Page 179 - 《广西植物》2025年第1期
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1 期                 孟静等: 茉莉酸甲酯诱导马尿泡根系分泌物的差异含量及分析                                            1 7 5

            1.5 代谢物鉴定                                          间的增加而减少ꎬ有机氮化合物则没有变化ꎮ 这
                 上机完成后ꎬ将 LC ̄MS 原始数据导入代谢组                       表明茉莉酸甲酯的浓度和处理时间对代谢物的积
            学处 理 软 件 Progenesis QI ( Waters Corporationꎬ       累产生重要影响ꎮ
            MilfordꎬUSA)ꎬ进行基线过滤、峰识别、积分、保留                      2.2 代谢组数据 PCA 分析
            时间校正、峰对齐ꎬ最终得到 1 个保留时间、质荷                               主成分分析是一种用于揭示组间差异、总结
            比和峰强度的数据矩阵ꎬ同时将 MS、MSMS 质谱信                         数 据 方 差 及 衡 量 样 本 变 异 性 的 多 元 方 法
                                                                                                          ̄1
            息 与 代 谢 公 共 数 据 库 HMDB ( http: / / www.            ( Marukatatꎬ 2023)ꎮ 通过 PCA 对 150 μmolL 茉
            hmdb.ca / )、Metlin (https: / / metlin.scripps.edu / ) 以  莉酸甲酯处理 3、7 d( EG3、EG7) 及 0 μmolL 茉
                                                                                                          ̄1
            及上海美吉生物技术公司自建库进行匹配ꎬ得到                              莉酸甲酯处理 3、7 d( CK3、CK7) 后的马尿泡根系

            代谢物信息ꎮ                                             分泌物进行分析( 图 1)ꎮ QC 样本的聚类结果表
            1.6 数据分析                                           明试验结果稳定可靠ꎬ并且样品组内 6 个样品均
                 基于美吉云平台( cloud.majorbio.com) 进行分              聚集在一起ꎬ说明样品组内的次生代谢物具有较
            析ꎬ采用 R 语言中的 ropls 包(Version1.6.2)对主成               高的相似性ꎮ 相反ꎬ4 个不同处理的马尿泡根系分
            分进行分析(PCA) 和正交偏最小二乘法-判别分                           泌物样本分布于由 PC1 和 PC2 主要成分轴组成的
            析(OPLS ̄DA)ꎬ并使用 7 次循环交互验证来评估                        不同区域ꎬ说明 4 个样本之间代谢物的类型或相
            模型的稳定性ꎮ 显著差异代谢物的选择基于 PLS ̄                          对含量存在显著差异ꎮ
            DA 模型得到的变量权重值(VIP)和 Student’s t 检                  2.3 总体差异代谢物分析
            验 P 值确定代谢物为显著差异代谢物ꎮ 差异代谢                               为了解不同处理下马尿泡根系分泌代谢物的
            物通过 KEGG 数据库( https: / / www. kegg. jp / kegg /    差异情况ꎬ对 EG3、 EG7、CK3 和 CK7 4 个样品组
            pathway.html)进行代谢通路注释ꎬ获得差异代谢物                      中马尿泡根系分泌物分别进行了比较分析( VIP >
            参与的通路ꎮ 用 Python 软件包 scipy.stats 进行通                1ꎬP<0.05)ꎬ结果如图 2 所示ꎬ在 EG3 vs CK3 的比
            路富集分析ꎬ并通过 Fisher 精确检验获得与实验处                        较组中ꎬ马尿泡根系分泌物含量有 468 种上调、
            理最相关的生物学途径ꎮ                                        333 种下调ꎻ在 EG7 vs CK7 的比较组中ꎬ马尿泡根
                                                               系分泌物含量有 356 种上调、311 种下调ꎻ在 EG7
            2  结果与分析                                           vs EG3 的比较组中ꎬ马尿泡根系分泌物含量有 293

                                                               种上调、369 种下调ꎮ 这表明茉莉酸甲酯对马尿泡
            2.1 马尿泡根系分泌物鉴定                                     根系分泌物合成既有促进作用也有抑制作用ꎬ但
                 不同处理的马尿泡根系分泌代谢物根据其特                           与空白处理相比ꎬ受到促进的代谢物要多于受到
            性多注释在 10 种类型中ꎬ在整体分类上呈现较高                           抑制的代谢物ꎮ
            的 多 样 性 ( 表 1 )ꎮ 脂 质 和 有 机 酸 化 合 物 在               2.4 差异代谢物的聚类分析
            0 μmolL 茉莉酸甲酯处理 3 d 后数量相同ꎬ在处                         为找出不同处理下马尿泡根系分泌物的差异
                       ̄1
            理 7 d 后数量分别为 213 种和 211 种ꎬ所占百分比                    成分ꎬ对不同含量的代谢物建立样本层次聚类树ꎬ
            分别为 22.30% 和 22.09%ꎬ随着时间的增加而减                      通过不同组别差异代谢物的变化趋势可以发现ꎬ
            少ꎮ 有机氧化合物和苯系化合物数量随着时间的                             在实验各阶段哪些代谢物发生了变化ꎮ 由图 3 可
            增加而增多ꎬ生物碱、有机氧、有机杂环及苯丙素                             以发现ꎬ对马尿泡根系分泌物前 20 种代谢物进行
            等化合物数量变化不明显ꎮ 在 150 μmolL 茉莉                      聚类ꎬ左侧为代谢物聚类的树状图ꎬ右侧为代谢物
                                                      ̄1
            酸甲酯处理 3 d 后ꎬ脂质和有机酸化合物数量分别                          的名称ꎬ上方为样本聚类的树状图ꎬ下方为样本的
            有 201 种和 249 种ꎬ所占百分比分别为 20.16%和                    名称ꎬ2 个分支离得越近ꎬ说明它们的含量越接近ꎬ

            24.97%ꎬ处理 7 d 后的数量分别为 243 种和 211                   不同颜色表示代谢物在该组样本中相对含量的大
            种ꎬ所占百分比分别为 23.91%和 20.77%ꎮ 其中ꎬ                     小ꎮ 与空白处理样本组相比ꎬ6 种代谢物在 150
            脂质类、苯丙素和聚酮类及苯系化合物数量随着                              μmolL 茉莉酸甲酯处理 3 d 后含量较高ꎬ如蔗
                                                                        ̄1
            处理时间的增加而增多ꎬ有机酸及衍生物、生物                              糖、海 藻 糖 和 果 果 二 糖 等ꎻ 8 种 代 谢 物 在 150
            碱、有机杂环化合物、核苷和核苷酸的数量随着时                             μmolL 茉莉酸甲酯处理 7 d 后含量较高ꎬ 如升
                                                                        ̄1
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