Page 179 - 《广西植物》2025年第1期
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1 期 孟静等: 茉莉酸甲酯诱导马尿泡根系分泌物的差异含量及分析 1 7 5
1.5 代谢物鉴定 间的增加而减少ꎬ有机氮化合物则没有变化ꎮ 这
上机完成后ꎬ将 LC ̄MS 原始数据导入代谢组 表明茉莉酸甲酯的浓度和处理时间对代谢物的积
学处 理 软 件 Progenesis QI ( Waters Corporationꎬ 累产生重要影响ꎮ
MilfordꎬUSA)ꎬ进行基线过滤、峰识别、积分、保留 2.2 代谢组数据 PCA 分析
时间校正、峰对齐ꎬ最终得到 1 个保留时间、质荷 主成分分析是一种用于揭示组间差异、总结
比和峰强度的数据矩阵ꎬ同时将 MS、MSMS 质谱信 数 据 方 差 及 衡 量 样 本 变 异 性 的 多 元 方 法
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息 与 代 谢 公 共 数 据 库 HMDB ( http: / / www. ( Marukatatꎬ 2023)ꎮ 通过 PCA 对 150 μmolL 茉
hmdb.ca / )、Metlin (https: / / metlin.scripps.edu / ) 以 莉酸甲酯处理 3、7 d( EG3、EG7) 及 0 μmolL 茉
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及上海美吉生物技术公司自建库进行匹配ꎬ得到 莉酸甲酯处理 3、7 d( CK3、CK7) 后的马尿泡根系
代谢物信息ꎮ 分泌物进行分析( 图 1)ꎮ QC 样本的聚类结果表
1.6 数据分析 明试验结果稳定可靠ꎬ并且样品组内 6 个样品均
基于美吉云平台( cloud.majorbio.com) 进行分 聚集在一起ꎬ说明样品组内的次生代谢物具有较
析ꎬ采用 R 语言中的 ropls 包(Version1.6.2)对主成 高的相似性ꎮ 相反ꎬ4 个不同处理的马尿泡根系分
分进行分析(PCA) 和正交偏最小二乘法-判别分 泌物样本分布于由 PC1 和 PC2 主要成分轴组成的
析(OPLS ̄DA)ꎬ并使用 7 次循环交互验证来评估 不同区域ꎬ说明 4 个样本之间代谢物的类型或相
模型的稳定性ꎮ 显著差异代谢物的选择基于 PLS ̄ 对含量存在显著差异ꎮ
DA 模型得到的变量权重值(VIP)和 Student’s t 检 2.3 总体差异代谢物分析
验 P 值确定代谢物为显著差异代谢物ꎮ 差异代谢 为了解不同处理下马尿泡根系分泌代谢物的
物通过 KEGG 数据库( https: / / www. kegg. jp / kegg / 差异情况ꎬ对 EG3、 EG7、CK3 和 CK7 4 个样品组
pathway.html)进行代谢通路注释ꎬ获得差异代谢物 中马尿泡根系分泌物分别进行了比较分析( VIP >
参与的通路ꎮ 用 Python 软件包 scipy.stats 进行通 1ꎬP<0.05)ꎬ结果如图 2 所示ꎬ在 EG3 vs CK3 的比
路富集分析ꎬ并通过 Fisher 精确检验获得与实验处 较组中ꎬ马尿泡根系分泌物含量有 468 种上调、
理最相关的生物学途径ꎮ 333 种下调ꎻ在 EG7 vs CK7 的比较组中ꎬ马尿泡根
系分泌物含量有 356 种上调、311 种下调ꎻ在 EG7
2 结果与分析 vs EG3 的比较组中ꎬ马尿泡根系分泌物含量有 293
种上调、369 种下调ꎮ 这表明茉莉酸甲酯对马尿泡
2.1 马尿泡根系分泌物鉴定 根系分泌物合成既有促进作用也有抑制作用ꎬ但
不同处理的马尿泡根系分泌代谢物根据其特 与空白处理相比ꎬ受到促进的代谢物要多于受到
性多注释在 10 种类型中ꎬ在整体分类上呈现较高 抑制的代谢物ꎮ
的 多 样 性 ( 表 1 )ꎮ 脂 质 和 有 机 酸 化 合 物 在 2.4 差异代谢物的聚类分析
0 μmolL 茉莉酸甲酯处理 3 d 后数量相同ꎬ在处 为找出不同处理下马尿泡根系分泌物的差异
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理 7 d 后数量分别为 213 种和 211 种ꎬ所占百分比 成分ꎬ对不同含量的代谢物建立样本层次聚类树ꎬ
分别为 22.30% 和 22.09%ꎬ随着时间的增加而减 通过不同组别差异代谢物的变化趋势可以发现ꎬ
少ꎮ 有机氧化合物和苯系化合物数量随着时间的 在实验各阶段哪些代谢物发生了变化ꎮ 由图 3 可
增加而增多ꎬ生物碱、有机氧、有机杂环及苯丙素 以发现ꎬ对马尿泡根系分泌物前 20 种代谢物进行
等化合物数量变化不明显ꎮ 在 150 μmolL 茉莉 聚类ꎬ左侧为代谢物聚类的树状图ꎬ右侧为代谢物
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酸甲酯处理 3 d 后ꎬ脂质和有机酸化合物数量分别 的名称ꎬ上方为样本聚类的树状图ꎬ下方为样本的
有 201 种和 249 种ꎬ所占百分比分别为 20.16%和 名称ꎬ2 个分支离得越近ꎬ说明它们的含量越接近ꎬ
24.97%ꎬ处理 7 d 后的数量分别为 243 种和 211 不同颜色表示代谢物在该组样本中相对含量的大
种ꎬ所占百分比分别为 23.91%和 20.77%ꎮ 其中ꎬ 小ꎮ 与空白处理样本组相比ꎬ6 种代谢物在 150
脂质类、苯丙素和聚酮类及苯系化合物数量随着 μmolL 茉莉酸甲酯处理 3 d 后含量较高ꎬ如蔗
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处理时间的增加而增多ꎬ有机酸及衍生物、生物 糖、海 藻 糖 和 果 果 二 糖 等ꎻ 8 种 代 谢 物 在 150
碱、有机杂环化合物、核苷和核苷酸的数量随着时 μmolL 茉莉酸甲酯处理 7 d 后含量较高ꎬ 如升
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