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| 基于MSAP技术对不同蒙古黄芪居群表观遗传多样性的研究 |
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梁云慧1, 高慧霞1, 姚妙卓1, 刘澄玉1, 张鹏飞2, 刘亚令1,3*
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1．山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801；2．山西农业大学 园艺学院,山西 太谷 030801；3．山西农业大学 动物医学学院中兽医药现代化山西省重点实验室, 山西 太谷 030801
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| 摘要: |
| 为探讨不同蒙古黄芪居群的表观遗传特征，该文利用甲基化敏感扩增多态性（methylation sensitive amplified polymorphism，MSAP）技术，分析了来自内蒙古武川、陕西子洲、山西浑源等8个居群259份蒙古黄芪样本的DNA甲基化水平和模式，并结合居群表观遗传多样性、居群表观遗传结构和Neighbor-Joining（NJ）聚类分析进行深入研究。结果表明：（1）筛选出的10对选择性扩增引物甲基化敏感多态性位点百分比在50%~79%之间，具有良好的多态性。（2）蒙古黄芪总甲基化平均水平（62.64%）大于非甲基化（37.36%），全甲基化平均水平（33.39%）大于半甲基化（29.25%），并且以全甲基化模式为主，同时在野生居群中总甲基化平均水平（58.97%）低于栽培居群（64.84%）。（3）蒙古黄芪居群表观遗传多样性水平（I：0.555 5±0.121 0）高于遗传多样性（I：0.209 7±0.102 1），其中野生居群表观遗传多样性水平（0.553 1±0.114 8）略低于栽培居群（0.556 9±0.124 7），而遗传多样性水平（0.211 7±0.054）高于栽培居群（0.208 5±0.113 9）；AMOVA分析显示表观遗传变异主要发生在居群内（79%）。（4）居群表观遗传结构和NJ聚类分析均将8个居群蒙古黄芪分为4组，各居群优先以地理进行聚类，表现出一定的表观遗传相似性。上述研究结果共同揭示了蒙古黄芪的群体表观遗传特征，为深入了解蒙古黄芪在不同环境条件下的表型变异与适应性策略提供了新思路，同时为制定合理的蒙古黄芪资源保护策略和开展优良性状的选育工作提供了表观遗传学视角。 |
| 关键词: 蒙古黄芪,DNA甲基化,甲基化敏感扩增多态性,表观遗传多样性,表观遗传结构 |
| DOI：10.11931/guihaia.gxzw202410017 |
| 分类号: |
| 基金项目:国家自然科学基金(32070378)；山西省现代农业产业技术体系建设专项资金(2021-11)；山西农业大学生物育种工程项目(YZGC136)。 |
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| Epigenetic diversity of different populations of Astragalus membranaceus var. mongholicus based on MSAP technique |
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LIANG Yunhui1, GAO huixia1, YAO Miaozhuo1, LIU Dengyv1, ZHANG Pengfei2, LIU Yaling1,3*
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1．College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China; 2．College of Horticulture, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China; 3．Shanxi Key Laboratory for Modernization of TCVM, College of Veterinary Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China
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| Abstract: |
| Astragalus membranaceus var. mongholicus, DNA methylation, methylation-sensitive amplification polymorphism, epigenetic diversity, epigenetic structure |
| Key words: Astragalus membranaceus var. mongholicus, DNA methylation, methylation-sensitive amplification polymorphism, epigenetic diversity, epigenetic structure |
