Page 103 - 《广西植物》2023年第10期

１０ 期 张梦洁等: 轮叶蒲桃叶绿体基因组特征及系统发育分析 １ ８ ５ ７

图 ４ 蒲桃属 ５ 种植物叶绿体基因组边界分析
Ｆｉｇ. ４ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｂｏｕｎｄａｒｉｅｓ ｉｎ ｆｉｖｅ Ｓｙｚｙｇｉｕｍ ｓｐｅｃｉｅｓ

通过高通量测序和组装轮叶蒲桃叶绿体样 ｓｙｍｂｉｏｇｅｎｅｓｉｓ ａｎｄ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｌｏｓｓｅｓ [Ｊ]. Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｌꎬ １２(２):
本ꎬ获得了轮叶蒲桃完整的叶绿体基因组ꎮ 该叶 Ｒ６２－Ｒ６４.
ＣＨＥＮ Ｊꎬ ２００７. Ｆｌｏｒａ Ｒｅｉｐｕｂｌｉｃａｅ Ｐｏｐｕｌａｒｉｓ Ｓｉｎｉｃａｅ: Ｖｏｌ. １３
绿体基因组的长度为 １５８ ５９１ ｂｐꎬ具有典型的环状
[Ｍ]. Ｂｅｉｊｉｎｇ: Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｒｅｓｓ: ３５１－３５２. [陈介ꎬ ２００７. 中国
结构ꎬ含有 １２９ 个功能基因ꎮ 叶绿体基因组含有 植物志: 第十三卷 [Ｍ]. 北京: 科学出版社: ３５１－３５２. ]
丰富 的 ＳＳＲ 位 点 ( Ａ / Ｔ 作 为 主 要 成 分)ꎬ 并 且 以 ＣＨＥＮ Ｙꎬ ２０１７. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ
ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｈｒｙｓａｎｔｈｅｍｕｍ ａｎｄ Ａｊａｎｉａ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
Ａ / Ｕ结尾的密码子在轮叶蒲桃叶绿体基因组中更
ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｄ]. Ｎａｎｊｉｎｇ: Ｎａｎｊｉｎｇ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ: ４－
容易被使用ꎮ 通过叶绿体基因组比较分析可以发 １６. [陈韵ꎬ ２０１７. 菊属、亚菊属叶绿体 ＤＮＡ 的基因组结构
现ꎬ轮叶蒲桃叶绿体基因组的 ＩＲ 边界保守ꎬ与蒲 与进化分析 [Ｄ]. 南京: 南京农业大学: ４－１６. ]
ＤＥＮＧ ＹＷꎬ ＬＩＵ ＸＺꎬ ＺＨＵＯ ＤＬꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ
桃属其他物种间有较高的相似性ꎬ核苷酸水平高ꎮ
ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
系统发育树支持率比较高ꎬ物种间亲缘关系较近ꎮ
ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｓｙｚｙｇｉｕｍ ａｃｕｍｉｎａｔｉｓｓｉｍｕｍ [Ｊ]. Ｇｕａｎｇｄｏｎｇ Ａｇｒｉｃ
轮叶蒲桃叶绿体基因组特征和系统发育研究对于 Ｓｃｉꎬ ４８(６): ３８ － ４６. [ 邓 演 文ꎬ 刘 晓 洲ꎬ 卓 定 龙ꎬ 等ꎬ
了解蒲桃属的不同物种非常重要ꎬ有助于开发该 ２０２１. 肖蒲桃叶绿体基因组结构特征及系统发育关系
[Ｊ]. 广东农业科学ꎬ ４８(６): ３８－４６. ]
属的植物资源ꎬ并为进一步研究提供理论基础ꎮ
ＤＵ Ｌꎬ ＺＨＡＮＧ Ｃꎬ ＬＩＵ Ｑꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｋｒａｉｔ: ａｎ ｕｌｔｒａｆａｓｔ ｔｏｏｌ
ｆｏｒ ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ ｓｕｒｖｅｙ ｏｆ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｓ ａｎｄ ｐｒｉｍｅｒ ｄｅｓｉｇｎ
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ＶＩＳＴＡ: ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ ｔｏｏｌｓ ｆｏｒ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｇｅｎｏｍｉｃｓ
ＡＳＡＦ Ｓꎬ ＷＡＱＡＳ Ｍꎬ ＫＨＡＮ ＡＬꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ [Ｊ]. ＮｕｃｌＡｃｉｄｓ Ｒｅｓꎬ ３２(２): Ｗ２７３－Ｗ２７９.
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｗｉｌｄ ｒｉｃｅ ( Ｏｒｙｚａ ｍｉｎｕｔａ) ａｎｄ ｉｔｓ ＨＵＡＮＧ Ｘꎬ ＣＨＵ ＧＭꎬ ＺＨＥＮＧ ＸＫꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ
ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｔｏ ｒｅｌａｔｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ [Ｊ]. Ｆｒｏｎｔ Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉꎬ ８: ３０４. ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ
ＢＥＩＥＲ Ｓꎬ ＴＨＩＥＬ Ｔꎬ ＭＵＮＣＨ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. ＭＩＳＡ￣ｗｅｂ: ａ Ｎｙｍｐｈａｅａ [Ｊ]. Ｊ Ａｇｒｉｃ Ｓｃｉ Ｔｅｃｈｎｏｌꎬ ２４(４): ７５－８４. [黄
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