Page 44 - 《广西植物）》2021年第1期
P. 44
၊ᡙᡙᡓ᧥ᣑ ᣑ ँँँॹࣩᔠ၊ᐹᔠᐹͱᢝᅳࣩʗႥᐹᤀॹዞᅳቂ
জ ᤩࣩᔠ၊ᐹᔠᐹজ ȮᑕႿ ԡϟᖔ ϓྉϟɯ᧥ ࿗ԡͱጢ࿗
ᦵ᧣ᧇᧅ ϓԔॹϓϓ࣮ᇺϓᣑ ࣩᔠ၊ᐹᔠᐹॹଝऊँԣԔԣԔԔᣤԔ᎒
申长卫ᖔ 袁敬平 南瓜 ୩ۼጶጶఋ 蛋白家族的全基因组鉴定与进化分析 ЏȮ 广西植物ᖔ ԡϟᖔ ࿗ϟྉϟɯ᧥ ࿗ԡͱጢ࿗
୩̀ጶશ ऊۼᖔ ɟВዶશ Ȯ۪ ᥈ᔀႿᆍቝᔀ᥋औᔽʛᔀ ᔽʛᔀႿᡷᔽᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᑕႿʛ ᡱၤᢃᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ୩ۼጶጶఋ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᑕቝᔽᢃ ᔽႿ ᡱࣼቝᡱҴᔽႿ Џ Ȯ
᥈ࣼᔽၤᑕᔽᑕᖔ ԡϟᖔ ࿗ϟྉϟɯ᧥ ࿗ԡͱጢ࿗
南瓜 ۩ጛጛ௴ 蛋白家族的全基因组鉴定与进化分析
申长卫 ᕷ 袁敬平 ᕷሕ᥍
ϟ
ྉϟ 河南科技学院 资源与环境学院ᖔ 河南 新乡 ࿗ጢሕԡԡሕଫ 河南科技学院 园艺园林学院ᖔ 河南 新乡 ࿗ጢሕԡԡሕଫ
ሕ 河南省特色园艺植物开发利用工程技术研究中心ᖔ 河南 新乡 ࿗ጢሕԡԡሕ ɯ
摘জ 要ᧅ ୩ۼጶጶఋྉ༁ࣼ੫ᑕʢ औᔽ ᔀᔀႿᡷࣼᑕᢃ ᤦᔀ ᔀᡱᆍʢᡷᔀʛ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷᔀʢɯ家族是一种新型的糖转运体ᖔ该家族基因在碳水
化合物运输ܦ发育ܦ环境适应性和寄主ͱ病原相互作用等多个过程中发挥着重要作用ᤥ 为更好地了解南瓜发
育的分子机理ᖔ该研究基于已知的南瓜基因组数据库ᖔ利用生物信息学方法对中国南瓜 ۩ጛጛ௴ 基因
ྉࣷቂ۩ጛጛ௴ɯ的系统发育树ܦ基因结构ܦ跨膜结构ܦ保守基序ܦ启动子预测ܦ共线性预测和基因复制等进行综
合分析ᤥ 结果表明᧥共鉴定到 ϟ 个 ࣷቂ۩ጛጛ௴ 基因ᖔ通过系统发育分析将 ϟ 个 ࣷቂ۩ጛጛ௴ 基因分为 ࿗ 个亚
族ྉ᧧ᖔ᧧᧧ᖔ᧧᧧᧧ 和 ᧧ɯᖔ分别包含 ሕܦጢܦϟԡ 和 ሕ 个基因ᤥ 此外ᖔ通过基因结构ܦ跨膜结构域和保守基序发现
ࣷቂ۩ጛጛ௴ 在进化过程中是非常保守的ᤥ 染色体定位结果显示ᖔࣷቂ۩ጛጛ௴ 基因不均匀地分布在 ϟ 条中国
南瓜染色体中的 ϟሕ 条染色体上ᖔ且在染色体 ऊቝԡԡܦऊቝԡϟܦऊቝԡሕܦऊቝԡጢܦऊቝԡᎮܦऊቝԡँܦऊቝϟँ 和 ऊቝԡ 上不存
在ᤥ 启动子顺式作用元件分析显示ᖔࣷቂ۩ጛጛ௴ 基因与植物激素ྉ脱落酸ܦ茉莉酸甲酯ܦ水杨酸和生长素ɯ 响
应有关ᖔ也可能参与各种环境胁迫的响应ᤥ 从系统进化发育树和基因共线性方面揭示了 ࣷቂ۩ጛጛ௴ 基因与
印度南瓜 ۩ጛጛ௴ྉࣷቂᐹ۩ጛጛ௴ɯ之间的进化关系ᤥ 该研究在全基因组水平上系统地鉴定了中国南瓜中
۩ጛጛ௴ 基因家族ᖔ为进一步了解中国南瓜和其他葫芦科作物 ۩ጛጛ௴ 基因提供了基础ᖔ也为进一步的功能分
析提供了重要的候选基因ᤥ
关键词ᧅ 南瓜ᖔ ୩ۼጶጶఋᖔ 系统发育分析ᖔ 共线性ᖔ 顺式作用元件ᖔ 生物信息学
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ϟজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡϟɯԡϟ᥋ԡԡ࿗ԡ᥋ϟጢ
ᤩᓣႥᅳቂᓣँᔠʐᓣ ᔠʐᓣႥᡙᔠஏᔠዞᐹᡙᔠᅳႥ ᐹႥʐ ᡓ၊ᡥᤀᅳᓣႥᓣᡙᔠዞ ᐹႥᐹᤀᡥᔠ
ᅳஏ ۩ጛጛ௴ ᡓʗᅳᡙᓣᔠႥ ஏᐹቂᔠᤀᡥ ᔠႥ ᡓࣩቂᡓҧᔠႥ
ϟ ᖔሕ᥍
୩̀ጶશ ऊၤᑕႿ੫औᔀᔽ ᖔ ɟВዶશ ȮᔽႿ੫ᡱᔽႿ੫
ྉϟ ዞ၊ᅳᅳᤀ ᅳஏ ቴᓣᅳࣩʗዞᓣ ᐹႥʐ ጛႥצᔠʗᅳႥቂᓣႥᡙᐹᤀ ዞᔠᓣႥዞᓣᖔ ̵ᓣႥᐹႥ ᧇႥᡙᔠᡙࣩᡙᓣ ᅳஏ ዞᔠᓣႥዞᓣ ᐹႥʐ ௴ᓣዞ၊Ⴅᅳᤀᅳᡥᖔ ᣮᔽႿᔽᑕႿ੫ ࿗ጢሕԡԡሕᖔ ̀ᔀႿᑕႿᖔ ऊၤᔽႿᑕଫ ዞ၊ᅳᅳᤀ ᅳஏ
̵ᅳʗᡙᔠዞࣩᤀᡙࣩʗᓣ ᐹႥʐ ᒦᐹႥʐዞᐹᡓᓣ ዛʗዞ၊ᔠᡙᓣዞᡙࣩʗᓣᖔ ̵ᓣႥᐹႥ ᧇႥᡙᔠᡙࣩᡙᓣ ᅳஏ ዞᔠᓣႥዞᓣ ᐹႥʐ ௴ᓣዞ၊Ⴅᅳᤀᅳᡥᖔ ᣮᔽႿᔽᑕႿ੫ ࿗ጢሕԡԡሕᖔ ̀ᔀႿᑕႿᖔ ऊၤᔽႿᑕଫ ሕ ̵ᓣႥᐹႥ ጛႥᔠႥᓣᓣʗᔠႥ
ቴᓣᓣᐹʗዞ၊ ࣷᓣႥᡙᓣʗ ᅳஏ ᡙ၊ᓣ ᦵᓣצᓣᤀᅳᡓቂᓣႥᡙ ᐹႥʐ ІᡙᔠᤀᔠऊᐹᡙᔠᅳႥ ᅳஏ ࣷ၊ᐹʗᐹዞᡙᓣʗᔠᡙᔠዞ ̵ᅳʗᡙᔠዞࣩᤀᡙࣩʗᐹᤀ ۗᤀᐹႥᡙᖔ ᣮᔽႿᔽᑕႿ੫ ࿗ጢሕԡԡሕᖔ ̀ᔀႿᑕႿᖔ ऊၤᔽႿᑕ ɯ
收稿日期ᧅ ԡԡͱԡँͱ
基金项目ᧅ 河南省科技攻关项目 ྉ ԡϟԡϟϟԡϟጢँɯଫ河南科技学院高层次人才引进启动项目 ྉ ϟԡሕԡϟԡᤃԡԡԡϟ ᣰ ԡϟጢᖔ ԡϟᎮԡሕ࿗ɯ
Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ ᑕႿʛ ఋᔀዹၤႿᆍᆍ੫ᢃ ۪ʢᆍ੫ʢᑕቝ ᆍ ̀ᔀႿᑕႿ ۪ʢᆍᔽႿዹᔀ ྉԡϟԡϟϟԡϟጢँɯଫᡷၤᔀ ୩ዹᔽᔀႿᡷᔽᔽዹ ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ èᆍࣼႿʛᑕᡷᔽᆍႿ ᆍʢ ̀ᔽ੫ၤ᥋ᔀᔀ
ఋᑕᔀႿᡷ ʢᆍቝ ̀ᔀႿᑕႿ ᧧Ⴟ༁ᡷᔽᡷࣼᡷᔀ ᆍ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ ᑕႿʛ ఋᔀዹၤႿᆍᆍ੫ᢃ ྉϟԡሕԡϟԡᤃԡԡԡϟ ᣰ ԡϟጢᖔ ԡϟᎮԡሕ࿗ɯᤥ
作者简介ᧅ 申长卫ྉϟँऐᤃͱɯᖔ博士ᖔ讲师ᖔ主要从事植物营养与分子生物学的研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯዹၤᑕႿ੫औᔀᔽ༁ၤᔀႿ݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ
᥍
通信作者ᧅ 袁敬平ᖔ博士ᖔ讲师ᖔ研究方向为生物信息学与分子生物学研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯᢼᡱᢃࣼᑕႿᤃᤃᤃ݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ
