Page 50 - 《广西植物）》2021年第1期
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࿗ ᤃ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
表 ԣই ۩ጛጛ௴ 同源基因对的比对结果和复制基因对的分化时间
ఋᑕᤦᔀ জ ାᑕ༁ᡷ ʢᔀ༁ࣼᡷ༁ ᆍ ۩ጛጛ௴ ၤᆍቝᆍᆍ੫ᆍࣼ༁ ੫ᔀႿᔀ ᡱᑕᔽʢ༁ ᑕႿʛ ʛᔽᔀʢ੫ᔀႿዹᔀ ᡷᔽቝᔀ ᆍʢ ᡷၤᔀ ʛࣼᡱᔽዹᑕᡷᔀʛ ੫ᔀႿᔀ ᡱᑕᔽʢ༁
较大
基因的 基因比对
间隙开口 比对长度 进化时间
一致性 错配 长度 覆盖率 非同义 同义
基因标识符 ᥈ᑕᡱ ዶᔽ੫ႿቝᔀႿᡷ 比值 ᧕ᔽᔀʢ੫ᔀႿዹᔀ
᧧ʛᔀႿᡷᔽᡷᢃ ᥘᔽ༁ቝᑕᡷዹၤᔀ༁ ᓂᔀႿ੫ᡷၤ ᥈ᔀႿᔀ 替换率 替换率
᥈ᔀႿᔀ ᧧᧕ ᆍᡱᔀႿᔽႿ੫ ᔀႿ੫ᡷၤ ᣞᐹᣰ ᣞ ᡷᔽቝᔀ
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জ 注᧥શ 表示没有ᤥ 下同ᤥ
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图 জ 中国南瓜 ୩ۼጶጶఋ 蛋白的跨膜结构模式图
èᔽ੫ জ ۪ᑕᡷᡷᔀʢႿ ʛᔽᑕ੫ʢᑕቝ ᆍ ᡷၤᔀ ᡷʢᑕႿ༁ቝᔀቝᤦʢᑕႿᔀ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᆍ ࣩࣷዞࣩʗᤇᔠᡙᐹ ቂᅳዞ၊ᐹᡙᐹ ୩ۼጶጶఋ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ༁
ዶᡷ୩ۼጶጶఋϟᎮଫ ऊቝ୩ۼጶጶఋᎮᑕ 对应 ዶᡷ୩ۼጶጶఋᎮଫ 印度南瓜 ୩ۼጶጶఋ 蛋白ᤥ 从综合来看ᖔ两个栽培种
ऊቝ୩ۼጶጶఋሕ 对应 ዶᡷ୩ۼጶጶఋሕᤥ 图 Ꭾ 结果 显 示ᖔ ୩ۼጶጶఋ 蛋白系统进化相对保守ᤥ
ऊቝ୩ۼጶጶఋँ 分别与 ऊቝ୩ۼጶጶఋጢᑕ 和 ऊቝ୩ۼጶጶఋϟᑕଫ ԣॹ᎒ 中国南瓜与印度南瓜和拟南芥 ۩ጛጛ௴ 基因的
ऊቝ୩ۼጶጶఋϟᎮᑕ 分别与 ऊቝ୩ۼጶጶఋϟᑕܦ ऊቝ୩ۼጶጶఋሕ 共线性分析
和 ऊቝ୩ۼጶጶఋᎮᑕ 存在互作关系ᤥ 利用 ఋାᡷᆍᆍ༁ 工具获取 ࣷቂ۩ጛጛ௴ 基因在
ԣॹᣤ 中国南瓜与印度南瓜 ۩ጛጛ௴ 蛋白系统发育 ࣷቂᐹ۩ጛጛ௴ 和 ዛᡙ۩ጛጛ௴ 基因中的共线性基因ᖔ并
分析 对这些共线性关系进行了统计ᤥ 图 ँ 结果表明ᖔ
采用与中国南瓜相同的方法ᖔ从印度南瓜基 中国南瓜与印度南瓜 ۩ጛጛ௴ 的共线性基因对数
因组中共鉴定到 ϟँ 个 ࣷቂᐹ۩ጛጛ௴ 基因 ྉ 表 ሕɯᤥ 目ྉϟऐɯ大于中国南瓜与拟南芥的共线性基因对数
根据拟南芥的同源基因命名了 ϟँ 个 ࣷቂᐹ۩ጛጛ௴ 目ྉϟɯᤥ 此外ᖔ统计中国南瓜 ۩ጛጛ௴ 基因在印度
基因ᤥ 无根进化树显示 ϟँ 个 ऊቝᑕ୩ۼጶጶఋ 被分为 南瓜和拟南芥中的拷贝数的结果ྉ 图 ँᖔ表 ࿗ɯ 发
࿗ 个大分支ᖔ与前面中国南瓜 ୩ۼጶጶఋ 的分类一致 现ᖔࣷቂ۩ጛጛ௴ϟԡᐹ 和 ࣷቂ۩ጛጛ௴ϟԡᤇ 对应印度南瓜
ྉ 图 ऐɯᤥ 其中ᖔ 在 ऊቝᑕ୩ۼጶጶఋ 中ᖔ 中国南瓜 ϟ 个 ۩ጛጛ௴ 基因ྉࣷቂᐹ۩ጛጛ௴ϟԡɯଫዛᡙ۩ጛጛ௴ϟ 对应
୩ۼጶጶఋ 家族中第 ᧧ 亚族成员又被分为 ሕ 个小分 ࣷቂ۩ጛጛ௴ϟᐹ 和 ࣷቂ۩ጛጛ௴ϟᤇଫ ዛᡙ۩ጛጛ௴ϟԡ 对应
支ᤥ 每个大分支都包含中国南瓜 ୩ۼጶጶఋ 蛋白和 ࣷቂ۩ጛጛ௴ϟԡᐹ 和 ࣷቂ۩ጛጛ௴ϟዞ 两个基因ଫ
