Page 67 - 《广西植物》2024年第12期

１２ 期 姜玲等: 大豆 ＴｒｘＧ 基因家族鉴定及表达模式分析 ２ ２ ２ ５

表 １ 本研究中所涉及的引物序列 ２.２ 大豆 ＴｒｘＧ 蛋白家族系统进化树、保守结构域
Ｔａｂｌｅ １ Ｐｒｉｍｅｒ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｉｎｖｏｌｖｅｄ ｉｎ ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ 和基因结构分析
引物名称 引物序列(５′－３′) 系统进化树和蛋白质结构域组成分析结果显
Ｐｒｉｍｅｒ ｎａｍｅ Ｐｒｉｍｅｒ ｓｅｑｕｅｎｃｅ (５′－３′)
示ꎬ大豆 ＧｍＴｒｘＧ 蛋白成员可被细分为 ３ 个亚族(Ｉ、
ＧｍＳＤＧ２ａ￣Ｆ ＣＴＣＴＧＣＡＧＣＡＧＣＡＧＣＡＴＧＴ Ⅱ、Ⅲ ) ( 图 １: Ａ )ꎮ 其 中ꎬ Ｉ 类 亚 家 族 仅 含 有
ＧｍＳＤＧ２ａ￣Ｒ ＣＴＴＣＴＴＣＣＴＣＴＴＧＣＣＡＧＣＴＡＣＣＴＴ ＧｍＳＤＧ２ 同源蛋白ꎬ共 ４ 个成员ꎬ各蛋白均只含有 １
个 ＳＥＴ 结构域ꎻⅡ类亚族含有 ＧｍＳＤＧ２５ 同源蛋白
ＧｍＳＤＧ２ｂ￣Ｆ ＧＣＴＴＡＧＴＧＧＧＡＡＣＧＧＧＴＴＣＧＧ
共 ２ 个成员ꎬ均含有 ＳＥＴ 结构域和 ｐｏｓｔ￣ＳＥＴ 结构域
ＧｍＳＤＧ２ｂ￣Ｒ ＴＣＣＣＡＣＣＣＣＧＧＣＴＧＣＣＴＡ
各 １ 个 外ꎬ 此 外ꎬ ＧｍＳＤＧ２５ａ 还 含 有 １ 个 ＧＹＦ
ＧｍＳＤＧ２ｃ￣Ｆ ＡＧＣＡＧＣＡＧＣＡＴＧＡＧＡＡＧＧＴＧ (ｇｌｙｃｉｎｅ￣ｔｙｒｏｓｉｎｅ￣ｐｈｅｎｙｌａｌａｎｉｎｅ)结构域ꎻⅢ类亚族含

ＧｍＳＤＧ２ｃ￣Ｒ ＧＣＣＴＣＴＣＴＴＣＧＧＴＧＧＣＧＧ 有 ＧｍＴｒｘＧ 同源蛋白共 ９ 个成员ꎬ这类亚族蛋白成
员均含有 １ 个 ＳＥＴ 结构域、１ 个 ｐｏｓｔ￣ＳＥＴ 结构域和
ＧｍＳＤＧ２ｄ￣Ｆ ＧＴＧＧＣＧＡＡＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＡＧＣＡ
多个 ＰＨＤ ( ｔｈｅ ｐｌａｎｔ ｈｏｍｅｏｄｏｍａｉｎ) 结构域ꎬ 此外ꎬ
ＧｍＳＤＧ２ｄ￣Ｒ ＧＣＣＴＣＴＣＣＴＣＧＧＴＧＧＣＧ
ＧｍＳＤＧ３０ａ 还含有 １ 个 ＦＹＲＣ(“ＦＹ￣ｒｉｃｈ” ｄｏｍａｉｎ Ｃ￣
ＧｍＳＤＧ１４ａ￣Ｆ ＴＧＧＴＧＧＴＧＧＴＧＡＧＧＴＴＣＡＧＴＣ
ｔｅｒｍｉｎａｌ)结构域( 图 １:Ｂ)ꎮ 基因结构分析结果显
ＧｍＳＤＧ１４ａ￣Ｒ ＴＣＧＡＣＧＧＡＡＴＣＴＴＣＴＧＧＧＣＡＴ 示ꎬＧｍＳＤＧ１４ａ / ｂ / ｃ/ ｄ、ＧｍＳＤＧ１６ａ / ｂ 和 ＧｍＳＤＧ２９ 基
因各含有 ２３ 个外显子ꎬＧｍＳＤＧ３０ａ / ｂ 含有 ２４ 个外
ＧｍＳＤＧ１４ｂ￣Ｆ ＧＧＡＣＧＡＴＧＡＡＡＡＣＣＧＡＡＡＣＧＣ
显 子ꎬ ＧｍＳＤＧ２ａ / ｂ / ｃ/ ｄ 含 有 １９ 个 外 显 子ꎬ
ＧｍＳＤＧ１４ｂ￣Ｒ ＧＣＴＧＣＴＣＣＡＴＧＡＧＣＣＡＧＡＡＣＡ
ＧｍＳＤＧ２５ａ / ｂ 含有 １４ 个外显子(图 １:Ｃ)ꎮ
ＧｍＳＤＧ１４ｃ￣Ｆ ＧＧＡＡＧＣＣＡＧＡＧＡＡＣＣＧＣＧ
２.３ 大豆 ＴｒｘＧ 基因家族成员在不同组织、器官中
ＧｍＳＤＧ１４ｃ￣Ｒ ＧＣＣＡＡＧＴＣＴＴＧＡＡＴＴＧＴＧＣＣＡＴＴＣＧＡ
的表达模式分析
ＧｍＳＤＧ１４ｄ￣Ｆ ＧＴＴＴＧＡＡＡＡＣＴＧＧＡＣＴＴＣＡＧＡＡＧＣＧＧ 基于转录组数据ꎬＧｍＴｒｘＧ 基因家族成员在不
同组织、器官中的表达模式如图 ２ 所示ꎮ 在根中ꎬ
ＧｍＳＤＧ１４ｄ￣Ｒ ＣＴＣＣＴＣＣＴＴＣＡＧＣＡＧＡＡＧＡＡＡＣＣＴＣＡ
ＧｍＳＤＧ２５ａ 和 ＧｍＳＤＧ２５ｂ 的 表 达 量 较 低ꎬ 而
ＧｍＳＤＧ１６ａ￣Ｆ ＧＣＴＣＧＴＡＡＧＡＡＧＡＧＡＡＡＧＡＣＣＡＡＣＡＧ
ＧｍＳＤＧ３０ａ 表达量最高ꎻ在侧根中ꎬＧｍＳＤＧ１４ｃ 和
ＧｍＳＤＧ１６ａ￣Ｒ ＴＡＡＣＣＡＧＡＧＧＴＧＧＣＣＧＣＴＧＡＡＣ
ＧｍＳＤＧ１４ｄ 的表达量最高ꎬ其余基因表达量都较
低ꎻ在茎中ꎬ几乎所有 ＧｍＴｒｘＧ 基因的表达量都较
ＧｍＳＤＧ１６ｂ￣Ｆ ＣＴＣＧＴＡＡＧＡＡＧＡＧＡＡＡＧＡＣＣＡＡＣＡＡＣＧ
低ꎬ其中 ＧｍＳＤＧ１６ａ 表 达 量 最 低ꎻ在 叶 和 花 器 官
ＧｍＳＤＧ１６ｂ￣Ｒ ＣＴＴＣＴＴＣＡＣＴＴＣＣＡＣＧＡＣＡＡＣＴＴＣＧ
中ꎬ绝 大 多 数 ＧｍＴｒｘＧ 基 因 的 表 达 量 都 较 高ꎬ 仅
ＧｍＳＤＧ２５ａ￣Ｆ ＣＴＧＴＣＴＴＴＣＴＣＧＡＴＧＡＡＧＡＴＧＡＣＣＣＣ
ＧｍＳＤＧ２５ａ 和 ＧｍＳＤＧ２５ｂ 在叶中表达量较低ꎬ以及
ＧｍＳＤＧ２５ａ￣Ｒ ＧＧＡＡＧＡＧＧＧＡＡＡＡＴＣＡＣＣＡＧＴＡＣＣＣ
ＧｍＳＤＧ１４ｃ 和 ＧｍＳＤＧ１４ｄ 在花中表达量较低ꎻ在种
ＧｍＳＤＧ２５ｂ￣Ｆ ＣＴＴＣＴＧＴＣＡＧＴＧＴＣＡＡＴＡＧＴＡＧＣＴＣＡＣＡＣ
子 中ꎬ ＧｍＳＤＧ１４ａ 表 达 量 最 高ꎬ 而 ＧｍＳＤＧ２ｃ、
ＧｍＳＤＧ２５ｂ￣Ｒ ＧＴＧＡＣＣＴＴＣＴＣＴＴＴＡＡＣＡＧＴＧＣＣＡＴＣＡＣ ＧｍＳＤＧ２ｄ 和 ＧｍＳＤＧ１４ｃ 表 达 量 较 低ꎻ 在 根 尖 中ꎬ
ＧｍＳＤＧ１４ｃ 和 ＧｍＳＤＧ１４ｄ 的 表 达 量 较 高ꎬ 其 余
ＧｍＳＤＧ２９￣Ｆ ＡＧＧＡＡＧＡＣＧＡＧＣＧＧＧＴＡＣＴＧ
ＧｍＴｒｘＧ 基 因 表 达 量 均 较 低ꎻ 在 茎 尖 中ꎬ 除
ＧｍＳＤＧ２９￣Ｒ ＣＴＣＡＡＴＣＡＣＣＧＡＡＴＣＧＴＴＧＡＡＣＣＧ
ＧｍＳＤＧ１４ｄ、 ＧｍＳＤＧ１６ｂ 和 ＧｍＳＤＧ２９ 表 达 量 较 低
ＧｍＳＤＧ３０ａ￣Ｆ ＧＣＧＧＣＡＣＴＣＣＣＡＴＣＣＧＣＴＡ
外ꎬ 其 余 ＧｍＴｒｘＧ 基 因 表 达 量 均 较 高ꎬ 并 且
ＧｍＳＤＧ３０ａ￣Ｒ ＴＧＧＴＴＧＴＴＡＴＧＣＧＴＴＡＧＧＧＴＧＡＧ
ＧｍＳＤＧ２ａ 表达量最高ꎮ
２.４ 大豆 ＴｒｘＧ 基因家族成员在不同胁迫处理下的
ＧｍＳＤＧ３０ｂ￣Ｆ ＧＣＧＧＣＡＣＴＣＣＣＡＴＣＣＧＣＴＡ
表达情况分析
ＧｍＳＤＧ３０ｂ￣Ｒ ＣＧＴＴＴＴＣＴＴＧＴＧＴＴＣＧＴＧＧＴＴＧＴＴＧ
利用 ｑＲＴ￣ＰＣＲ 技术分析了 ＧｍＴｒｘＧ 基因家族
ＧｍＡｃｔｉｎ￣Ｆ ＡＣＡＴＴＧＴＴＣＴＴＡＧＴＧＧＴＧＧＣＴ
成员在不同胁迫处理下的表达情况ꎬ结果如图 ３
ＧｍＡｃｔｉｎ￣Ｒ ＣＴＧＴＴＧＧＡＡＧＧＴＧＣＴＧＡＧ
所示ꎮ 在高温(４０ ℃ )胁迫下ꎬ除 ＧｍＳＤＧ２ｂ / ２ｃ / ２ｄ