Page 111 - 《广西植物》2022年第8期

ϟ ሕ ᤃ ԡ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗԰ 卷
ԣॹԣ 表观遗传多样性分析 于未甲基化和半甲基化ᖔ以全甲基化模式为主ᖔ自
遗传多样性分析显示ᖔ࿗ँ 份菜心的平均表观 交系杂种的 ᧕શዶ 甲基化水平比亲本高ᖔ其中 Ꭾ 份
观察等位基因数ܦ有效等位基因数ܦ୩ၤᑕႿႿᆍႿ 多样 自交系未甲基化水平升高导致甲基化水平降低ᖔऐ
性指 数ܦ 期 望 杂合度分别为 ϟ঎ Ꭾԡ԰ ԡܦ ϟ঎ ԰ԡϟ ԡܦ 份双自交系杂种去甲基化水平升高ᖔϟᎮ 份单自交
ԡ঎ϟ࿗԰ Ꭾܦԡ঎԰࿗ϟ ԡᖔᎮ 份自交系亲本分别为 ϟ঎ᤃᤃऐ ԡܦ 系杂种全甲基化升高造成甲基化水平升高ᖔᎮ 份商
ϟ঎ϟँԡ ԡܦԡ঎ϟሕጢ ࿗ܦԡ঎԰԰ऐ ँᖔऐ 份双自交系杂种分别 品种和 ϟԡ 份商品种杂种的 ᧕શዶ 甲基化水平和模
为ϟ঎ᤃऐ԰ ँܦϟ঎ϟऐऐ ँܦԡ঎ϟሕጢ ࿗ܦԡ঎԰ሕԡ ϟᖔϟᎮ 份单自交 式变化很小ᖔ表明自交能够降低 ᧕શዶ 甲基化水
系杂种分别为 ϟ঎ᎮԡᎮ ጢܦϟ঎԰ϟ԰ ԡܦԡ঎ϟ࿗ऐ Ꭾܦԡ঎԰࿗ँ ϟᖔᎮ 平ᖔ杂交通过 ᧕શዶ 甲基化模式变化增加了自交系
份 商品种分别为 ϟ঎Ꭾ԰ँ ጢܦ ϟ঎ ԰ԡ԰ ԡܦ ԡ঎ ϟ࿗ሕ ጢܦ 杂种的 ᧕શዶ 甲基化水平ᤥ
ԡ঎԰࿗ሕ ࿗ᖔϟԡ 份商品种杂种分别为 ϟ঎Ꭾϟ԰ ϟܦϟ঎԰ԡԡ ԡܦ ԣॹ྽ 聚类分析
ԡ঎ϟ࿗ሕ ࿗ܦ ԡ঎԰࿗ሕ ԰ᤥ 结果显示ᖔ 双自交系杂种的 如图 ϟ 所示ᖔ利用 В۪᥈ᥘዶ 聚类分析方法ᖔ约
୩ၤᑕႿႿᆍႿ 多样性指数和期望杂合度分别等于和大 在 શᔀᔽᆥ༁ 遗传距离 ԡ঎࿗԰ 处将 ࿗ँ 份菜心分成五类ᤥ
于自交系亲本ᖔ单自交系杂种两者均大于自交系 第一类 Ꭾ 份包括 ϟ 号ܦϟᤃ 号ܦϟऐ 号ܦϟँ 号ܦ԰ԡ 号ܦ
亲本ᖔ商品种与商品种杂种两者变化很小ᖔ表明菜 ԰ϟ 号和 ԰԰ 号ᖔ其中 ϟ 号是 ϟँ 号ܦ԰ԡ 号ܦ԰ϟ 号ܦ԰԰
心表观遗传多样性较低ᖔ自交系杂种的表观遗传 号的母本ᖔጸ特青 ᤃԡ 天粗条菜心ᆥ是 ϟᤃ 号ܦϟऐ 号的
多样性比亲本高ᖔ单自交系杂种的表观遗传多样 母本ᤥ 第二类 ԰ 份包括 ሕऐ 号和 ࿗࿗ 号ᖔጸ绿宝 Ꭾԡϟᆥ
性比双自交系杂种高ᖔ杂交能够增加自交系杂种 分别是 ሕऐ 号的父本和 ࿗࿗ 号的母本ᤥ 第三类 ϟ࿗ 份
的表观遗传差异ᤥ࿗ँ 份菜心ܦᎮ 份自交系亲本ܦऐ 包括 ԰ 号ܦጢ 号ܦᤃ 号ܦऐ 号ܦँ 号ܦϟԡ 号ܦϟϟ 号ܦϟጢ
份双自交系杂种ܦϟᎮ 份单自交系杂种ܦᎮ 份商品 号ܦ԰ሕ 号ܦሕጢ 号ܦሕᤃ 号ܦሕँ 号ܦ࿗ᤃ 号和 ࿗Ꭾ 号ᖔ其中
种ܦϟԡ 份商品种杂种的表观遗传距离 分 别 为 ԰ 号是 ԰ሕ 号的母本ᖔᤃ 号是 ሕጢ 号ܦሕᤃ 号的母本ᖔ
ԡ঎ԡԡँ ࿗ܦԡ঎ ԡԡँ ጢܦ ԡ঎ ԡԡँ ࿗ܦ ԡ঎ ԡԡँ ࿗ܦ ԡ঎ ԡԡऐ ᤃ 和 ጸ桂柳十月柳叶菜心ᆥ 是 ϟጢ 号和 ࿗Ꭾ 号的父本ᤥ 第
ԡ঎ԡԡँ ᤃᖔ结果显示ᖔ自交系亲本之间的表观遗传距 四类 ϟϟ 份包括 ϟ԰ 号ܦϟ࿗ 号ܦϟᎮ 号ܦ԰࿗ 号ܦሕᎮ 号ܦ
离大于自交系杂种和商品种ᖔ单ܦ双自交系杂种之 ࿗ԡ 号ܦ࿗ϟ 号ܦ࿗԰ 号ܦ࿗ሕ 号ܦ࿗ጢ 号和 ࿗ऐ 号ᖔ其中ጸ 绿
间相同ᖔ但均小于商品种ᖔ商品种杂种大于商品 宝 Ꭾԡϟᆥ是 ࿗ϟ 号ܦ࿗԰ 号ܦ࿗ሕ 号和 ࿗ጢ 号的母本ᖔጸ 绿
种ᖔ表明自交增加自交系亲本的表观遗传距离ᖔ杂 宝 Ꭾԡϟᆥ是 ϟᎮ 号ܦ࿗ԡ 号和 ሕᎮ 号的父本ᖔϟ࿗ 号是 ࿗ऐ
交增加商品种杂种的表观遗传距离ᤥ ዶᥘᨃ჆ዶ 分 号的母本ᤥ 第五类 ϟጢ 份包括 ሕ 号ܦ࿗ 号ܦᎮ 号ܦϟሕ
析表明ᖔ表观遗传变异主要来源于种内ྉँᤃᠮɯᖔ种 号ܦ԰ጢ 号ܦ԰ᤃ 号ܦ԰Ꭾ 号ܦ԰ऐ 号ܦ԰ँ 号ܦሕԡ 号ܦሕϟ 号ܦ
间较少ྉ࿗ᠮɯྉۗ ᢉ ԡ঎ԡሕᤃɯᤥ 基因流为ऐ঎ᤃऐϟ ጢᖔ大于 ሕ԰ 号ܦሕሕ 号ܦሕ࿗ 号和 ࿗ँ 号ᖔ其中 ሕ 号是 ԰ጢ 号ܦ԰ᤃ
ϟᖔ表明菜心均质化严重ᖔ遗传分化受到抑制ᖔ大部 号的母本ᖔ࿗ 号是 ԰Ꭾ 号的母本ᖔጢ 号是 ԰ँ 号ܦሕԡ
分遗传变异来源于种内ᖔ只有少量的遗传变异存 号ܦሕϟ 号ܦሕ԰ 号ܦሕሕ 号和 ሕ࿗ 的母本ᖔጸ 绿宝 Ꭾԡϟᆥ 是
在于种间ᤥ ԰ऐ 号ܦሕሕ 号和 ࿗ँ 号的父本ᤥ
ԣॹᇺ ᦵટዛ 甲基化分析 ϟ࿗ 个品种分散在各类中ᖔሕጢ 份杂种倾向于按
由表 ԰ 可知ᖔ᧕શዶ 甲基化水平分析显示的 ࿗ँ 照母本亲缘关系分类ᖔ表明杂种更多地遗传了母
份菜心ܦᎮ 份自交系亲本ܦऐ 份双自交系杂种ܦϟᎮ 份 本的 ᧕શዶ 甲基化状态ᖔ母本 ᧕શዶ 甲基化对杂种表
单自交系杂种ܦᎮ 份商品种ܦϟԡ 份商品种杂种的甲 观遗传多样性具有较大影响ᤥ
基化率分别为 ᤃऐ঎ϟ࿗ᠮܦᤃጢ঎԰ᤃᠮܦᤃऐ঎ँँᠮܦᤃᎮ঎ሕँᠮܦ ԣॹጇ 主成分分析
ᤃँ঎ऐᤃᠮܦᤃँ঎԰ँᠮᤥ ᧕શዶ 甲基化模式分析显示的未 利用 ᥈ᔀႿዶ᤟ጶ଴ ᤃ঎࿗ϟ 软件包中的 ۪ऊዶ 模块进行
甲 基化率分别为 ሕϟ঎ ऐᤃᠮܦ ሕ࿗঎ Ꭾ࿗ᠮܦ ሕϟ঎ ԡϟᠮܦ 主成分分析ྉ图 ԰ɯᖔ结果显示 ࿗ँ 份菜心明显分为
ሕ԰঎ᤃϟᠮܦሕԡ঎ ϟ࿗ᠮܦ ሕԡ঎ Ꭾϟᠮᖔ 半甲基化率分 别 为 ᧧ܦ᧧᧧ܦ᧧᧧᧧ܦ᧧჆ 和 ჆ 五组ᖔ五组分布与聚类分析的五

ሕሕ঎ ϟऐᠮܦ ሕ԰঎ ጢ࿗ᠮܦ ሕᎮ঎ ऐԡᠮܦ ሕϟ঎ ԡँᠮܦ ሕሕ঎ ԡϟᠮܦ 类结果基本一致ᖔ表明 è᥋ᥘ୩ዶ۪ 检测效率很高ᖔ准
ሕሕ঎ᤃᎮᠮᖔ全甲基化率分别为 ሕ࿗঎ ँᤃᠮܦ ሕ԰঎ Ꭾ԰ᠮܦ 确性也很高ᤥ 第一和第二主坐标的贡献率分别为
ሕϟ঎԰ԡᠮܦሕᤃ঎ሕԡᠮܦሕᤃ঎ऐጢᠮܦሕጢ঎ᤃ԰ᠮᤥ 结果显示ᖔ࿗ँ ϟँ঎࿗࿗ᠮ 和 ϟϟ঎ ऐϟᠮᖔ 可解释 ሕϟ঎ ԰ጢᠮ 的表观遗传
份菜心的 ᧕શዶ 甲基化水平较高ᖔ全甲基化水平高 变异ᤥ