Page 79 - 《广西植物）》2021年第1期

ϟ 期 王 雪 芹 等 ᧥ 基于叶绿体基因组探讨桃金娘目及其近缘类群的系统发育关系 Ꭾ ጢ

数字代表分支的靴代值 ା୩ଫ 靴代值为 ϟԡԡ 的不显示ᤥ 下同ᤥ
શᆍʛᔀ༁ ᑕʢᔀ ᤟ᑕᤦᔀ᤟ᔀʛ औᔽᡷၤ ቝᑕ଴ᔽቝࣼቝ ᤟ᔽҴᔀ᤟ᔽၤᆍᆍʛ ᤦᆍᆍᡷ༁ᡷʢᑕᡱ ༁ࣼᡱᡱᆍʢᡷଫ શᆍʛᔀ༁ औᔽᡷၤ ϟԡԡᠮ ᤦᆍᆍᡷ༁ᡷʢᑕᡱ ༁ࣼᡱᡱᆍʢᡷ ᔽႿ ᡷၤᔀ ቝᑕ଴ᔽቝࣼቝ ᤟ᔽҴᔀ᤟ᔽၤᆍᆍʛ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᑕʢᔀ
ࣼႿ᤟ᑕᤦᔀ᤟ᔀʛ঎ ఋၤᔀ ༁ᑕቝᔀ ᤦᔀ᤟ᆍऔ঎
图 ሕজ 基于不同矩阵构建的桃金娘目和牻牛儿苗目的最大似然ྉᥘᓂɯ树
èᔽ੫঎ ሕজ ᥘᑕ଴ᔽቝࣼቝ ᤟ᔽҴᔀ᤟ᔽၤᆍᆍʛ ྉᥘᓂɯ ᆍ஦ ᡱၤᢃ᤟ᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᡷʢᔀᔀ ᆍ஦ ᥘᢃʢᡷᑕ᤟ᔀ༁ ᑕႿʛ ᥈ᔀʢᑕႿᔽᑕ᤟ᔀ༁ ᤦᑕ༁ᔀʛ ᆍႿ ʛᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ʛᑕᡷᑕ༁ᔀᡷ༁

小ᖔ随着分类单元的增大ᖔ其变异程度往往提高ᤥ 系统位置一直为研究者所关注ྉ ۼᑕႿ੫ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡԡँଫ
牻牛儿苗科物种的叶绿体基因组发生过高度的基 ୩ᆍ᤟ᡷᔽ༁ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟϟɯᤥ 本研究基于叶绿体基因组数
因重排ྉା᤟ᑕझᔽᔀʢ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟϟɯᖔ基因组序列当中的基 据证实了桃金娘目和牻牛儿苗目的姐妹群关系
因顺序在不同物种间差异较大ᖔ导致全基因组序 ྉା୩ ᢉ ϟԡԡᠮଫ۪۪ ᢉ ϟ঎ԡɯᤥ

列比对时ᖔ同一个基因重复出现在基因组的不同 使君子科隶属于桃金娘目ᖔ形态学及分子系
位置ᤥ 第二ᖔ基因间隔区的序列变异水平比蛋白 统学证据均不能确认其系统位置ᖔ最近的研究结
质编码基因要高ᖔ随着分类单元的扩大ᖔ如目级水 果表明其可能与柳叶菜科շ千屈菜科的关系较近
平ᖔ可能由于基因间隔区的序列变异程度太高而 ྉ୩ᆍ᤟ᡷᔽ༁ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟϟɯᤥ 本研究中ᖔ基于 ϟሕँ 条序列
导致序列比对困难ᤥ 因此ᖔ已有的研究当中ᖔ叶绿 的矩阵ྉ桃金娘目ܦ牻牛儿苗目及外类群的蛋白质
体基因组数据应用于目级水平ᖔ如石竹目ྉᓂᔽࣼ ᔀᡷ 编码基因ɯ 分析的结果表明ᖔ使君子科与柳叶菜
ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟऐɯܦ 姜目 ྉ ۼࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟऐɯ 和虎耳 草 目 科շ千屈菜科的关系较近ᖔ为姐妹群ᖔ获得较高支
ྉ᧕ᆍႿ੫ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟऐɯ等均采用蛋白质编码基因而非 持率ྉା୩ ᢉ ँሕᠮଫ۪۪ ᢉ ϟ঎ԡԡɯᖔ进一步ᖔ对仅包括桃

全基因组序列ᤥ 金娘目的两个数据集ྉϟԡሕ 条序列的叶绿体基因组
ᇺॹԣ 桃金娘目及其近缘类群的系统发育关系 与蛋白质编码基因ɯ 的分析结果均支持使君子科
桃金娘目和牻牛儿苗目均隶属于蔷薇支ᖔ其 与柳叶菜科շ千屈菜科的姐妹群关系ྉା୩ ᢉ ϟԡԡᠮଫ