Page 102 - 《广西植物》2023年第10期
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１ ８ ５ ６ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 ２ 轮叶蒲桃叶绿体基因密码子偏好性分析
Ｔａｂｌｅ ２ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｏｄｏｎ ｐｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｉｎ Ｓｙｚｙｇｉｕｍ ｇｒｉｊｓｉｉ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｅｓ
占比 占比
氨基酸 密码子 数量 氨基酸 密码子 数量
Ｒａｔｉｏ ＲＳＣＵ Ｒａｔｉｏ ＲＳＣＵ
Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ
(％) (％)
亮氨酸 １０.５４ ＵＵＡ ６０８ １.９８ 苯丙氨酸 ５.４３ ＵＵＵ ６１５ １.２９
Ｌｅｕｃｉｎｅ Ｐｈｅｎｙｌａｌａｎｉｎｅ
ＵＵＧ ３６４ １.１８ ＵＵＣ ３３６ ０.７１
ＣＵＵ ３９１ １.２７ 酪氨酸 ３.８３ ＵＡＵ ５４７ １.６３
Ｔｙｒｏｓｉｎｅ
ＣＵＣ １２７ ０.４１ ＵＡＣ １２３ ０.３７
ＣＵＡ ２５３ ０.８２ 终止密码子 ０.２３ ＵＡＡ ２６ １.９０
Ｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ
ＣＵＧ １０３ ０.３３ ＵＡＧ ９ ０.６６
异亮氨酸 ９.０３ ＡＵＵ ７８６ １.４９ ＵＧＡ ６ ０.４４
Ｉｓｏｌｅｕｃｉｎｅ
ＡＵＣ ３０５ ０.５８ 组氨酸 ２.４６ ＣＡＵ ３３６ １.５６
Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅ
ＡＵＡ ４９０ ０.９３ ＣＡＣ ９５ ０.４４
甲硫氨酸 ２.３０ ＡＵＧ ４０２ １.００ 谷氨酰胺 ３.７８ ＣＡＡ ５１５ １.５６
Ｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ Ｇｌｕｔａｍｉｎｅ
缬氨酸 ５.１５ ＧＵＵ ３２９ １.４６ ＣＡＧ １４７ ０.４４
Ｖａｌｉｎｅ
ＧＵＣ ９７ ０.４３ 天冬酰胺 ５.０５ ＡＡＵ ６８６ １.５５
Ａｓｐａｒａｇｉｎｅ
ＧＵＡ ３４７ １.５４ ＡＡＣ １９８ ０.４５
ＧＵＧ １２９ ０.５７ 赖氨酸 ５.４０ ＡＡＡ ７１７ １.５２
Ｌｙｓｉｎｅ
丝氨酸 ７.５２ ＵＣＵ ３８９ １.７７ ＡＡＧ ２２８ ０.４８
Ｓｅｒｉｎｅ
ＵＣＣ １９９ ０.９１ 天冬氨酸 ４.０８ ＧＡＵ ５９１ １.６６
Ａｓｐａｒｔｉｃ ａｃｉｄ
ＵＣＡ ２７４ １.２５ ＧＡＣ １２３ ０.３４
ＵＣＧ １３０ ０.５９ 谷氨酸 ５.５１ ＧＡＡ ７３０ １.５１
Ｇｌｕｔａｍｉｃ ａｃｉｄ
ＡＧＵ ２４９ １.１３ ＧＡＧ ２３４ ０.４９
ＡＧＣ ７６ ０.３５ 半胱氨酸 １.１１ ＵＧＵ １５１ １.５５
Ｃｙｓｔｅｉｎｅ
脯氨酸 ４.００ ＣＣＵ ２７９ １.５９ ＵＧＣ ４４ ０.４５
Ｐｒｏｌｉｎｅ
ＣＣＣ １３４ ０.７７ 色氨酸 １.６６ ＵＧＧ ２９１ １.００
Ｔｒｙｐｔｏｐｈａｎ
ＣＣＡ ２１２ １.２１ 精氨酸 ６.１８ ＣＧＵ ２１１ １.１７
Ａｒｇｉｎｉｎｅ
ＣＣＧ ７５ ０.４３ ＣＧＣ ６７ ０.３７
苏氨酸 ４.９６ ＡＣＵ ３２９ １.５２ ＣＧＡ ２６５ １.４７
Ｔｈｒｅｏｎｉｎｅ
ＡＣＣ １５０ ０.６９ ＣＧＧ ６７ ０.３７
ＡＣＡ ２８８ １.３３ ＡＧＡ ３５０ １.９４
ＡＣＧ １０１ ０.４７ ＡＧＧ １２２ ０.６８
丙氨酸 ５.１９ ＧＣＵ ４０３ １.７７ 甘氨酸 ６.５７ ＧＧＵ ３６９ １.２８
Ａｌａｎｉｎｅ Ｇｌｙｃｉｎｅ
ＧＣＣ １５２ ０.６７ ＧＧＣ １０５ ０.３６
ＧＣＡ ２５０ １.１０ ＧＧＡ ５００ １.７４
ＧＣＧ １０４ ０.４６ ＧＧＧ １７７ ０.６２
注: 带下划线所对应的密码子表示被高频使用的密码子(ＲＳＣＵ>１)ꎮ
Ｎｏｔｅ: Ｔｈｅ ｕｎｄｅｒｌｉｎｅｄ ｃｏｄｏｎ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ａ ｈｉｇｈ ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ ｃｏｄｏｎ (ＲＳＣＵ>１).
本研究从 ＮＣＢＩ 已公开的植物中选取了包括 桃和乌墨属小花蒲桃组ꎬ这与本研究中构建的系
轮叶蒲桃在内的 ２３ 种植物ꎬ通过系统进化分析确 统发育树一致ꎬ表明该文聚类分析结果具有可靠
定了轮叶蒲桃的进化地位和亲缘关系ꎮ 轮叶蒲 性ꎮ 虽然蒲桃属物种组成丰富ꎬ但是目前所有的
桃、蒲桃、滇边蒲桃和乌墨构成了一个支持率高的 系统发育数据较少ꎬ轮叶蒲桃系统发育关系的研
单支ꎬ与马六甲蒲桃的关系比较密切ꎬ亲缘关系较 究弥补了部分空缺ꎬ但之后依然需要更加深入的
近ꎮ 在中国植物志分类系统中ꎬ轮叶蒲桃、滇边蒲 分析ꎮ
