Page 71 - 《广西植物》2025年第7期
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7 期 陈宇姝等: 低温胁迫下外源油菜素内酯对冬小麦 REVEILLE 7 ̄like 基因表达的影响 1 2 6 3
家基因验证模板是否提取成功ꎬ成功后将模板置 软件( https: / / www. ebi. ac. uk / Tools/ msa / clustalo / )
于-20 ℃ 冰箱储存ꎮ 进行 氨 基 酸 多 序 列 比 对ꎻ 用 plantcare ( http: / /
1.2.2 REVEILLE 7 ̄like 基因的克隆 从‘东农冬麦 web.webtools/ plantcare / html/ ) 进 行 蛋 白 的 启 动 子
1 号’转录组数据中得到 REVEILLE 7 ̄like 基因的 预测ꎻ用 Protscale 软件( http: / / web.expasy.org / cgi ̄
序列全长ꎬ在 NCBI 上进行比对ꎬ比对结果一致ꎬ用 bin / protscale / )分析 REVEILLE 7 ̄like 蛋白的亲、疏
软件 Primer 5.0 设计该基因全长序列的特异性引 水性ꎻ用软件 SOPMA 和 Swiss Model 对该蛋白的二
物 REVEILLE 7 ̄like 1F / 1R(表 1)ꎬ构建 20 μL PCR 级、三级结构进行预测和建模ꎮ 利用软件 MEGA
反应体系ꎬ反应程序如下:94 ℃ 预变性 5 minꎬ94 7.0 中 Neighbor ̄Joining( NJ) 法构建 REVEILLE 7 ̄
℃ 变性 30 s、55 ℃ 退火 30 s、72 ℃ 延伸 90 sꎬ共进 like 蛋白与多物种的系统发育树ꎬ并通过 MEME ̄
行 30 个循环ꎬ72 ℃ 终延伸 10 minꎮ 先将胶回收且 Submission 软 件 ( https: / / meme ̄suite. org / / meme / )
与 pMD18 ̄T Vector 载体相连[宝日医生物技术( 北 分析蛋白的保守结构域和保守基序(motif)ꎮ
京)有限公司]ꎬ再将连接产物转入到大肠杆菌感 1.2.4 REVEILLE 7 ̄like 基因的表达量分析 由生工
受态细胞ꎬ培养 14 h 挑单菌落摇 14 h 后进行菌液 生物工程( 上海) 股份有限公司合成 REVEILLE 7 ̄
PCRꎬ条带位置正确ꎬ提质粒ꎬ送宝日医生物技术 like 基因的 qRT ̄PCR 引物ꎬ以及内参基因 Actin 引
TM
(北京)公司测序ꎮ 物(表 1)ꎬ根据 TB Green Premix Ex Taq 说明书设
1.2.3 REVEILLE 7 ̄like 蛋白的生物信息学分析 计 20 μL 反应体系ꎬ反应程序如下:95 ℃ 预变性
用 ProtParam 在 线 网 站 ( http: / / web. expasy. org / 30 sꎬ95 ℃ 变性 5 s、60 ℃ 退火延伸 34 sꎬ共 40 个
cgi ̄bin / protparam / ) 分析 REVEILLE 7 ̄like 蛋白的 循环ꎮ 设 置 3 次 生 物 学 重 复ꎬ 采 用 2 -△△Ct 法 和
分子量、等电点等理化性质ꎻ用 Clustal Omega 在线 SPSS 软件对实验数据进行分析和处理ꎮ
表 1 实验所用引物
Table 1 Primers used in this study
引物 序列 (5′-3′) 用途
Primer Sequence (5′-3′) Purpose
REVEILLE 7 ̄like ̄1F ATGGCTCGTTTTCAGGAAACCAA 克隆基因全长
REVEILLE 7 ̄like ̄1R TTACAAGCAGAGCCTGGTCATCTCT Full ̄length cloning
REVEILLE 7 ̄like ̄2F AGGTCAACAGCACCAGCAACAG 实时荧光定量 PCR
REVEILLE 7 ̄like ̄2R GGGCTCACACGCTCTCTCAAAC qRT ̄PCR
TaActin ̄F CCTTAGTACCTTCCAACAGATGT 实时荧光定量 PCR 内参基因
TaActin ̄R CCAGACAACTCGCAACTTAGA Reference gene of qRT ̄PCR
2.2 REVEILLE 7 ̄like 基因编码蛋白质的生物信息
2 结果与分析 学分析
2.2.1 REVEILLE 7 ̄like 蛋白的系统进化分析和 motif
2.1 REVEILLE 7 ̄like 基因的克隆及序列分析 预测 图 2 为 小 麦 ( Triticum aestivum) 与 节 节 麦
用反转录获得的 cDNA 作为模板ꎬ将表 1 中 (Aegilops tauschii)、二粒小麦(Triticum dicoccoides)、
的 REVEILLE 7 ̄like 1F 和 REVEILLE 7 ̄like ̄1R 引 乌拉图小麦(T. urartu)、大麦(Hordeum vulgare)、黑
物进行 PCR 扩增ꎬ可得到 1 251 bp 左右的条带 麦草(Lolium perenne)、硬直黑麦草(L. rigidum)、二
( 图 1 ) ꎬ 将 序 列 提 交 到 NCBI 上 比 对 可 知ꎬ 穗短柄草 ( Brachypodium distachyon)、谷子 ( Setaria
REVEILLE 7 ̄like 基因序列全长 1 735 bpꎬ开放阅 italica var. germanica)、柳枝稷( Panicum virgatum)
读框( open reading frameꎬORF) 1 251 bpꎬ共编码 REVEILLE 7 ̄like 蛋白的系统发育树ꎮ 由图 2 可知ꎬ
416 个氨基酸ꎮ 小麦的 REVEILLE 7 ̄like 蛋白和节节麦、 二粒小麦

