Page 88 - 《广西植物》2020年第12期

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朱晓林ᖔ 魏小红ᖔ 王宝强ᖔ 等঎ 沙特番茄黄化曲叶病毒 ዛࣷ԰ 基因编码蛋白的生物信息学分析 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ ԰ԡ԰ԡᖔ ࿗ԡྉϟ԰ɯ᧥ ϟᎮᎮሕͱϟᎮऐԡ঎
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沙特番茄黄化曲叶病毒 ዛࣷԣ 基因

编码蛋白的生物信息学分析

朱晓林ᕷ 魏小红 ᕷ 王宝强ᕷ 冯জ 悦ᕷ 赵耀东
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ྉ 甘肃农业大学 生命科学技术学院ᖔ 兰州 ᎮሕԡԡᎮԡ ɯ
摘জ 要ᧅ 该试验旨在通过生物信息学方法分析沙特番茄黄化曲叶病毒 ዛࣷ԰ 基因编码的转录激活蛋白 ఋʢዶ۪
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的一级结构ܦ二级结构ܦ磷酸位点ܦ糖基位点ܦ三级结构及其重要的功能ଫ通过最大似然法对不同物种 ዛࣷ԰ 基
因编码蛋白序列构建系统发育树ᖔ进行系统发育分析ᤥ 结果表明᧥番茄中 ዛࣷ԰ 基因共编码 ϟሕጢ 个氨基酸ᖔ且
编码蛋白属于不稳定的亲水性蛋白质ଫ二级结构以无规则卷曲折叠为主ᖔ比例为 ጢऐ঎ጢ԰ᠮଫ该蛋白不存在跨
膜结构域ᖔ属非跨膜蛋白且不存在信号肽ଫ该蛋白 ϟ ጲ ϟ԰ँ 个氨基酸区域为双生病毒超基因家族 ྉ᥈ᔀቝᔽႿᔽᡸ
ዶᓂ԰ ༁ࣼᡱᔀʢ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃɯ 结构域ଫ系统进化情况和植物分类学基本一致ᖔ沙特番茄双生病毒 ዛࣷ԰ 基因与南非木薯间
的亲缘关系最近ᤥ 该基因编码蛋白结构与功能的分析为进一步研究 ዛࣷ԰ 双生病毒基因家族奠定了基础ᖔ同
时为番茄抗病在病虫害防治方面提供一种可行的思路ᤥ
关键词ᧅ 沙特番茄黄化曲叶病毒ᖔ ዛࣷ԰ 基因ᖔ 转录激活蛋白ᖔ 生物信息学
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶ
文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰ԡɯϟ԰᥋ϟᎮᎮሕ᥋ԡऐ 开放科学ྉ资源服务ɯ标识码ྉ᧣୒ᧇᦵɯ᧥

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收稿日期ᧅ ԰ԡϟँͱԡᤃͱԡऐ
基金项目ᧅ 国家自然科学基金ྉሕϟጢᤃԡᤃᤃሕɯ Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ શᑕᡷᔽᆍႿᑕ᤟ શᑕᡷࣼʢᑕ᤟ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ èᆍࣼႿʛᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ऊၤᔽႿᑕ ྉሕϟጢᤃԡᤃᤃሕɯ૒ᤥ
作者简介ᧅ 朱晓林ྉϟँँᤃͱɯᖔ男ᖔ甘肃临潭人ᖔ硕士研究生ᖔ研究方向为植物生态生理ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ԰࿗԰ऐ࿗ँऐϟऐሕ݀ ीी঎ዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 魏小红ᖔ教授ᖔ博士研究生导师ᖔ主要从事植物生理与分子生理方面研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ औᔀᔽ଴ၤ݀ ੫༁ᑕࣼ঎ᔀʛࣼ঎ዹႿᤥ