Page 38 - 《广西植物》2025年第1期
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３ ４                                    广  西  植  物                                         ４５ 卷
            外ꎬ还对 ＯＴＵｓ 序列进行物种注释ꎬ细菌用 Ｍｏｔｈｕｒ                      目:(１)对于细菌来说ꎬＣＴ 的总 ＯＴＵ 数目(１ ８４３)
            方法与 ＳＩＬＶＡ１３８( Ｅｄｇａｒꎬ ２０１３) 的 ＳＳＵｒＲＮＡ 数据            和特有的 ＯＴＵ 数目(１ ４９２) 均大于 ＣＲ 的总 ＯＴＵ
            库(Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００７)进行物种注释分析( 设定阈                  数目(１ ０７３)和特有的 ＯＴＵ 数目(７２２)(图 ２: Ａ)ꎻ
            值为 ０.８ ~ １)ꎻ真菌用 Ｑｉｉｍｅ 软件(Ｖｅｒｓｉｏｎ １.９.１)中           (２)对于真菌来说ꎬＣＴ 的总 ＯＴＵ 数目(８２１) 和特

            的 Ｂｌａｓｔ 方法( Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ.ꎬ １９９０) 与 Ｕｎｉｔ( ｖ８.２)   有的 ＯＴＵ 数目(７３８)亦均大于 ＣＲ 的总 ＯＴＵ 数目
            数据库( Ｋöｌｊａｌｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１３) 进行物种注释分析ꎬ               (７５０)和特有的 ＯＴＵ 数目(６６７)(图 ２: Ｂ)ꎮ
            得到对应的物种信息和基于物种的丰度分布情                               ２.３ 大别山五针松根际菌和内生菌 α￣多样性分析
            况ꎮ 通过 Ｒ 软件( Ｖｅｒｓｉｏｎ ３.０.３) 绘制 ＰＣｏＡ 图ꎬ探                 由综合分析细菌、真菌的 α￣多样性指数可知ꎬ
            究不同样本群落结构的差异ꎮ 物种组成分析能够                             根际土壤样品中的微生物在细菌和真菌方面的多
            反映样品在分类学水平的群落结构ꎬ本研究在门                              样性和物种丰富度均高于根部组织样品ꎬ但差异
            水平上选取了丰度排名前 ５ 的物种ꎬ在属水平上                            不显著ꎮ 根际土壤样品细菌的 Ｏｂｓｅｒｖｅｄ￣ｓｐｅｃｉｅｓ 指
            选取丰度前 ２０ 的物种进行详细的物种群落结构                            数、 Ｃｈａｏ 指 数、 ＡＣＥ 指 数 分 别 为 １ ９６４. ６７、
            组成 分 析ꎮ 此 外ꎬ 本 研 究 还 利 用 ＰＩＣＲＵＳｔ 软 件               ２ ０７１.７８、 ２ ０８２. ４４ꎬ 均 大 于 根 部 组 织 样 品
            (ＫＥＧＧ 数据库) 和 ＦＵＮＧｕｉｌｄ 软件对大别山五针                     (１ ０６８.６７、１ ２０９.０３、１ ２３０.８３)ꎬ但无显著性差异
            松根际 微 生 物 总 丰 度 前 ３５ 的 物 种 进 行 了 功 能               (Ｐ>０.０５)ꎻ而 Ｓｈａｎｎｏｎ 指数为 ７.８０ꎬ大于根部组织
            预测ꎮ                                                样品(３.２０)ꎬ并且有显著性差异( Ｐ<０.０５)ꎬ根际
                                                               土壤 样 品 真 菌 的 Ｏｂｓｅｒｖｅｄ￣ｓｐｅｃｉｅｓ 指 数、 Ｃｈａｏ 指
            ２  结果与分析                                           数、ＡＣＥ 指 数 和 Ｓｈａｎｎｏｎ 指 数 分 别 为 ３８１. ６７、
                                                               ４０６.９５、４０６.４９ 和 ４.８２ꎬ亦均大于根部组织样品的
            ２.１ 测序概况分析                                         ３１０.６７、３２９.０４、３２９.７５ 和 ３.７２ꎬ并且均无显著性差
                 经细菌 １６Ｓ ｒＲＮＡ 基因测序分析ꎬ细菌共获得                     异(Ｐ>０.０５)(表 １)ꎮ 这说明大别山五针松根际土
            ３８０ ３７７ 条有效序列ꎬ其中 ３ 份根际土壤样品的平                       壤真菌的物种丰富度和多样性高于根部内生真
            均有效序列为 ６２ ２０２ 条ꎬ平均序列长度为 ４１６ ｂｐꎻ                    菌ꎬ但两者无显著性差异ꎮ
            ３ 份根部组织样品的平均有效序列为 ６４ ５９１ 条ꎬ                        ２.４ 大别山五针松根际微生物和内生菌 β￣多样性
            平均序列长度为 ４０９ ｂｐꎮ 经真菌 ＩＴＳ 测序分析ꎬ真                     分析
            菌共获得 ３８９ ６６１ 条有效序列ꎬ其中 ３ 份根际土壤                          ＰＣｏＡ 分析(主坐标分析)ꎬ即通过样品间的空
            样品的平均有效序列为 ６６ １４２ 条ꎬ平均序列长度                         间距离来反映样品组间群落结构的差异性ꎮ 其
            为 ２６１ ｂｐꎻ３ 份根部组织样品的平均有效序列为                         中ꎬ组间的空间距离越远ꎬ说明样品间群落结构差
            ６３ ７４５ 条ꎬ平均序列长度为 ２６８ ｂｐꎮ 独立样本 ｔ 检                  异越 大 ( 高 嵩 等ꎬ ２０２１ )ꎮ 本 文 基 于 Ｕｎｗｅｉｃｈｔｅｄ
            验分析结果显示ꎬ根际土壤样品和根部组织样品                              Ｕｎｉｔｒａｃ 距离进行 ＰＣｏＡ 分析ꎬ结果显示无论是细菌
            有效序列数差异不显著(Ｐ>０.０５)ꎮ                                还是真菌ꎬ大别山五针松根际土壤微生物菌群和
                 由图 １ 可知ꎬ细菌和真菌的稀释曲线上升到一                        根部内生菌菌群坐标点的空间距离都较远ꎬ说明
            定高度后趋于平稳ꎬ说明测序的深度已足够代表                              两组样品间群落结构存在差异ꎮ 由图 ３ 可知ꎬ根
            样品中大多数细菌和真菌的种类ꎬ并且样本测序                              际土壤样品与根部组织样品同组间的距离较近ꎬ

            数量也已足够ꎬ可用于后续生物信息学分析ꎮ                               表明组间群落结构组成相似ꎬ而根际土壤样品与
            ２.２ 大别山五针松根际微生物和内生菌 ＯＴＵ 分析                         根部组织样品不同组间距离较远ꎬ表明两组样品

                 依据 ９７％相似度对所得序列进行 ＯＴＵ 聚类ꎬ                      的群落结构相似性较低ꎮ
            从根际土壤样品中共获得 １ ８４３ 个细菌 ＯＴＵ 数目                       ２.５ 大别山五针松根际微生物和内生菌群落结构

            和 ８２１ 个真菌 ＯＴＵ 数目ꎬ从根部组织中获得 １ ０７３                    组成分析
            个内生细菌 ＯＴＵ 数目和 ７５０ 个真菌 ＯＴＵ 数目ꎮ                      ２.５.１ 细菌  从大别山五针松根际土壤样品中获
            因此ꎬ无论是根际菌群还是根部内生菌ꎬ其细菌                              得的细菌分布于 １７４ 纲 ８８ 门 ３４２ 目 ４３７ 科 ６７１
            ＯＴＵ 数目均大于真菌 ＯＴＵ 数目ꎮ 同时ꎬ我们还发                        属ꎬ根部组织样品中获得的细菌分布于 ９１ 纲 ４０ 门
            现ꎬ根际土壤 ＯＴＵ 数目高于根部内生菌 ＯＴＵ 数                         １９５ 目 ２５５ 科 ３１８ 属ꎮ 在门分类水平上ꎬ厚壁菌门
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