Page 94 - 《广西植物》2020年第12期

ϟ԰ 期 朱晓林等᧥ 沙特番茄黄化曲叶病毒 ዛࣷ԰ 基因编码蛋白的生物信息学分析 ϟ Ꭾ Ꭾ ँ

图 ऐজ 系统进化树构建结果

èᔽ੫঎ ऐজ ኏ᔀ༁ࣼ᤟ᡷ༁ ᆍ஦ ༁ᢃ༁ᡷᔀቝ ᔀ׹ᆍ᤟ࣼᡷᔽᆍႿ ᡷʢᔀᔀ ዹᆍႿ༁ᡷʢࣼዹᡷᔽᆍႿ

性较低ᖔዛࣷ԰ 基因存在时ᖔ病毒链基因启动子活性 的表达ᖔ为番茄抗病育种提供可行的思路ᤥ
显著增强ᖔ 从而使病毒高效复制 ྉାʢᆍࣼ੫ၤ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ 本研究中 ዛࣷ԰ 基因编码产物共含 ϟሕጢ 个氨基
ϟँँ԰ɯᤥ 同时导致 ዛࣷ԰ 激活病毒链基因启动子复 酸ᖔ其中丝氨酸含量最高ᖔ该氨基酸含量的高低与
杂性的另一个可能因素是病毒链基因启动子的活 蛋白亲水性有密切关联ᖔ同时该蛋白不稳定系数高
性受时空调控ᖔ具有发育阶段特异性和组织特异 达 ᤃϟ঎ሕᎮᖔ因此其属于不稳定的亲水性蛋白质ᤥ ዛࣷ԰
性ྉ ୩ࣼႿᡷᔀʢ ᪲ ାᔽ༁ᑕʢᆍᖔ ϟँँᎮɯ ᤥ 而在该病毒入侵植 基因编码蛋白的二级结构以 ም᥋螺旋和无规卷曲为
物时ᖔዛࣷ԰ 基因编码的转录激活蛋白在其病毒自 主ᖔ存在 ԰ 个二硫键ᖔ这与该蛋白分子对抗外界因素
我复制中发挥了很重要的作用ᖔ已发现在烟草中 影响的不稳定性有很大关系ᤥ 该基因编码蛋白是
ዛࣷ԰ 基因能产生严重的影响ᖔ使烟草属植物的叶 一种转录激活因子ᖔ其结构不存在跨膜区ᖔ即不属
组织发育不全ྉ ୩ᔽʛʛᔽीࣼᔽ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡऐɯᤥ ዛࣷ԰ 编码 于定位于生物膜的膜蛋白ᤥ 该编码蛋白含有 ϟ 个双
的蛋白可作为植物体内寄主 ኏શዶ 沉默的抑制子ᖔ 生病毒超家族结构域ᖔ其在细胞被运输以及结合嘌
而寄主 ኏શዶ 沉默是植物抵御病毒入侵的有效手 呤和嘧啶中起关键的作用ᖔ同时在细胞信号转导中
段ᖔ因此抑制 ዛࣷ԰ 基因编码产物是防止病毒在植 发挥作用ᤥ 沙特番茄黄化曲叶病毒基因与南非木
物体内传播的有效途径ᤥ 本研究对沙特番茄黄化 薯间的亲缘关系最为密切ᖔ其次是棉花ܦ番木瓜ܦ海
曲叶病毒基因编码的 ఋʢዶ۪ 蛋白序列的一级ܦ二 南番茄ܦ胡椒ܦ云南番茄ܦ台湾番茄ܦ云南烟草ܦ土
级ܦ三级结构以及功能分类等进行预测及分析ᖔ该 豆ܦ豆类ܦ卷心菜ܦ甘薯ᤥ 由各物种同源性高于 ԰ጢᠮ
结果为研究 ዛࣷ԰ 基因及其编码产物的结构和功能 就可判断其功能上的相似性ྉ᥈ᑕʢႿᔽᔀʢ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ϟँँᤃɯᤥ
提供了更多的信息ᖔ同时对 ዛࣷ԰ 基因进行全面的 这种同源性一方面体现出各物种间的亲缘关系ᖔ另
生物信息学分析ᖔ以期通过分子手段抑制其基因 一方面也表明各个物种的 ዛࣷ԰ 基因编码产物在结