Page 130 - 《广西植物》2022年第10期
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Clade I 和 Clade Ⅱ互为姊妹关系ꎬ然后与菟丝子族 支持率很低ꎬ分支之间的关系存在很多不确定性ꎮ
聚在一起ꎮ 此结果明显优于之前基于基因片段的 因此ꎬ对于鱼黄草属的重新修订还需要更深入的
研究ꎬ如 Stefanovi 和 Olmstead( 2004) 基于多基因 研究ꎬ特别是特有种的收集和新的基因组数据的
片段分析结果显示ꎬ菟丝子族、Clade I 和 Clade Ⅱ 使用ꎮ
聚在 一 起 形 成 “ 梳 齿” 结 构ꎮ 随 后ꎬ McNeal 等 致谢 感谢中国西南野生生物种质资源库大
(2007)使用 ML 和 BI 法基于质体和核基因片段联 科学工程项目对本研究的支持并提供旋花科的分
合矩阵的结果支持 Clade I 是菟丝子族的姊妹群ꎬ 子材料ꎻ感谢中国科学院西双版纳热带植物园公
但该结果仅得到 rps2 基因矩阵支持ꎮ 值得注意的 共技术服务中心超算平台的支持ꎮ
是ꎬMcNeal 等(2007)研究表明ꎬrbcL 基因矩阵的结
果与本研究的 LSC 矩阵均支持 Clade Ⅱ和菟丝族
可能为姊妹类群ꎬ且拓扑结构冲突检测的结果无 参考文献:
法拒绝此拓扑结构ꎮ 因此ꎬ以上这些关系的冲突
ALEXANDROS Sꎬ 2014. RAxML version 8: a tool for
不仅揭示取样不同的分子数据对菟丝子属系统位 phylogenetic analysis and post ̄analysis of large phylogenies
置的影响ꎬ而且表明若想进一步探讨菟丝子族系 [J]. Bioinformaticsꎬ 30(9): 1312-1313.
AUSTIN DFꎬ 1973. The American Erycibeae (Convolvulaceae):
统位置ꎬ核基因组数据不可或缺ꎮ
Maripaꎬ Dicranostylesꎬ and Lysiostyles I. Systematics [J]. Ann
3.3 鱼黄草族的多系性 Mo Bot Gardꎬ 60(2): 306-412.
鱼黄草族的多系性在以往的研究中多有报道 AUSTIN DFꎬ 1998. Biodiversity & taxonomy of tropical
flowering plants [M]. Calicut: Mentor Books: 201-234.
( Stefanovi et al.ꎬ 2003ꎻ Stefanovi & Olmsteadꎬ
BAILLON Hꎬ 1891. Histoire des plantes [M]. Paris: LiBrairie
2004)ꎬ尤 其 是 其 中 的 鱼 黄 草 属 ( Simões et al.ꎬ Hachett and Cie: 305-331.
2015)ꎮ 依据单系性的标准ꎬ传统概念的鱼黄草族 BENTHAM Gꎬ HOOKE JDꎬ 1873. Genera plantarum [ M].
London: Lovell Reeve & Co: 865-881.
得到一定修订ꎬ被移出的属种多归入到白衫藤族ꎬ
BRUMMIT RKꎬ STAPLES GWꎬ 2007. Flowering plant families
但番薯族仍嵌套在广义鱼黄草族内ꎮ 此外ꎬ由于
of the world [M]. Kew: Royal Botanic Gardens.
还有一些鱼黄草属的种分散在鱼黄草族外ꎬ因此 CHOISY JDꎬ 1834. Convolvulaceae orientalis [ J]. Mem Soc
Phys Hist Nat Geneveꎬ 6: 383-502.
重新修订过的鱼黄草族仍非单系( Stefanovi et al.ꎬ
' 2009. Cuscuta jepsonii
COSTEA
Mꎬ
STEFANOVIC Sꎬ
2003)ꎮ Stefanovi 和 Olmstead(2004) 采用 10 个单
(Convolvulaceae): an invasive weed or an extinct endemic?
基因片段联合矩阵结果显示ꎬ番薯族先嵌套在广
[J]. Am J Botꎬ 96(9): 1744-1750.
义鱼黄草族中ꎬ它们与旋花族共同构成的分支再 DARLING ACꎬ MAU Bꎬ BLATTNER FRꎬ et al.ꎬ 2004.
Mauve: multiple alignment of conserved genomic sequence
与白衫藤族构成姊妹群 关 系ꎮ Simões 等 ( 2015)
with rearrangements [J]. Genome Resꎬ 14(7): 1394-1403.
进行广泛取样ꎬ基于核糖体 ITS 和叶绿体 matK、
DUMORTIER Bꎬ 1829. Analyse des plantes [ M ]. Paris:
rps16 和 trnL ̄F 基因联合矩阵分析表明鱼黄草族确 Tournay.
非单系ꎬ尤其是鱼黄草属分成了 10 个分支ꎬ且番 GITZENDANNER MAꎬ SOLTIS PSꎬ WONG GKꎬ et al.ꎬ
2018a. Plastid phylogenomic analysis of green plants: A
薯族仍嵌套在广义鱼黄草族中ꎮ 因此ꎬSimões 和
billion years of evolutionary history [J]. Am J Botꎬ 105(3):
Staples(2017)提议废弃鱼黄草族的划分ꎬ改用分 291-301.
支的概念ꎬ并把一些鱼黄草属的种划入其他属或 GITZENDANNER MAꎬ SOLTIS PSꎬ YI TSꎬ et al.ꎬ 2018b.
建立新属ꎬ这些处理还需更多证据的支持ꎮ 我们 Plastome phylogenetics: 30 years of inferences into plant
evolution [J]. Adv Bot Resꎬ 85: 293-313.
基于质体基因组系统发育分析结果显示ꎬ虽然旋 HARRIS RSꎬ 2007. Improved pairwise alignmnet of genomic
花族和番薯族分别形成单系群位于 Clade Ⅱ中ꎬ但 DNA [ D ]. Pennsylvania: The Pennsylvania State
鱼黄草族分成了 3 个分支ꎬ其中海南山猪菜和五 University: 74.
HIDETOSHI Sꎬ MASAMI Hꎬ 1999. Multiple comparisons of log ̄
叶鱼黄藤分别与旋花族和番薯族聚在一起ꎮ 质体
likelihoods with applications to phylogenetic inference
系统发育基因组分析结果与 Simões 等(2015)的研 [J]. Mol Biol Evolꎬ 16(8): 1114-1116.
究结果有一些出入ꎬ可能是取样偏差、基因数据量 HUELSENBECK PJꎬ RONQUIST Fꎬ 2001. MRBAYES:
Bayesian inference of phylogenetic trees [J]. Bioinformaticsꎬ
差异大、地区特有种等原因造成系统发育推断的
17(8): 754-755.
分歧ꎮ 同时ꎬSimões 等(2015) 的系统树主干分支 JIN JJꎬ YU WBꎬ YANG JBꎬ et al.ꎬ 2020. GetOrganelle: a fast