Page 92 - 《广西植物》2023年第2期

２ ８ ６ 广 西 植 物 ４３ 卷
ａｎｄ ｒｅｌａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓꎻ ｓｏｌｕｔｅ￣ｂｉｎｄｉｎｇ ｄｏｍａｉｎ)这一功能 是 ＢｄＤＵＲ３ꎬ长度为 ２ ２１４ ｂｐꎬ相差仅为 １８０ ｂｐꎮ 植
结构域ꎮ 物 ＤＵＲ３ 基因外显子的个数分为两类ꎬ双子叶植物
从表 １ 可以看出ꎬ不同植物 ＤＵＲ３ 基因的编码 外显子个数普遍较多ꎬ为 ９ 个或 １０ 个ꎻ单子叶植物

区长度存在较大差异ꎬ从 ＯｓＤＵＲ３ 基因的 ２ ３５８ ｂｐ 外显子个数普遍较少ꎬ为 ３ 个或 ４ 个ꎮ 植物 ＤＵＲ３
到 ＺｍＤＵＲ３ 基因的 ５ ５６７ ｂｐꎬ最长和最短相差３ ２０９ 基因推测的多肽的长度(６７７ ~ ７３７ ａ. ａ) 和分子量
ｂｐꎮ 然而ꎬ植物 ＤＵＲ３ 基因 ＣＤＳ 序列长度的差别却 (７２.９０５ ~ ７７. ６０８ ｋＤａ) 都 相 差 不 大ꎬ 等 电 点 只 有
不大ꎬ最短的是 ＧｈＤＵＲ３.１ꎬ长度为 ２ ０３４ ｂｐꎻ最长的 ＳｉＤＵＲ３ 的小于 ７ꎬ其他的都高于 ７ 而处于碱性范围ꎮ

表 １ 植物 ＤＵＲ３ 基因基本信息
Ｔａｂｌｅ １ Ｂａｓｉｃ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｐｌａｎｔ ＤＵＲ３ ｇｅｎｅｓ

推测的多肽
编码区长度 ＣＤＳ 长度
基因名 外显子个数 Ｄｅｄｕｃｅｄ ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ
Ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ Ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ
Ｇｅｎｅ Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ
ｃｏｄｉｎｇ ｒｅｇｉｏｎ ＣＤＳ
ｎａｍｅ ｅｘｏｎｓ 长度 分子量 等电点
(ｂｐ) (ｂｐ)
Ｌｅｎｇｔｈ (ａ.ａ.) ＭＷ(ｋＤａ) ｐＩ
ＡｔＤＵＲ３ ４ ３６０ ２ １１５ １０ ７０４ ７５.９１３ ８.７２
ＧｍＤＵＲ３ ３ ４０８ ２ １４５ ９ ７１４ ７７.０７４ ８.９２
ＭｔＤＵＲ３ ４ ７８９ ２ １３６ ９ ７１１ ７７.００６ ８.７５
ＳｌＤＵＲ３ ３ １３９ ２ １３３ ９ ７１０ ７６.５８８ ９.００
ＰｔＤＵＲ３ ２ ９２２ ２ １２４ ９ ７０７ ７６.４８０ ８.２１
ＶｖＤＵＲ３ ４ ４８８ ２ １３３ ９ ７１０ ７６.８５７ ８.７６
ＳｂＤＵＲ３ ４ ７８４ ２ １９０ ４ ７２９ ７７.０２９ ８.１９
ＳｉＤＵＲ３ ４ ４６８ ２ １９６ ４ ７３１ ７７.０１０ ６.８９
ＢｄＤＵＲ３ ２ ４１９ ２ ２１４ ３ ７３７ ７７.６０８ ７.８１
ＨｖＤＵＲ３ ２ ４０８ ２ １６９ ３ ７２２ ７６.５２５ ７.７９
ＯｓＤＵＲ３ ２ ３５８ ２ １６６ ３ ７２１ ７６.４１６ ８.６７
ＺｍＤＵＲ３ ５ ５６７ ２ １９６ ４ ７３１ ７７.４２５ ７.１７
ＧｈＤＵＲ３.１ ２ ９６９ ２ ０３４ １０ ６７７ ７２.９０５ ８.４９
ＧｈＤＵＲ３.２ ３ ０２３ ２ ０９４ ９ ６９７ ７５.１９０ ８.４３
ＧｒＤＵＲ３ ３ ０１３ ２ ０９４ ９ ６９７ ７５.２３４ ８.４３

２.２ 植物 ＤＵＲ３ 蛋白氨基酸序列比对 ２.３ 植物 ＤＵＲ３ 基因蛋白质保守基序分析
用 ＤＮＡｍａｎ 对选取的拟南芥、水稻、玉米、高 采用 ＭＥＭＥ 在线分析获得这 １４ 个不同植物
粱( Ｓｏｒｇｈｕｍ ｂｉｃｏｌｏｒ)、 谷 子 ( Ｓｅｔａｒｉａ ｉｔａｌｉｃａ)、 番 茄 的 １５ 个 ＤＵＲ３ 蛋白基序信息ꎬ这 １５ 个蛋白序列都
(Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ)、葡萄( Ｖｉｔｉｓ ｖｉｎｉｆｅｒａ)、大豆 包含 ３ 个不同基序ꎮ 如图 ２ 所示ꎬ这 ３ 个基序在氨
(Ｇｌｙｃｉｎｅ ｍａｘ)、大麦( Ｈｏｒｄｅｕｍ ｖｕｌｇａｒｅ)、二穗短柄 基酸序列上的分布位置基本一致ꎬ出现的顺序都
草( Ｂｒａｃｈｙｐｏｄｉｕｍ ｄｉｓｔａｃｈｙｏｎ)、蒺藜苜蓿( Ｍｅｄｉｃａｇｏ 是 ３ 号基序在前ꎬ１ 号基序紧随其后ꎬ２ 号基序在
ｔｒｕｎｃａｔｕｌａ)、毛果杨( Ｐｏｐｕｌｕｓ ｔｒｉｃｈｏｃａｒｐａ) 等不同层 最后面(靠近氨基酸序列的中间位置)ꎮ 如图 ３ 所
面模式植物和本研究鉴定出棉花的共 １５ 条 ＤＵＲ３ 示ꎬ１ 号基序和 ２ 号基序都有 ５０ 个氨基酸组成ꎬ３
蛋白氨基酸序列进行多重序列比对ꎬ如图 １ 所示ꎬ 号基序有 ３３ 个氨基酸组成ꎬ这 ３ 个基序的保守性
这 １５ 条序列的一致性达到 ７９.８１％ꎬ不一致区段主 都很高ꎮ
要存在于序列的两端ꎬ中间的功能区域部分一致 ２.４ 植物 ＤＵＲ３ 跨膜域预测
性很高ꎮ ＢｄＤＵＲ３ 和 ＭｔＤＵＲ３ 序列一致性最低ꎬ为 Ｃａｏ 等( ２００９) 研 究 表 明ꎬ ＤＵＲ３ 属 于 跨 膜 蛋
７１.８％ꎻＧｈＤＵＲ３.２ 和 ＧｒＤＵＲ３ 序列一致性最高ꎬ为 白ꎬ所以有必要分析不同植物 ＤＵＲ３ 蛋白质的跨
９９.３％ꎮ 膜域情况ꎮ 利用 ＴＭＨＭＭ Ｓｅｒｖｅｒ ｖ. ２.０ 在线对这