Page 45 - 广西植物2024年1期

１ 期 邓永彪等: 珍稀濒危植物越南小花金花茶的叶绿体基因组特征分析 ４ １

１３２３－１３３２.] (Ｚｉｎｇｉｂｅｒａｃｅａｅ) [Ｊ]. ＢＭＣ Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｌꎬ ２１: １－２４.
ＧＥＮＧ ＸＳꎬ ＪＩＡ Ｗꎬ ＣＨＥＮ ＪＮꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ＬＩ ＧＥꎬ ＪＩＡＮＧ ＣＪꎬ ＱＩ Ｙꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｎｉｔｉｄｉｓｓｉｍａ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｐｏｉｎｔｓ ｏｆ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｍｉｎｉｍａ
[Ｊ]. Ｍｏｌ Ｐｌａｎｔ Ｂｒｅｅｄꎬ ２０(７): ２１９６－２２０３. [耿晓姗ꎬ 贾魏ꎬ ａｎｄ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｃｕｃｐｈｕｏｎｇｅｎｓｉｓ ｆｒｏｍ Ｖｉｅｔｎａｍ [Ｊ]. Ｓ Ｈｏｒｔｉｃꎬ ３３
陈佳宁ꎬ 等ꎬ ２０２２. 金花茶叶绿体基因组密码子偏好性分 (１): ５４－６０. [李桂娥ꎬ 蒋昌杰ꎬ 漆娅ꎬ 等ꎬ ２０２２. 越南小
析 [Ｊ]. 分子植物育种ꎬ ２０(７): ２１９６－２２０３.] 花金花茶和菊芳金花茶的形态特征及识别要点 [Ｊ]. 南方
ＧＥＯＲＧＥ Ｏꎬ ＡＮＴＨＯＮＹ ＳＣꎬ ２０１５. Ｉｎ ｐｕｒｓｕｉｔ ｏｆ ｈｉｄｄｅｎ 园艺ꎬ ３３(１): ５４－６０.]
ｃａｍｅｌｌｉａｓ ３２ ｎｅｗ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｓｐｅｃｉｅｓ ｆｒｏｍ Ｖｉｅｔｎａｍ ａｎｄ Ｃｈｉｎａ ＬＩ Ｌꎬ ＨＵ ＹＦꎬ ＨＥ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
[Ｍ]. ２ｎｄ ｅｄ. Ｓｙｄｎｅｙ: Ｔｈｅａｃｅａｅ Ｅｘｐｌｏｒａｔｉｏｎ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ. ｇｅｎｏｍｅｓ: ｉｎｓｉｇｈｔｓｉｎｔｏ ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ
ＧＵＩ Ｌꎬ ＪＩＡＮＧ Ｓꎬ ＸＩＥ Ｄꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｏｆ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｓｉｎｅｎｓｉｓ ａｎｄ ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ｃａｍｅｌｌｉａ [Ｊ]. ＢＭＣ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｃｕｒｃｕｍａ ａｎｄ ｔｈｅ ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｔｏ Ｇｅｎｏｍｉｃｓꎬ ２２(１３８): ４７１－４９３.
ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ａｎｄ ａｄａｐｔｉｖｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ [Ｊ]. Ｇｅｎｅꎬ ７３２: １４４３５５. ＬＩ Ｑꎬ ＬＵＯ ＲＪꎬ ＧＥ Ｒꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ
ＧＵ Ｊꎬ ＣＨＥＮ Ｓꎬ ＺＨＯＵ Ｙꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｆａｓｔｐ: ａｎ ｕｌｔｒａ￣ｆａｓｔ ｂｉａｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｉｎ Ａｍｐｅｌｏｐｓｉｓ ｇｒｏｓｓｅｄｅｎｔａｔａ
ａｌｌ￣ｉｎ￣ｏｎｅ ＦＡＳＴＱ ｐｒｅｐｒｏｃｅｓｓｏｒ [Ｊ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ３４(１７): [Ｊ]. Ｇｕａｎｇｄｏｎｇ Ａｇｒｉｃ Ｓｃｉꎬ ４９(１１): １６２－１６９. [李清ꎬ 罗永
ｉ８８４－ｉ８９０. 坚ꎬ 葛蓉ꎬ 等ꎬ ２０２２. 显齿蛇葡萄叶绿体基因组密码子使
ＨＥＮＲＹ Ｄꎬ ＬＩＮ ＣＳꎬ ＹＵ Ｍꎬｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６. Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ: 用偏好性分析 [Ｊ]. 广东农业科学ꎬ ４９(１１): １６２－１６９.]
ｄｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ＬＩ Ｗꎬ ＺＨＡＮＧ ＣＰꎬ ＧＵＯ ＸＰꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｃｏｍｐｌｅｔｅ
[Ｊ]. Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌꎬ １７(１３４): １－２９. ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｊａｐｏｎｉｃａ ｇｅｎｏｍｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓꎬ
ＨＵ ＸＹꎬ ＸＵ ＹＱꎬ ＨＡＮ ＹＺꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎｄｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ [ Ｊ ]. ＰＬｏＳ ＯＮＥꎬ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｚｉｚｉｐｈｕｓ ｊｕｊｕｂａ ｖａｒ. １４(５): ｅ０２１６６４５.
ｓｐｉｎｏｓａ [Ｊ]. Ｊ Ｆｏｒ Ｅｎｖｉｒｏｎꎬ ３９(６): ６２１－６２８. [胡晓艳ꎬ 许 ＬＩ ＸＰꎬ ＭＥＮＧ Ｊꎬ ＺＨＡＮＧ Ｎꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ
艳秋ꎬ 韩有志ꎬ 等ꎬ ２０１９. 酸枣叶绿体基因组密码子使用 ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｖｉｌｍｏｒｉｎｉａｎｕｍ
偏性分析 [Ｊ]. 森林与环境学报ꎬ ３９(６): ６２１－６２８.] ａｎｄ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｖｉｌｍｏｒｉｎｉａｎｕｍ ｖａｒ. ｐａｔｅｎｔｉｐｉｌｕｍ [ Ｊ]. Ｊ Ｃｈｉｎ
ＨＵＩ Ｈꎬ ＣＨＡＯ Ｓꎬ ＹＵＡＮ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１４. Ｔｈｉｒｔｅｅｎ Ｃａｍｅｌｌｉａ Ｍｅｄ Ｍａｔꎬ ４１(８): １８１２－１８２０. [李雪佩ꎬ 孟静ꎬ 张琳娜ꎬ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ ｂｙ ｈｉｇｈ￣ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ 等ꎬ ２０１８. 黄草乌与展毛黄草乌叶绿体全基因组结构的比
ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ: ｇｅｎｏｍｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ 较分析 [Ｊ]. 中药材ꎬ ４１(８): １８１２－１８２０.]
[Ｊ]. ＢＭＣ Ｅｖｏｌ Ｂｉｏｌꎬ １４(１): １５１－１６８. ＬＩＵ Ｈꎬ ＨＵＡＮＧ Ｙꎬ ＤＵ Ｘꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２. Ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｓｙｎｏｎｙｍｏｕｓ
ＪＩＡＮ ＪＪꎬ ＹＵ ＷＢꎬ ＹＡＮＧ ＪＢꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. ＧｅｔＯｒｇａｎｅｌｌｅ: ａ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ｉｎ ｔｈｅ ｍｏｄｅｌ ｇｒａｓｓ Ｂｒａｃｈｙｐｏｄｉｕｍ ｄｉｓｔａｃｈｙｏｎ
ｆａｓｔ ａｎｄ ｖｅｒｓａｔｉｌｅ ｔｏｏｌｋｉｔ ｆｏｒ ａｃｃｕｒａｔｅ ｄｅ ｎｏｖｏ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｏｆ [Ｊ]. Ｇｅｎｅｔ Ｍｏｌ Ｒｅｓꎬ １１(４): ４６９５－４７０６.
ｏｒｇａｎｅｌｌｅ ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌꎬ ２１(１): ２４１. ＬＩＵ Ｑꎬ ＬＩ Ｙꎬ ＹＡＮＧ ＲＭꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｙｅｌｌｏｗ Ｃａｍｅｌｌｉａ:
ＪＩＮ ＧＺꎬ ＬＩ ＷＪꎬ ＳＯＮＧ Ｆꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｒｅｓｏｕｒｃｅ ｓｔａｔｕｓ ａｎｄ ｒｅｓｅａｒｃｈ ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｉｎ ｍｏｄｅｒｎ ｓｔｕｄｉｅｓ
ｃｏｍｐｌｅｔｅ Ａｒｔｅｍｉｓｉａ ｓｕｂｇｅｎｕｓ Ｓｅｒｉｐｈｉｄｉｕｍ ( Ａｓｔｅｒａｃｅａｅ: [Ｊ]. Ｍｏｄ Ｃｈｉｎ Ｍｅｄꎬ ２３(４): ７２７－７３３. [刘青ꎬ 李月ꎬ 杨润
Ａｎｔｈｅｍｉｄｅａｅ) ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ: ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｉｎｔｏ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ 梅ꎬ 等ꎬ ２０２１. 金花茶组植物资源现状与现代研究进展
ｄｉｖｅｒｇｅｎｃｅ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ [ Ｊ]. ＢＭＣ Ｐｌａｎｔ [Ｊ]. 中国现代中药ꎬ ２３(４): ７２７－７３３.]
Ｂｉｏｌꎬ １３６: ｌ－２３. ＬＩＵ Ｓꎬ ＮＩ Ｙꎬ ＬＩ Ｊꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. ＣＰＧＶｉｅｗ: Ａ ｐａｃｋａｇｅ ｆｏｒ
ＪＵ ＮＧꎬ ＨＯＡＮＧ ＤＫＤꎬ ＫＩＭ ＣＫꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｖｉｓｕａｌｉｚｉｎｇ ｄｅｔａｉｌｅｄ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ [ Ｊ]. Ｍｏｌ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｓｈｅｄ ｌｉｇｈｔ ｏｎ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓꎬ Ｅｃｏｌ Ｒｅｓｏｕｒꎬ ２３(３): ６９４－７０４.
ｄｉｖｅｒｇｅｎｃｅ ｔｉｍｅꎬ ａｎｄ ｂｉｏｇｅｏｇｒａｐｈｙ ｏｆ Ａｌｌｉｏｉｄｅａｅ ＭＩＮＨ ＢＱꎬ ＳＣＨＭＩＤＴ ＨＡꎬ ＣＨＥＲＮＯＭＯＲ Ｏꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. ＩＱ￣
(Ａｍａｒｙｌｌｉｄａｃｅａｅ) [Ｊ]. Ｓｃｉ Ｒｅｐꎬ １１(１): ３２６２ ＴＲＥＥ ２: Ｎｅｗ ｍｏｄｅｌｓ ａｎｄ ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ
ＫＡＴＯＨ Ｋꎬ ＳＴＡＮＤＬＥＹ ＤＭꎬ ２０１３. ＭＡＦＦＴ ｍｕｔｉｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ ｉｎ ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｉｃ ｅｒａ [Ｊ]. Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｅｖｏｌꎬ ３７(５):
ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｖｅｒｓｉｏｎ ７: ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔｓ ｉｎ ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ １５３０－１５３４.
ａｎｄ ｕｓａｂｉｌｉｔｙ [Ｊ]. Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｅｖｏｌꎬ ３０(４): ７７２－７８０. Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ａｎｄ Ｇｒａｓｓｌａｎｄ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎꎬ Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ
ＫＵＲＴＺ ＪＶꎬ ＣＨＯＵＤＨＵＲＩꎬ ＯＨＬＥＢＵＳＣＨ Ｅꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００１. Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ ａｎｄ Ｒｕｒａｌ Ａｆｆａｉｒｓꎬ ２０２１. Ｌｉｓｔ ｏｆ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｋｅｙ
ＲＥＰｕｔｅｒ: ｔｈｅ ｍａｎｉｆｏｌｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｒｅｐｅａｔ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ａ Ｐｒｏｔｅｃｔｅｄ Ｗｉｌｄ Ｐｌａｎｔｓ [ ＥＢ/ ＯＬ ]. ２０２１ ( １５ ). ｈｔｔｐｓ:/ /
ｇｅｎｏｍｉｃ ｓｃａｌｅ [Ｊ]. Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓꎬ ２９(２２): ４６３３－４６４２. ｗｗｗ. ｇｏｖ. ｃｎ/ ｚｈｅｎｇｃｅ/ ｚｈｅｎｇｃｅｋｕ/ ２０２１ － ０９/ ０９/ ｃｏｎｔｅｎｔ ＿
ＬＩ ＤＭꎬ ＬＩ Ｊꎬ ＷＡＮＧ ＤＲꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ５６３６４０９.ｈｔｍ. [国家林业和草原局 农业农村部ꎬ ２０２１. 国
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｉｎ ｓｕｂｆａｍｉｌｙ Ｚｉｎｇｉｂｅｒｏｉｄｅａｅ 家重点保护野生植物名录 [ＥＢ/ ＯＬ] ２０２１ 年第 １５ 号.