Page 131 - 《广西植物》2021年第7期

ϟ ϟ ᤃ ԡ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷

ϓ঎᧕ᓂ԰ԡԡԡ ᥘᑕʢҴᔀʢଫ ԣ঎ 空载体菌液ଫ ᇺ ጲ ࣮঎ 融合 表达载体
菌液ᤥ
ϓ঎᧕ᓂ԰ԡԡԡ ᥘᑕʢҴᔀʢଫ ԣ঎ ጶቝᡱᡷᢃ ዹᑕʢʢᔽᔀʢ ᤦᑕዹᡷᔀʢᔽᑕ ᤟ᔽीࣼᔽʛଫ
ϓ঎ 蛋白 ᥘᑕʢҴᔀʢଫ ԣ঎ᡱጶఋሕ԰ᤦ᥋Þۗۗ୒ 未诱导全菌ଫ ᇺ঎ϟ঎ ԡ
ᇺͱ࣮঎ ାᑕዹᡷᔀʢᔽᑕ᤟ ஦᤟ࣼᔽʛ ዹᆍႿᡷᑕᔽႿᔽႿ੫ ஦ࣼ༁ᔽᆍႿ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ׹ᔀዹᡷᆍʢ঎
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图 ࿗জ 菌液 ۪ऊ኏ 验证结果 淀ଫ ጇ঎ԡ঎Ꭾጢ ቝቝᆍ᤟ኼᓂ ᧧۪ఋ᥈ 诱导上清ଫ ᣤ঎ ԡ঎Ꭾጢ ቝቝᆍ᤟ኼᓂ ᥋ϟ
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清ଫ ϓԔ঎ ԡ঎԰ጢ ቝቝᆍ᤟ኼᓂ ᧧۪ఋ᥈ 诱导沉淀ᤥ
左右ᖔ从图 ጢ 可明显看出ᖔ融合蛋白没有在上清表 ϓ঎ ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ ᥘᑕʢҴᔀʢଫ ԣ঎ᡱጶఋሕ԰ᤦ᥋Þۗۗ୒ ࣼႿᔽႿʛࣼዹᔀʛ औၤᆍ᤟ᔀ ᤦᑕዹᡷᔀʢᔽᑕ᤟
达ᖔ而是以包涵体形式存在于沉淀ᤥ 在 ԰ԡ ቩ 不同 ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿଫ ᇺ঎ ϟ঎ ԡ ቝቝᆍ᤟ ኼ ᓂ ᧧۪ఋ᥈ ᔽႿʛࣼዹᔀʛ ༁ࣼᡱᔀʢႿᑕᡷᑕႿᡷ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿଫ
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浓度 ᧧۪ఋ᥈ 诱导下可看出ᖔ融合蛋白在的表达量没 ྽঎ϟ঎ ԡ ቝቝᆍ᤟ ኼ ᓂ ᧧۪ఋ᥈ ᔽႿʛࣼዹᔀʛ ᡱʢᔀዹᔽᡱᔽᡷᑕᡷᔀʛ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿଫ ጇ঎ԡ঎ Ꭾጢ
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有显著差异ᤥ
᧧۪ఋ᥈ ᔽႿʛࣼዹᔀʛ ᡱʢᔀዹᔽᡱᔽᡷᑕᡷᔀʛ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿଫ ᎒঎ԡ঎ ጢ ቝቝᆍ᤟ ኼ ᓂ ᥋ϟ ᧧۪ఋ᥈
ᇺॹጇ 生物信息学分析
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Þۗۗ୒ 基因的开放阅读框全长为 ϟ ԡጢԡ ᤦᡱᖔ编码 ᡱʢᔀዹᔽᡱᔽᡷᑕᡷᔀʛ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿଫ ࣮঎ ԡ঎԰ጢ ቝቝᆍ᤟ኼᓂ ᧧۪ఋ᥈ ᔽႿʛࣼዹᔀʛ ༁ࣼᡱᔀʢႿᑕᡷᑕႿᡷ
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ሕ࿗ँ 个氨基酸ᤥ 与其他 ᤃϟ 种植物的 Þۗۗ୒ 氨基酸序 ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿଫ ϓԔ঎ ԡ঎԰ጢ ቝቝᆍ᤟ኼᓂ ᧧۪ఋ᥈ ᔽႿʛࣼዹᔀʛ ᡱʢᔀዹᔽᡱᔽᡷᑕᡷᔀʛ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ঎
列的系统发育树表明ᖔ广藿香的 Þۗۗ୒ 氨基酸序列 图 ጢজ è۪۪୩ 蛋白小量表达电泳图
与同为唇形科的丹参和撒尔维亚氨基酸序列的亲 èᔽ੫঎ ጢজ ୩ቝᑕ᤟᤟ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ᔀ᤟ᔀዹᡷʢᆍᡱၤᔀʢᆍ੫ʢᑕቝ ᆍ஦ è۪۪୩ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ
缘关系最近ᖔ聚为一支ᖔ可信度为 ऐ࿗ᠮᖔ它们与杜仲
科ܦ毛茛科ܦ龙胆科ܦ兰科植物聚为一大类ଫ其他植 使用 ୩ᥘዶ኏ఋ 在线软件预测 Þۗۗ୒ 基因编码蛋
物大都以同科属聚为一类ᤥ 具体如图 ᤃ 所示ᤥ 白的结构域ᖔ结果发现 Þۗۗ୒ 有一个结构域ᖔ包含
Þۗۗ୒ 基因编码的蛋白质的分子量为 ࿗ԡ ᣽᧕ᖔ ԰ᤃᤃ 个氨基酸残基ᖔ从 ሕँ 至 ሕԡ࿗ྉᑕᑕ 序列ɯᖔ可能参
等电点为 ጢ঎࿗ሕᤥ 氨基酸组成中ᖔ酸性氨基酸ྉዶ༁ᡱᖔ 与异戊二烯化合物的合成ᤥ
᥈᤟ࣼɯ占 ϟ࿗঎ϟᠮᖔ碱性氨基酸ྉᓂᢃ༁ᖔዶʢ੫ɯ占 ϟϟ঎Ꭾᠮᖔ极 使用 ୩ᔽ੫Ⴟᑕ᤟۪ ጢ঎ԡ 预测 è۪۪୩ 蛋白不具有脂蛋
性氨基酸ྉ ዶ༁Ⴟᖔऊᢃ༁ᖔ᥈᤟Ⴟᖔ ୩ᔀʢᖔఋၤʢᖔఋᢃʢɯ 占 ԰ᤃᠮᖔ疏 白信号肽ྉ୩ᔀዹ ᣰ ୩۪ ֒ɯܦఋᑕᡷ 信号肽ྉఋᑕᡷᣰ ୩۪᧧ɯ 或其
水氨基酸占 ሕጢ঎԰ᠮᖔ负电荷残基占 ࿗ँᠮᖔ正电荷残 他信号肽ᤥ
基占 ࿗ϟᠮᤥ 脂肪系数为 ँϟ঎ ऐँᖔ 不稳定系数为 采用 ୩ۼ᧧୩୩᥋ᥘᨃ᧕ጶᓂ 软件对 è۪۪୩ 蛋白进行同
ሕ࿗঎࿗Ꭾᖔ在酵母体内半衰期大于 ԰ԡ ၤᖔ在大肠杆菌体 源建模ᖔ以单萜合酶 è᧕୩᥋ጢ 和叶绿体ͱ法尼基焦磷
内大于 ϟԡ ၤᖔ推测其蛋白质 比 较 稳 定ᤥ ఋᥘ̀ᥘᥘ 酸合酶 ϟ 的嵌合体ྉ ୩ᥘఋᓂ ᧧᧕ ᧥ ࿗ҴҴ԰঎ ϟᖔ相识度᧥
԰঎ԡ 预测蛋白全部位于膜外ᖔ无跨膜区域ᤥ 使用 Ꭾጢ঎ᤃᤃᠮɯ为模板蛋白ᖔ构建 è۪۪୩ 蛋白三级结构模
۪୩ᨃ኏ఋ֒在线软件预测亚细胞定位于细胞质ᤥ 型ᤥ᥈ᥘ͐ጶ 值ྉ ᥈᤟ᆍᤦᑕ᤟ ᥘᆍʛᔀ᤟ ͐ࣼᑕ᤟ᔽᡷᢃ ጶ༁ᡷᔽቝᑕᡷᔽᆍႿɯ 为
୩ᨃ۪ᥘዶ 预测 Þۗۗ୒ 氨基酸序列共有 ࿗ 种二级 ԡ঎ऐᤃྉ᥈ᥘ͐ጶ 评分区间为 ԡጲϟᖔ越靠近 ϟ 表示模型
结构ᤥ 其中᧥ም 螺旋氨基酸有 ԰ϟ࿗ 个ᖔ占氨基酸总 越可 靠 ɯଫ ͐ᥘጶዶશ 值 ྉ ͐ࣼᑕ᤟ᔽᡷᑕᡷᔽ׹ᔀ ᥘᆍʛᔀ᤟ ጶႿᔀʢ੫ᢃ
数的 ᤃϟ঎ሕ԰ᠮଫ参与链延伸的氨基酸ᖔ有 ԰ጢ 个ᖔ占 ዶႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ɯ为ͱԡ঎ሕጢྉ͐ᥘጶዶશ 值在 ԡ 附近ᖔ表明模型
Ꭾ঎ϟᤃᠮଫᏇ 转角氨基 酸 有 ँ 个ᖔ 占氨基酸总数的 结构与相似尺寸的实验结构具有良好的一致性ᤥ
԰঎ጢऐᠮଫ无规则卷曲有 ϟԡϟ 个氨基酸参与ᖔ占氨基 ͱ࿗঎ԡ 或以下的分数表示模型质量较差ɯᖔ从两个值

酸总数的 ԰ऐ঎ँ࿗ ᠮᤥ 具体如图 Ꭾ 所示ᤥ 可以看出构建的 ሕ᧕ 模型比较可靠ᖔ可以较好预测