Page 125 - 《广西植物》2022年第10期
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10 期 陈丽琼等: 质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系 1 7 4 3
表 1 旋花科新测序物种的凭证信息和质体基因组特征
Table 1 Voucher information and plastome features of newly sequenced within Convolvulaceae
质体 LSC 区 SSC 区 蛋白质
基因组 编码基因 GC 含量
测序编号 长度 长度 IR 区长度
族 物种 凭证标本 大小 含量 GC
Sequencing LSC SSC IR length
Tribe Species Voucher Plastome Protein content
code length length (bp)
size coding (%)
(bp) (bp)
(bp) gene content
心被藤族 白飞蛾藤 蔡杰等ꎬ KUNꎬ S08256 150 529 85 700 13 901 26 815 79 37.8
Cardiochlamyeae Dinetus decorus 15CS11317
毛果飞蛾藤 李永亮等ꎬ KUNꎬ S03014 148 628 85 092 13 394 29 081 79 37.7
D. truncatus YDDXSB107
搭棚藤 张挺等ꎬ KUNꎬ S08786 150 099 84 741 14 464 27 990 79 37.5
Porana discifera 13CS5909
搭棚藤 刘成等ꎬ KUNꎬ S04552 150 536 84 987 14 382 28 081 79 37.7
Poranopsis discifera 13CS6343
大果三翅藤 张挺等ꎬ KUNꎬ J1596 146 436 86 731 15 116 26 674 79 37.7
Tridynamia sinensis 12CS4137
旋花族 欧旋花 蔡杰等ꎬ KUNꎬ S08092 152 132 88 373 13 970 28 948 79 38.2
Convolvuleae Calystegia sepium 14CS9533
肾叶打碗花 卞福花ꎬ KUNꎬ S01846 152 365 88 433 13 542 28 100 78 37.8
C. soldanella FH ̄0201
盐帚花族 美丽须帽藤 张挺等ꎬ KUNꎬ S09440 135 178 82 905 13 859 28 117 78 37.5
Cresseae Bonamia spectabilis 17CS16107
短梗土丁桂 蔡杰等ꎬ KUNꎬ S09953 151 345 86 158 10 747 26 705 78 38.1
Evolvulus nummularius 15CS10736
菟丝子族 金灯藤 董栓录等ꎬ KUNꎬ J5004 120 873 75 280 3 087 26 005 66 38.3
Cuscuteae Cuscuta japonica TianXH521
大花菟丝子 陆露等ꎬ KUNꎬ S02785 119 875 74 852 13 900 27 586 66 37.8
C. reflexa WH ̄2013 ̄223
马蹄金族 马蹄金 易思荣ꎬ KUNꎬ S02993 164 112 86 587 3 344 25 500 79 38.1
Dichondreae Dichondra micrantha YiSR347
丁公藤族 锈毛丁公藤 张挺等ꎬ KUNꎬ S03267 113 273 71 518 14 980 26 589 79 38.9
Erycibeae Erycibe expansa 09CS1270
锥序丁公藤 亚吉东等ꎬ KUNꎬ J6082 123 094 72 875 11 476 26 751 79 39.5
E. subspicata 14CS9371
番薯族 灰毛白鹤藤 亚吉东等ꎬ KUNꎬ S07996 162 979 88 626 16 678 27 586 79 40.0
Ipomoeeae Argyreia osyrensis 15CS11494
var. cinerea
亮叶银背藤 张挺等ꎬ KUNꎬ S10321 158 269 84 851 13 673 27 809 79 37.7
A. splendens 08CS937
苞叶藤 亚吉东等ꎬ KUNꎬ S09427 161 878 88 273 15 348 27 273 79 40.1
Blinkworthia 17CS16596
convolvuloides
猪菜藤 蔡杰等ꎬ KUNꎬ S03558 153 016 87 991 11 371 22 409 79 37.2
Hewittia malabarica 13CS7249
毛果薯 蔡杰等ꎬ KUNꎬ S08462 153 621 88 896 13 765 27 252 79 39.0
Ipomoea eriocarpa 15CS11308
鱼黄草族 海南山猪菜 杨秀森等ꎬ KUNꎬ J3942 145 413 83 744 13 590 26 925 79 38.3
Merremieae Merremia hainanensis LWX10031
山土瓜 王红等ꎬ KUNꎬ J5226 154 887 88 860 14 640 28 432 79 37.7
M. hungaiensis WH ̄2012 ̄0696
山猪菜 杨秀森等ꎬ KUNꎬ J1792 152 502 88 178 14 354 27 772 79 37.7
M. umbellata 12CS4918
地旋花 张挺等ꎬ KUNꎬ J8001 154 245 88 615 14 521 28 258 79 37.7
Xenostegia tridentata 15CS10987
注: 表示该序列为使用 LASTZ 手动拼接成环的样品ꎮ
Note: represents manually assembling sequence via using LASTZ.