Page 28 - 《广西植物》2023年第7期
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表 1 火棘不同组织内生细菌多样性指数分析
Table 1 Diversity index analysis of endophytic bacterial community in different tissues of Pyracantha fortuneana
有效序列条数
样品名称 Shannon 指数 Simpson 指数 Chao1 指数 Ace 指数
No. of valid OTU
Sample name Shannon index Simpson index Chao1 index Ace index
sequences
火棘根 HJG 41 948 756 4.93±0.15a 0.02±0.01a 462.63±7.87a 757.17±78.10a
火棘茎 HJJ 308 3.29±0.11b 0.08±0.02a 246.22±70.31b 338.79±129.42b
37 180
火棘叶 HJY 40 996 754 3.42±0.68b 0.08±0.07a 433.15±67.72a 456.51±13.87b
注: 同列数据后小写字母表示处理间存在显著性差异 (P<0.05)ꎮ
Note: Lowercase letters in the same column indicates significant differences between different treatments (P<0.05).
表 2 火棘不同组织内生细菌物种分类阶层统计 7.18%假单胞菌属(Pseudomonas)、6.17%葡萄球菌
Table 2 Taxonomic rank statistics of endophytic bateria 属(Staphylococcus)ꎻ火棘叶中优势菌属为 8.03%马
in different tissues of Pyracantha fortuneana
赛菌属、12.31%土芽孢杆菌属(Geobacillus)、9.84%
样品名称 假单胞菌属、4.71%乳杆菌属(Lactobacillus)ꎮ
门 纲 目 科 属 种
Sample
Phylum Class Order Family Genus Species 2.5 火棘不同组织内生细菌 KEGG 代谢通路分析
name
将所测的基因数据与 KEGG 数据库中的信息
火棘根 HJG 23 53 137 216 373 557
进行比对ꎬ从而获得火棘不同组织内生细菌的代
火棘茎 HJJ 21 32 76 126 204 270
谢通路相关信息(表 3)ꎮ 由表 3 可知ꎬ火棘内生细
火棘叶 HJY 21 52 130 210 380 581
菌所有菌群参与的生物代谢通路有 7 类ꎬ包括新
陈代谢细胞进程、环境信息处理、遗传信息处理、
2.4.2 火棘不同组织内生细菌科水平群落组成分析 人类疾病、新陈代谢、生物体系统和未知分类ꎬ其
由图 5 可 知ꎬ 不 同 组 织 中 优 势 菌 科 存 在 很 大 差 中根部参与各种功能活动的内生细菌物种丰度相
别ꎬ在 火 棘 根 中 优 势 菌 科 为 15. 30% 根 瘤 菌 科 对较高ꎬ而茎部和叶部参与调控各种代谢的内生
( Rhizobiaceae) 、9.75% 黄色杆菌科( Xanthobacte ̄ 细菌丰度相对较低ꎮ
raceae) 、8. 00% 链 霉 菌 科 ( Streptomycetaceae) 和
6.84%分支杆菌科( Mycobacteriaceae) 和 5.29%类 3 讨论与结论
诺卡氏菌科 ( Nocardioidaceae) ꎻ火 棘 茎 中 优 势 菌
科 为 31. 18% 草 酸 杆 菌 科 ( Oxalobacteraceae ) 、 本研究基于高通量测序技术ꎬ对火棘根、茎、
14.88%丛毛单胞菌科( Comamonadaceae) 、7.18% 叶不同组织内生细菌群落多样性进行研究ꎮ 本研
假单胞菌科( Pseudomonadaceae) 和 6.17%葡萄球 究结果表明ꎬ火棘不同组织内存在丰富的内生细
菌科( Staphylococcaceae) ꎻ 火 棘 叶 中 优 势 菌 科 为 菌ꎬ不同组织内生细菌在不同分类水平上的优势
13.07%芽孢杆菌科( Bacillaceae) 、9. 84% 假单胞 菌群、细菌多样性及丰度信息存在较大差异ꎮ 植
菌科、 8.31% 草 酸 杆 菌 科、 7. 33% 黄 色 杆 菌 科、 物内生菌具有自身独特的组织专一性ꎬ并且植物
5. 34% 丛 毛 单 胞 菌 科 和 5. 22% 乳 杆 菌 科 不同组织间内生菌多样性结构随植物的不同具有
( Lactobacillaceae) ꎮ 一定的差异(许国琪等ꎬ2020ꎻ顾美英等ꎬ2021)ꎬ这
2.4.3 火棘不同组织内生细菌属水平群落组成分 种差异性可能与其自身所处生境的特殊性及其在
析 由图 6 可知ꎬ不同组织中优势菌属存在很大差 长期适应环境过程中形成了自身独特的细菌群落
别ꎬ在火棘根中优势菌属为 10.57%异样根瘤菌属、 特征ꎮ 本研究中火棘不同组织内生菌共隶属于 29
8%链霉菌属、6.84% 分支杆菌属( Mycobacterium)、 个门 71 个纲 175 个目 289 个科 533 个属 852 个
4.56%类诺卡氏菌属(Nocardioides)、5.28%慢生根瘤 种ꎬ表现出丰富的生物多样性ꎮ 在门分类水平上ꎬ
菌属(Bradyrhizobium)ꎻ火棘茎中优势菌属为 31.1% 变形菌门是火棘不同组织内的优势类群ꎬ在根部、
马赛菌属、12. 82% 未知分类的丛毛单胞菌科属、 茎部和叶部的丰度分别为 59.12%、 68.15%和