Page 26 - 《广西植物》2022年第11期
P. 26
ϟ ऐ ϟ ऐ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ 卷
图 ጢজ 水稻成蛋白顺式作用元件预测
èᔽ੫ ጢজ ࣷᔠ᥋ᑕዹᡷᔽႿ੫ ᔀᔀቝᔀႿᡷ༁ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔀʛ ᔽႿ ᡷၤᔀ ᡱʢᆍቝᆍᡷᔀʢ ʢᔀ੫ᔽᆍႿ༁ ᆍ ᧣Þ̵
族ྉ ᨃ༁è̀ሕܦᨃ༁è̀ጢܦᨃ༁è̀ᤃܦᨃ༁è̀Ꭾܦᨃ༁è̀ϟɯᤥ 在 稻根 毛生长发育受到生长素以及赤霉素调控
水稻第二类亚家族中ᖔᨃ༁è̀ϟ 还存在于植物领域 ྉᥘᑕᔀҴᑕऔᑕ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡԡँଫ ۼᑕႿ੫ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟᎮɯᤥ 在本实
中未阐明的结构域 ۪ఋጶશᤥ 此外ᖔ通过蛋白序列同 验中固培ܦ水培环境变化也包括氧气含量的变化ᖔ
源性分析也表明水稻成蛋白的 è̀ 结构域在氨基 但当前并无相关研究ᤥ 因此ᖔ环境变化改变根毛表
酸水平上是保守的ᤥ 与 ᨃ༁è̀ϟ 亲缘关系最近的是 型可能是通过生长素以及赤霉素相关信号通路调
ᨃ༁è̀ϟጢᖔ而 ᨃ༁è̀ϟᎮ 与 ᨃ༁è̀ϟᤃ 与 ᨃ༁è̀ϟ 亲缘关 控ᖔ而养分含量也可能作为环境因素参与调控ᤥ
系较远ᤥ 但是ᖔ保守基序分析结果显示ᖔ水稻成蛋 亚 细胞定位 表 明 ᨃ༁è̀ϟܦ ᨃ༁è̀࿗ܦ ᨃ༁è̀ᤃܦ
白第一类亚家族基序保守性较高ᖔ表明第一类亚 ᨃ༁è̀Ꭾܦᨃ༁è̀ँ 定位于细胞液中ᖔᨃ༁è̀ 定位于胞
家族成员的功能可能类似ᖔ因此为了进一步分析 外ᖔ而 ᨃ༁è̀࿗ܦ ᨃ༁è̀ጢܦ ᨃ༁è̀ᤃ 定位于质体ᖔ 并且
水稻成蛋白可能存在的功能ᖔ本研究对其顺式作 ᨃ༁è̀࿗ 可能 在 细 胞核内起着一定作用ᤥ 此外ᖔ
用元件以及亚细胞定位进行分析ᤥ ᨃ༁è̀ऐܦ ᨃ༁è̀ϟϟܦ ᨃ༁è̀ϟܦ ᨃ༁è̀ϟሕܦ ᨃ༁è̀ϟ࿗ܦ
ሕ 水稻成蛋白顺式作用元件以及亚细胞定位 ᨃ༁è̀ϟጢܦᨃ༁è̀ϟᤃܦᨃ༁è̀ϟᎮ 都定位于质膜ᖔ表明大
分析জ 顺式作用元件分析表明成蛋白家族成员上 部分水稻成蛋白可能在质膜上行使功能ᤥ 并且
游存在多个响应激素以及胁迫调控相关的元件 ᨃ༁è̀ᤃ 定位于过氧化物 酶 体ᖔᨃ༁è̀ϟሕ 定位于液
ྉ图 ጢɯᤥ 这些成蛋白成员中除 ᧣Þ̵ϟᎮ 以外ᖔ其他 泡ᖔᨃ༁è̀ሕ 定位于线粒体表明这些水稻成蛋白可
水稻 成 蛋 白都可能受到茉莉酸调控ᖔ 而除了 能参与这些细胞器的形成ᤥ ᨃ༁è̀ϟԡܦᨃ༁è̀ϟሕ 定位
᧣Þ̵ሕᖔ᧣Þ̵ጢ 和 ᧣Þ̵ᤃ 以外其他水稻成蛋白成 于高尔基体ᖔᨃ༁è̀ϟ࿗ܦᨃ༁è̀ϟጢ 定位于内质网表明
员都有 厌 氧 调 控相关的顺式作用元件ᤥ 此外 其可能参与蛋白的分泌与转运ྉ 表 ɯᤥ 而 ᨃ༁è̀ϟ
᧣Þ̵ϟܦ ᧣Þ̵࿗ܦ ᧣Þ̵ጢܦ ᧣Þ̵ᤃܦ ᧣Þ̵ऐܦ ᧣Þ̵ϟԡܦ 和 ᨃ༁è̀ϟᤃܦᨃ༁è̀ϟᎮ 之间定位的差异ᖔ表明 ᨃ༁è̀ϟ
᧣Þ̵ϟܦ᧣Þ̵ϟሕܦ᧣Þ̵ϟጢ 都具有干旱响应元件ᤥ 功能可能和 ᨃ༁è̀ϟᤃܦᨃ༁è̀ϟᎮ 存在一定差异ᤥ
᧣Þ̵ϟܦ᧣Þ̵ऐܦ᧣Þ̵ँܦ᧣Þ̵ϟϟܦ᧣Þ̵ϟሕܦ᧣Þ̵ϟጢܦ ሕሕ 水稻组织成蛋白表达水平分析জ 基因在植
᧣Þ̵ϟᤃܦ᧣Þ̵ϟᎮ 都具有生长素调控相关原件ᖔ表 物不同部位的表达差异可能决定了其参与的功
明其可能参与生长素相关调控ᤥ 能ᖔ通常在某个部位高表达的基因会参与特定部
其中ᖔ᧣Þ̵ϟᤃܦ᧣Þ̵ϟᎮܦ᧣Þ̵ϟ 都具有厌氧相关 位 的生长发育ᖔ 以及对胁迫进行响应ᤥ 通过
的顺式作用元件ܦ赤霉素调控相关顺式作用元件以 ᔽዹᔀᣮ۪ʢᆍ 数据库ྉၤᡷᡷᡱ༁᧥ᣰ ᣰ ʢᔽዹᔀᡱʢᆍʛႿᑕᑕʢዹ੫ᆍᢼᡱ ᣰ ɯ
及生长素调控相关顺式作用元件ᤥ 而研究表明水 获取水稻成蛋白家族在不同部位表达量数据ᖔ 进