Page 71 - 《广西植物》2021年第4期

࿗ 期 郑威等᧥ 龙眼 ᦵᤀۗ୒ɔ 基因在根和叶中的表达及其生物信息学分析 ጢ ጢ ሕ
结合位点为 ሕ࿗࿗۪ၤᔀ 和 ሕ࿗Ꭾᓂᢃ༁ྉ图 ϟϟɯᤥ 胡萝卜素脱氢酶ɯܦᓂВఋ԰ྉ 番茄红素 ቶ 环化酶ɯܦԻ᥋
᧧୩ᨃྉჄ᥋胡萝卜素异构酶ɯܦᓂɟऊྉ 番茄红素 Ꮗ 环化
酶ɯܦዶାዶϟྉ玉米黄质环氧酶ɯܦऊ኏ఋ᧧୩ᨃྉ番茄红素
异构 酶ɯܦ ۪᧕୩ሕ ྉ ϟጢ᥋顺 式 八 氢 番茄红素去饱和
酶ɯܦ᥈᥈۪୩ϟྉ牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶大亚

基 ϟɯܦ᧕ᣮ኏ྉϟ᥋脱氧᥋᧕᥋木糖 ጢ᥋磷酸还原异构酶ɯ 和
ऊᓂዶϟྉϟ᥋脱氧᥋᧕᥋木酮糖᥋ጢ᥋磷酸合成酶ɯ 具有相互
作用ᤥ
ԣॹ࣮ ᦵᤀۗ୒ɔ 基因在龙眼根和叶中的差异表达分析
采用实时荧光定量 ۪ऊ኏ 技术ྉ኏ఋ᥋ी۪ऊ኏ɯ分析
从龙眼转录组数据中筛选获得的 ᦵᤀۗ୒ɔ 基因在根
和叶中的相对表达量ᖔ结果如图 ϟጢ 所示ᤥ ᦵᤀۗ୒ɔ
基因在龙眼根和叶中均有表达ᖔ叶中的表达量高

于其在根中的表达量ᤥ

ሕজ 讨论与结论
图 ँজ ୩ۼ᧧୩୩᥋ᥘᨃ᧕ጶᓂ 对 ᧕᤟۪୩ɟ 蛋白三级结构的预测
èᔽ੫঎ ँজ ۪ʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ᡷၤᔀ ᡷᔀʢᡷᔽᑕʢᢃ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᆍ஦
类胡萝卜素是植物中的一类重要的次生代谢
᧕᤟۪୩ɟ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᤦᢃ ୩ۼ᧧୩୩᥋ᥘᨃ᧕ጶᓂ
产物ᖔ属 于 亲 脂 性 类异戊二烯化合物 ྉۼᑕ᤟ᡷᔀʢ ᪲
୩ᡷʢᑕዹҴᖔ԰ԡϟϟɯᖔ其合成途径在很多植物中给予了详
ԣॹ᎒ ۗ୒ɔ 序列比对及系统进化树的构建
细的介绍ᤥ ۗ୒ɔ 基因是类胡萝卜素合成途径中的
应用 ାᔽᆍᔀʛᔽᡷ 对黄水仙 ྉ ᣮᎮऐऐϟ࿗ ɯܦ 胡椒
首个合成酶基因ᖔ起到限速的作用ᖔ影响类胡萝卜
ྉ ᣮᤃऐԡϟᎮ ɯܦ 番茄 ྉ ᣽ऊᎮᤃᎮऐ࿗Ꭾ঎ ϟ ɯܦ 拟南芥
素在 植物组织中的积 累 ྉ ԻၤᑕႿ੫ ᪲ ᧕ࣼᤦዹᆍ׹༁Ҵᢃᖔ
ྉᓂ԰ጢऐϟ԰ɯܦ水稻ྉ ዶɟ࿗ጢ԰Ꭾᤃऐɯܦ柑橘ྉ ዶèϟጢ԰ऐँ԰ɯܦ
԰ԡϟϟɯᤥ 在本研究中ᖔ我们根据龙眼转录组数据筛
柿子ྉ èȮጢँ࿗࿗ऐጢ঎ ϟɯܦ柚子ྉ ᣽۪࿗ᤃ԰Ꭾ԰ᤃ঎ ϟɯܦ向日葵
选获得一个 ᦵᤀۗ୒ɔ 基因ᖔ编码 ࿗԰ԡ 个氨基酸ᤥ 生
ྉ ऊዶऊ԰Ꭾሕऐሕ঎ ϟ ɯܦ 草莓 ྉ ዶऊ኏ᤃϟሕँ԰঎ ϟ ɯܦ 甜瓜
物信息学分析表明ᖔ该蛋白为碱性不稳定蛋白ᖔ不
ྉ ዶጶ̀ԡሕϟँँ঎ ϟ ɯܦ 枸杞 ྉ ዶዶۼऐऐሕऐሕ঎ ϟ ɯܦ 广藿香 存在跨膜区ᖔ具有可溶和亲水的特性ᖔ存在于膜

ྉዶ̀Ȯँԡ࿗ሕϟ঎ ϟ ɯܦ 芒果 ྉ Ȯ͐԰ᎮᎮᎮϟᤃ঎ ϟ ɯܦ 温州蜜柑 外ᖔ二级结构主要为 ም᥋螺旋和无规则卷曲ᖔ本研究
ྉ ዶè԰԰ԡ԰ϟऐ঎ ϟ ɯܦ 苦瓜 ྉ ዶዶ኏ऐᤃϟԡ࿗঎ ϟ ɯ 和南瓜 结果与桃ܦ枇杷ܦ芒果等 ۪୩ɟ 蛋白一致ྉ黄建峰等ᖔ
ྉዶጶ᣽ऐᤃጢᤃ࿗঎ ϟɯ 的 ۪୩ɟ 蛋白进行序列 比 对 ྉ 图 ԰ԡϟᎮଫ梁敏华等ᖔ԰ԡϟऐଫ洪敏等ᖔ԰ԡϟऐɯᖔ推测不同植
ϟ԰ɯᖔ采用 ᥘጶ᥈ዶϟԡ 进行系统进化树 的 构 建 ྉ 图 物种属间 ۪୩ɟ 蛋白的亲疏水性ܦ蛋白质二级结构

ϟሕɯᖔ探索 ۪୩ɟ 蛋白在不同物种之间的进化关系ᤥ 等具有一定的保守性ᤥ 甘薯ܦ芥蓝等 ۪୩ɟ 蛋白主
结果表明ᖔ᧕᤟۪୩ɟ 与柑橘ܦ温州蜜柑ܦ柚子ܦ芒果的 要位于叶绿体中ᖔ直接在细胞器中发挥作用ଫ而龙

۪୩ɟ 同源性较高ᖔ推测它们来自同一个祖先ᖔ与甜 眼和芒果中的 ۪୩ɟ 主要位于膜外ᖔ推测其在细胞
瓜 ۪୩ɟ 的同源性较低ᖔ亲缘关系较远ᤥ 质中合成前体蛋白后ᖔ并未进入其他亚细胞器中ᖔ
ԣॹࣽ ᦵᤀۗ୒ɔ 蛋白互作关系 而是经过加工成为成熟的蛋白质后发挥作用ྉ 薛
应用 ୩ఋ኏᧧શ᥈ 交互式数据库构建候选蛋白与 生玲等ᖔ԰ԡϟᎮଫ程洁等ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ 蛋白质折叠时能够
相关蛋白的相互作用网络ᖔ分析预测与 ᧕᤟۪୩ɟ 相 形成亲水表面和疏水内核ᖔ并且在跨膜结构中存
互作用的蛋白ᤥ 选择拟南芥为模式植物ᖔ构建出 在高疏水区域ྉ 李卿等ᖔ԰ԡϟጢɯᤥ 本文对 ۪୩ɟ 蛋白

的蛋白互作结果如图 ϟ࿗ 所示ᤥ᧕᤟۪୩ɟ 与 Ի᧕୩ྉ Ⴤ᥋ 亲疏水性分析结果表明其不存在高疏水区域ᖔ 由