Page 57 - 《广西植物》2022年第4期

࿗ 期 孙 爽 等 ᧥ 马尾松 ቴ԰ቴሕ᤬᤹ɔଧ 基因特征及进化和表达分析 ጢ ऐ ሕ
表 ϓই 荧光定量引物设计
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基因名称 正向引物 ྉጢࣕͱሕࣕɯ 反向引物 ྉጢࣕͱሕࣕɯ
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԰ԡϟᤃɯᤥ ͐᧧ዶ᥈ጶશ 的 ी኏ఋ᥋۪ऊ኏ 检测试剂盒进行荧 偏酸性ଫँ 个 ۪ቝᥘɟା༁ 蛋白 ᡱ᧧ᢦᎮᖔ为偏碱性ᤥ 不稳
光定量 分 析ᖔ 根据说明书配制反应体系ᤥी኏ఋ᥋ 定系数均大于 ࿗ԡᖔ属不稳定蛋白ᖔϟᎮ 个 ۪ቝᥘɟା༁
۪ऊ኏ 反应程序᧥ँጢ ቩ ԰ ቝᔽႿᖔϟ 个循环ଫँጢ ቩ ጢ ༁ᖔ 蛋白中ᖔ仅 ۪ቝᥘɟାᎮ 平均疏水值ᢦͱԡ঎ጢᖔ为亲水蛋
ᤃԡ ቩ ሕԡ ༁ᖔ࿗ԡ 个循环ᖔ每样品进行 ሕ 次技术重复ᤥ 白ᖔ其余均ጐͱԡ঎ጢᖔ为疏水蛋白ᤥ 所有基因亚细胞
ͱ᪵᪵ऊᡷ 法计算基因相对表达量ᖔ利用 ୩۪୩୩ 软 定位于细胞核ᖔ均无跨膜结构ྉ表 ԰ɯᤥ ۪ቝᥘɟା༁ 蛋
使用 ԰
件进行方差分析ᖔ用 ᥈ʢᑕᡱၤ۪ᑕʛ ۪ʢᔽ༁ቝ ऐ 软件作图ᤥ 白主要的二级结构为无规则卷曲ᖔ说明无规则卷
曲是 ۪ቝᥘɟା༁ 蛋白结构的主要组成部分ᖔ其次是
԰জ 结果与分析 ም 螺旋ᖔ而延伸链和 Ꮗ 转角相对较少ྉ表 ሕɯᤥ 利用
શᔀᡷ۪ၤᆍ༁ ሕ঎ϟ 预测 ۪ቝᥘɟା༁ 蛋白质磷酸化位点ᖔ结
ԣॹϓ ۗቂ᤹ɔଧ໧ 生物信息学分析 果表明ᖔ各基因均存在丝氨酸ܦ苏氨酸ܦ酪氨酸磷
԰঎ϟ঎ϟ ۪ቝᥘɟା༁ 理化性质分析জ 以前期转录组所得 酸化位点ᖔ且磷酸化位点数为丝氨酸ᢦ苏氨酸ᢦ酪

数据为基础ᖔ最终获得了 ϟᎮ 个马尾松 ቴ԰ቴሕ᤬᤹ɔଧ 氨酸ྉ表 ࿗ɯᤥ
基因ᖔ通过生物信息学软件预测蛋白长度ܦ分子质 ԰঎ ϟ঎ ԰ ۪ቝᥘɟା༁ 系统进化与 功 能 预 测 জ 从
量ܦ等电点ᤥ 表 ԰ 结果显示ᖔ۪ቝᥘɟା༁ 蛋白编码 ۪᤟ᑕႿᡷఋèା᧕ 数据库 及 શऊା᧧ 数据库下载拟南芥

ϟँᤃ ྉ ۪ቝᥘɟାϟሕ ɯ ጲ ጢሕሕ ྉ ۪ቝᥘɟାऐ ɯ 个氨基酸ଫ ྉዶᡷᥘɟାᖔ࿗࿗ 条ɯܦ火炬松ྉ۪ᡷᥘɟାᖔᎮ 条ɯܦ白云 杉
۪ቝᥘɟା༁ 蛋白分子量在 ԰԰঎࿗ऐྉ ۪ቝᥘɟାϟሕɯ ጲ ጢँ঎ԡᤃ ྉ۪੫ᥘɟାᖔϟሕ 条ɯ኏԰኏ሕ᥋ᥘɟା 蛋白序列进行比对并
ྉ۪ቝᥘɟାऐɯ Ҵ᧕ᑕ 之间ᤥ۪ቝᥘɟା༁ 蛋白理论等电点 构建系统进化树ྉ图 ϟɯᤥ 参考拟南芥 ᤹ɔଧ 基因家

ྉᡱ᧧ɯ在 ࿗঎ऐሕྉ ۪ቝᥘɟାϟɯ ጲ ँ঎Ꭾ԰ྉ ۪ቝᥘɟାϟԡɯ 之间ᖔ 族的分类方法ྉ ᧕ࣼᤦᆍ༁ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟԡɯᖔ最终将 ϟᎮ 个
平均 ᡱ᧧ 为 Ꭾ঎ԡऐᖔ其中 ऐ 个 ۪ቝᥘɟା༁ 蛋白 ᡱ᧧ጐᎮᖔ为 ۗቂ᤹ɔଧ໧ 划分为 ँ 个亚家族ᖔ同一亚家族的基因具