Page 81 - 《广西植物》2022年第11期

ϟϟ 期 刘营等᧥ 甘蔗 ୒ዞટቴዛ᤹ۗ 基因家族的鉴定与生物信息学分析 ϟ ऐ Ꭾ ሕ
表 ԣই 甘蔗 ટቴዛ᤹ۗ 蛋白二级结构组成 表 ᇺই 甘蔗 ୒ዞટቴዛ᤹ۗ 基因保守基序 ᤀᅳ੖ᅳ
及跨膜结构预测结果 ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ऊᆍႿ༁ᔀʢ׹ᑕᡷᔽ׹ᔀ ቝᆍᡷᔽ஦ ᤟ᆍ੫ᆍ ᆍ஦ ༁ࣼ੫ᑕʢዹᑕႿᔀ ୒ዞટቴዛ᤹ۗ ੫ᔀႿᔀ༁
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基序 ጶ 值 长度 序列标志
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跨膜 ቝᆍᡷᔽ஦ ϟ ᤃ঎԰ᔀ᥋ጢँ࿗ ሕऐ
延伸链 无规则 结构数
ም᥋螺旋 ጶ଴ᡷᔀႿ᥋ Ꮗ᥋转角 卷曲
蛋白 ᧧᧕ શࣼቝᤦᔀʢ
ም᥋ၤᔀ᤟ᔽ଴ ʛᔀʛ Ꮗ᥋ᡷࣼʢႿ ኏ᑕႿʛᆍቝ ቝᆍᡷᔽ஦ ԰ ሕ঎ጢᔀ᥋࿗࿗Ꭾ ԰ँ
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表达的调控和响应机制ᤥ 通过对启动子区域的顺
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式作用元件分析ᖔ可以得到植物关于响应特定生
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和抗逆响应因子ྉ ఋऊ᥋ʢᔽዹၤ ቝᆍᡷᔽ஦ɯ 等元件间的相互
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作用形成复杂的代谢调控网络来响应和应对重金
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属胁迫ᤥ 这与水稻 ટቴዛ᤹ۗ 基因受到 Ȯዶܦዶାዶ 等
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金属离子ᖔ从而参与植物的防御反应一致ྉԻၤᆍࣼ ᔀᡷ
ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ࿗ɯᤥ 在对甘蔗 ୒ዞટቴዛ᤹ۗ 基因上游 ሕ ԡԡԡ
蛋白同一亚家族的成员在功能上可能相似ᤥ 通过 ᤦᡱ 区域研究发现ᖔ成员中大部分均含有茉莉酸响
对甘蔗割手密ܦ水稻ܦ高粱ܦ玉米 ࿗ 种单子叶植物和 应元件ྉ ఋ᥈ዶऊ᥈᥋ቝᆍᡷᔽ஦ɯ 和生长素响应元件ྉఋ᥈ዶ᥋
拟南芥 ϟ 种双子叶植物的系统进化分析ᖔ可将 ԰ँ 个 ᔀ᤟ᔀቝᔀႿᡷɯᖔ推断该基因家族在进化过程中可能具有
与植 物生长和逆境 胁迫相关的功能ᤥ 甘蔗
୒ዞટቴዛ۪᤹ 家族成员分为 ሕ 个亚家族ᤥ 在亚家族ᎏ
中ᖔ进化树分支上只有高粱ྉጢ 位成员ɯܦ玉米 ྉᎮ 位 ୒ዞટቴዛ᤹ۗ 基 因 的 表 达具有组织特异性ᖔ 甘蔗
成员ɯ 和割手密ྉᤃ 位成员ɯ 的家族成员ᖔ没有水稻 ୒ዞટቴዛ᤹ۗ 基因 主要在特定组织和器官中表达ᖔ
和拟南芥的成员ᖔ推测甘蔗割手密 ટቴዛ᤹ۗ 亚家族 ୒໧ᡓᅳႥॹ ԡϟᤩԡԡ԰ጢऐ࿗ԡ᤬԰ଧ 和 ୒໧ᡓᅳႥॹ ԡϟᤩԡԡᤃϟԡऐԡ᤬ϟᦵ ԰
ᎏ中的这 ᤃ 位成员可能存在着与水稻和拟南芥的 位成员在种子发芽期的叶和茎中的表达量明显高
શ኏ዶᥘ۪ 蛋白家族不一样的特殊功能ᖔ而这个亚家 于其他时期ᤥ 对各时期和各组织高表达的基因分

族的特殊功能在高粱和玉米中却可能存在ᤥ 析发 现ᖔ 家族成员均具有 ᥘା୩ܦ ዶା኏ጶ 和 ఋऊዶ᥋
植物启动子作为植物功能基因表达调控的最 ᔀ᤟ᔀቝᔀႿᡷ 等与激素响应相关的作用元件ᖔ推测其参