Page 25 - 《广西植物》2022年第11期

ϟϟ 期 李斌等᧥ 环境变化对水稻 ᅳ໧ஏ၊ϟ 突变体成蛋白家族表达的影响 ϟ ऐ ϟ Ꭾ
ԣॹᇺ 水稻成蛋白生物信息分析
ी኏ఋ᥋۪ऊ኏ 分析表明不同环境处理 ᅳ໧ஏ၊ϟ 突变
体导致其体内成蛋白基因家族 ᧣໧Þ̵ϟᤃܦ᧣໧Þ̵ϟᎮ
表 达量被改 变ᤥ 基于代偿理论ᖔ 我们认为
᧣໧Þ̵ϟᤃܦ᧣໧Þ̵ϟᎮ 可能参与不同环境因素处理下
ᅳ໧ஏ၊ϟ 表型恢复过程ᤥ 通过生物信息学对水稻成蛋
白的结构ܦ功能可能受到的调控以及 ᧣໧Þ̵ϟᤃ 和
᧣໧Þ̵ϟᎮ 是否可能参与根毛生长发育的调控和水
稻成蛋白家族可能的功能进行了分析ᤥ
԰঎ሕ঎ϟ 水稻成蛋白结构域预测ܓ序列比对与进化分
析জ 蛋白可能行使的功能与其蛋白的结构密切相
关ᖔ因此基于课题组未发表数据鉴定的 ϟᎮ 个水稻
相对变化率为 ᅳ໧ஏ၊ϟ 和野生型根部 ᧣໧Þ̵໧ 家族在 ϟᣰ ԰ ᥘ୩ 固
成蛋白家族成员ᖔ分析其可能的功能ᖔ利用生物信
体培养ྉ୩ऊɯ 处理下的表达量比上 ϟᣰ ԰ ᥘ୩ 液体培养ྉᓂऊɯ
处理下的表达量的比值ᤥ 息技术对水稻中成蛋白保守蛋白结构域以及基序
኏ᔀ᤟ᑕᡷᔽ׹ᔀ ዹၤᑕႿ੫ᔀ ʢᑕᡷᔀ ᔽ༁ ᡷၤᔀ ᧣໧Þ̵໧ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ༁ ᆍ஦ ᡷၤᔀ ᅳ໧ஏ၊ϟቝࣼᡷᑕႿᡷ 进行了比较分析ྉ 图 ࿗ɯᤥ 本研究结果表明ᖔ水稻
ᑕႿʛ औᔽ᤟ʛ᥋ᡷᢃᡱᔀ ʢᆍᆍᡷ ࣼႿʛᔀʢ ϟᣰ ԰ ᥘ୩ ༁ᆍ᤟ᔽʛ ዹࣼ᤟ᡷࣼʢᔀ ᡷʢᔀᑕᡷቝᔀႿᡷ ྉ୩ऊɯ
成蛋白家族成员高度保守ᖔ且都具有 è̀԰ 关键结
ዹᆍቝᡱᑕʢᔀʛ ᡷᆍ ᡷၤᆍ༁ᔀ ࣼႿʛᔀʢ ϟᣰ ԰ ᥘ୩ ᤟ᔽीࣼᔽʛ ዹࣼ᤟ᡷࣼʢᔀ ᡷʢᔀᑕᡷቝᔀႿᡷ ྉᓂऊɯ঎
构域ᖔ与 èᑕᡷᔽቝᑕ 等ྉ԰ԡԡ࿗ɯ 关于拟南芥以及早先水
图 ሕজ ϟᣰ ԰ ᥘ୩ 固培和 ϟᣰ ԰ ᥘ୩ 液培处理下 ᧣໧Þ̵໧
稻相关成蛋白的研究结果一致ᤥ 水稻成蛋白可分
相对表达量分析ྉᅳ໧ஏ၊ϟ 与野生型相比较ɯ
èᔽ੫঎ ሕজ ኏ᔀ᤟ᑕᡷᔽ׹ᔀ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᧣໧Þ̵໧ ࣼႿʛᔀʢ ϟᣰ ԰ ᥘ୩ 为两个亚家族ᖔ即第一类亚家族ྉ ᨃ༁è̀ϟܦᨃ༁è̀԰ܦ
༁ᆍ᤟ᔽʛ ᑕႿʛ ϟᣰ ԰ ᥘ୩ ᤟ᔽीࣼᔽʛ ᡷʢᔀᑕᡷቝᔀႿᡷ༁ ྉዹᆍቝᡱᑕʢᔀʛ ᨃ༁è̀࿗ܦᨃ༁è̀ऐܦᨃ༁è̀ँܦᨃ༁è̀ϟԡܦᨃ༁è̀ϟϟܦᨃ༁è̀ϟሕܦ
औᔽᡷၤ ᡷၤᔀ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ᤟ᔀ׹ᔀ᤟ ᔽႿ औᔽ᤟ʛ ᡷᢃᡱᔀɯ ᨃ༁è̀ϟ࿗ܦᨃ༁è̀ϟጢܦᨃ༁è̀ϟᤃܦᨃ༁è̀ϟᎮɯ和第二类亚家

ዛ঎ ᧣໧Þ̵໧ 家族系统进化树和保守基序分析ଫ ଧ঎ᨃ༁è̀༁ 家族蛋白分析ᤥ
ዛ঎ ᧣໧Þ̵໧ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ ᡱၤᢃ᤟ᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᡷʢᔀᔀ ᑕႿʛ ዹᆍႿ༁ᔀʢ׹ᑕᡷᔽ׹ᔀ ቝᆍᡷᔽ஦ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ଫ ଧ঎ ᨃ༁è̀༁ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ ዹᆍႿ༁ᔀʢ׹ᑕᡷᔽ׹ᔀ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁঎
图 ࿗জ 水稻成蛋白进化树ܦ保守蛋白结构域以及保守基序分析
èᔽ੫঎ ࿗জ ۪ၤᢃ᤟ᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹᖔ ዹᆍႿ༁ᔀʢ׹ᔀʛ ቝᆍᡷᔽ஦ ᑕႿʛ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ʛᆍቝᑕᔽႿ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᨃ༁è̀༁ ᔽႿ ʢᔽዹᔀ