᔽႿ੫ ᥘጶᥘጶ ᡷᆍ ᑕႿᑕᢃझᔀ ቝᆍᡷᔽ ᆍ ۗ၊ᤩ௴ ੫ᔀႿᔀ
ᑕቝᔽᢃᖔ ʛᔽᔀʢᔀႿᡷ ዹᆍᆍʢ ቝᆍʛࣼᔀ༁ ʢᔀᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷ ʛᔽᔀʢᔀႿᡷ ቝᆍᡷᔽ༁
图 ϟজ ሕԡ 种 ۪ၤ᥈୩ఋ 蛋白的系统发育关系ܦቝᆍᡷᔽ 分析
èᔽ੫ϟ ۗᓣࣩʐᅳᡙᓣᤀᤀᐹʗᔠᐹ ၊ᓣᡙᓣʗᅳᡓ၊ᡥᤀᤀᐹ ʢᔀᑕᡷᔽᆍႿ༁ၤᔽᡱ ᑕႿʛ ቝᆍᡷᔽ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ሕԡ ۪ၤ᥈୩ఋ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ༁
个 ఋࣼᑕ 类ܦᎮ 个 ۪ၤᔽ 类ܦ࿗ 个 ጶèϟାᥕ 类ܦሕ 个 Իᔀᡷᑕ 类ܦ શܦ᥈୩ఋ᥋શሕܦ᥈୩ఋ᥋ऊܦ᥈୩ఋ᥋ऊܦ᥈୩ఋ᥋ऊሕ 等多个保守
个 ᓂᑕቝᤦʛᑕ 类ܦϟ 个 ᧕̀ዶ 类 ྉ 图 ϟ᧥ ዶɯᤥ 利用 结构域ᤥ᥈୩ఋ᥋શ 结构域高度保守ྉ 图 ሕ᧥ዶɯᖔ结构
ᥘጶᥘጶ 对 ሕԡ 个 ۗ၊ᤩ௴ 基因的 ቝᆍᡷᔽ 进行预测ᖔ结 域为 ᥈୩ఋ᥋શ 的仅有 ఋࣼᑕ 类ᖔ结构域为 ᥈୩ఋ᥋શ 的有
果显示每个亚家族中 ቝᆍᡷᔽ 的排列是相似的ᖔ但不 ጶèାϟᥕ 和 ᧕̀ዶ 个亚家族ᖔ结构域为 ᥈୩ఋ᥋શሕ 的
同亚家族 中 ቝᆍᡷᔽ 的排列不同 ྉ 图 ϟ᧥ାɯᤥ 其中ᖔ 有 ۪ၤᔽܦᓂᑕቝᤦʛᑕܦԻᔀᡷᑕ ሕ 个亚家族ଫऊ 端结构域变异
ቝᆍᡷᔽ ϟܦቝᆍᡷᔽ ܦቝᆍᡷᔽ ሕ 同属于所有家族ᖔቝᆍᡷᔽ ᤃܦ 较大ྉ图 ሕ᧥ାɯᖔ结构域为 ᥈୩ఋ᥋ऊ 的有 ఋࣼᑕ 和 ۪ၤᔽ 两
ቝᆍᡷᔽ Ꭾܦቝᆍᡷᔽ ऐܦቝᆍᡷᔽ ँܦቝᆍᡷᔽ ϟԡ 为 ۪ၤᔽ 和 ጶèାϟᥕ 家 个亚 家 族ᖔ 结构域为 ᥈୩ఋ᥋ऊ 的有 ఋࣼᑕܦ ጶèϟାᥕܦ
族特有ᖔቝᆍᡷᔽ ࿗ 为 ఋࣼᑕ 家族特有ᤥ 进一步比较太子 ᓂᑕቝᤦʛᑕܦ᧕̀ዶ ࿗ 个亚家族ᖔ结构域为 ᥈୩ఋ᥋ऊሕ 的
参与甜菜ܦ拟南芥ܦ水稻中 ᥈୩ఋ 蛋白的系统发育关 有 ۪ၤᔽܦጶèϟାᥕܦԻᔀᡷᑕ ሕ 个亚家族ᤥ
系ᖔ发现所有植物的 ᥈୩ఋ 蛋白聚为 ϟ 大支ᖔఋࣼᑕ 是 预测 ۪ၤ᥈୩ఋ 蛋白三级结构的结果见图 ࿗ᤥ 从
࿗ 种植物中最大的一个亚家族ᖔ占每个植物 ᤩ௴ 基 图 ࿗ 可以看出ᖔ相似之处包括 શ 端与 ऊ 端 个主
因总数的一半以上ᖔఋၤᔀᡷᑕ 和 ᧕̀ዶ 在所有植物中 要的结构域ᤥશ 端主要包括 ሕ 个 ም 螺旋和 ࿗ 个 Ꮗ
数量均较少ᖔ在太子参中尚未鉴定出 ఋၤᔀᡷᑕ 家族的 折叠结构ᖔም 螺旋和 Ꮗ 折叠的连接顺序为
成员ᖔ᧕̀ዶ 家族仅鉴定到 ϟ 个基因ྉ图 ɯᤥ ᏇምᏇምᏇᏇምᖔ构成 ᏇምᏇምᏇᏇም 结构域ଫ随后通过一个
ԣॹᇺ ۗ၊ᤩ௴ 蛋白保守域序列分析 短 的 多肽连接 ऊ 端ᖔऊ 端全部为 ም 螺旋ᤥ 以
图 ሕ 结果表明ᖔ۪ၤ᥈୩ఋ 家族存在 ᥈୩ఋ᥋શܦ᥈୩ఋ᥋ ۪ၤ᥈୩ఋВϟܦ۪ၤ᥈୩ఋèϟܦ۪ၤጶèϟାᥕϟܦ۪ၤ᥈୩ఋᓂϟܦ۪ၤ᧕̀ዶܦ
