Page 47 - 广西植物2024年1期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｊａｎ. ２０２４ꎬ ４４(１): ４３－５５
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２３０４０６３
汪雨ꎬ 唐露ꎬ 邵士成ꎬ 等ꎬ ２０２４. 两种珍稀白蝶兰属(兰科)叶绿体基因组比较分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４４(１): ４３－５５.
ＷＡＮＧ Ｙꎬ ＴＡＮＧ Ｌꎬ ＳＨＡＯ ＳＣꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２４. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｔｗｏ ｒａｒｅ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｐｅｃｉｅｓ
(Ｏｒｃｈｉｄａｃｅａｅ) [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４４(１): ４３－５５.
两种珍稀白蝶兰属(兰科)叶绿体基因组比较分析
汪 雨 ꎬ 唐 露 ꎬ 邵士成 ꎬ 马长乐 ꎬ 李 健 ꎬ 罗 艳 １∗
１ꎬ２
２ꎬ３
４
１
１
( １. 中国科学院西双版纳热带植物园ꎬ 云南 勐腊 ６６６３００ꎻ ２. 西南林业大学 园林园艺学院ꎬ 昆明 ６５０２２４ꎻ ３. 国家林业和草原局
西南风景园林工程技术研究中心ꎬ 昆明 ６５０２２４ꎻ ４. 深圳市兰科植物保护研究中心(全国兰科植物种质资源保护中心)ꎬ 深圳市
濒危兰科植物保护与利用重点实验室ꎬ 兰科植物保护与利用国家林业和草原局重点实验室ꎬ广东 深圳 ５１８１１４ )
摘 要: 为理解珍稀濒危兰科植物龙头兰(Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｕｓａｎｎａｅ)和景洪白蝶兰(Ｐ. ｈａｗｋｅｓｉａｎａ)的叶绿体基因组
的基本特征ꎬ开发用于物种鉴定、保护遗传学和系统发育分析的分子标记ꎬ该研究利用二代测序技术对龙头
兰和景洪白蝶兰进行浅层基因组测序ꎬ采用生物信息学分析方法进行叶绿体基因组的拼接、组装和注释ꎬ并
与其他近缘物种进行比较基因组分析和系统发育分析ꎮ 结果表明:(１)龙头兰和景洪白蝶兰的叶绿体基因
组大小分别为 １５４ ４０７ ｂｐ 和 １５３ ８９１ ｂｐꎬ由一对 ２６ ５５０ ｂｐ 和 ２６ ５２３ ｂｐ 的反向重复序列(ＩＲ)、８４ ２０４ ｂｐ 和
８３ ７５６ ｂｐ 的大单拷贝区(ＬＳＣ)、１７ １０３ ｂｐ 和 １７ ０８９ ｂｐ 的小单拷贝区(ＳＳＣ) 组成ꎻ均注释了 １１１ 个唯一基
因ꎬ包括 ７７ 个蛋白质编码基因、３０ 个 ｔＲＮＡ 基因和 ４ 个 ｒＲＮＡ 基因ꎮ (２) 在叶绿体基因组中分别鉴定出 ９４
个和 ９２ 个简单重复序列(ＳＳＲｓ)ꎮ (３)二者之间存在 ７０６ 个单核苷酸多态性(ＳＮＰｓ)位点和 １５２ 个插入缺失
(ＩｎＤｅｌｓ)位点ꎬ其中 ｃｐＩｎＤｅｌ ０６７ 等可以区分 ２ 个物种ꎮ (４)观察到 １ 个差异较大的基因(ａｃｃＤ) 和 ９ 个高变
区(ｒｐｓ１９－ｐｓｂＡ、ｍａｔＫ－ ｔｒｎＱ￣ＵＵＧ、ｐｓｂＭ － ｐｓｂＤ、ｔｒｎＴ￣ＵＧＵ－ ｎｄｈＪ、ａｃｃＤ－ ｐｓａＩ、ｙｃｆ４ － ｃｅｍＡ、ｃｌｐＰ－ ｐｓｂＢ、ｎｄｈＦ － ｔｒｎＬ￣
ＵＡＧ、ｒｐｓ１５－ｙｃｆ１)ꎮ (５)系统发育分析结果显示ꎬ龙头兰、景洪白蝶兰和鹅毛玉凤花(Ｈａｂｅｎａｒｉａ ｄｅｎｔａｔａ) 的亲
缘关系较近ꎮ 在白蝶兰属 ２ 种叶绿体基因组研究中获得的 ＳＳＲ 位点、ＩｎＤｅｌｓ 和高变区序列可为物种鉴定、
开发利用及其资源保护提供有价值的遗传信息ꎮ
关键词: 龙头兰ꎬ 景洪白蝶兰ꎬ 叶绿体基因组ꎬ 分子标记ꎬ 系统发育
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２４)０１￣００４３￣１３
Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｔｗｏ
ｒａｒｅ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｐｅｃｉｅｓ (Ｏｒｃｈｉｄａｃｅａｅ)
１ꎬ２ １ １ ２ꎬ３ ４ １∗
ＷＡＮＧ Ｙｕ ꎬ ＴＡＮＧ Ｌｕ ꎬ ＳＨＡＯ Ｓｈｉｃｈｅｎｇ ꎬ ＭＡ Ｃｈａｎｇｌｅ ꎬ ＬＩ Ｊｉａｎ ꎬ ＬＵＯ Ｙａｎ
收稿日期: ２０２３－０９－０１
基金项目: 深圳市濒危兰科植物保护与利用重点实验室开放基金(ＯＵ２０２２０４)ꎻ 中国科学院西双版纳热带植物园园林园艺中心研
究基金(Ｅ２ＺＫ２９１Ｂ０５)ꎻ 国家自然科学基金(３２２７０２２５)ꎮ
第一作者: 汪雨(１９９７－)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为园林植物资源与应用ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｗａｎｇｙｕ＠ ｓｗｆｕ.ｅｄｕ.ｃｎꎮ
∗
通信作者: 罗艳ꎬ博士ꎬ研究员ꎬ研究方向为兰科植物多样性与保护ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｌｕｏｙａｎ＠ ｘｔｂｇ.ｏｒｇ.ｃｎꎮ
