Page 112 - 《广西植物》2020年第12期

ϟ԰ 期 杨 署 光 等 ᧥ 橡胶树橡胶生物合成调控相关基因的表达相关性分析 ϟ Ꭾ ँ Ꭾ
因的表达与橡胶产量的相关性ଫ同时ᖔ该研究结果 ԰ԡϟϟଫ刘伟ᖔ԰ԡϟϟଫ何鑫ᖔ ԰ԡϟሕଫ包杰ᖔ԰ԡϟ࿗ଫ肖华ᖔ
显示ᖔ这两条途径中的基因表达彼此间具有一定 ԰ԡϟጢଫ王靖等ᖔ԰ԡϟᤃଫ姚笛ᖔ԰ԡϟᤃଫ邓小敏等ᖔ ԰ԡϟऐଫ
的相关性ᖔ说明功能相关的蛋白ᖔ基因表达倾向相 ᧕ᔀႿ੫ ᔀᡷ ᑕ᤟ᖔ ԰ԡϟऐɯ 表明他们在调控橡胶生物合成
关ଫ这为基因表达谱分析中普遍采用的前提假设 过程中具有协同作用ᖔ为这些基因的表达相关性
ᥥ功能相关基因的表达相关ɼ 提供了理论依据ᖔ可 提供了理化基础ᤥ
用于挖掘ܦ筛选和预测与橡胶生物合成相关的未 橡胶树的产量性状是一种典型的次生产量性
知基因ᖔ为研究橡胶树产量形成的分子调控机理 状ᖔ由反复合理的收获胁迫ྉ 割胶ɯ 形成ᖔ是一个
提供理论基础ᤥ ᥥ形成ͱ收获ͱ再形成ͱ再收获ҭҭɼ 的过程ྉ 林位
从多个角度研究了ᥥ 功能相关基因的表达相 夫ᖔ԰ԡϟ԰ɯଫ԰ 次割胶之间的橡胶再生以及相关基因
关ɼ这一现象ᤥ 在线虫ྉ ኏ᆍᢃ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ԰ଫ ᓂᔀʢዹၤᔀʢ 的表达是一个动态过程ଫ由于基因表达的动态性ܦ
ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡሕɯܦ 酵母 ྉ ऊᆍၤᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡԡଫ 王晨光 瞬时性ܦ多样性和复合性ᖔ不同 ቝ኏શዶ 的稳定性和
等ᖔ԰ԡԡᤃɯܦ果蝇ྉ ୩ᡱᔀ᤟᤟ቝᑕႿ ᪲ ኏ࣼᤦᔽႿᖔ԰ԡԡ԰ɯ 和人类 降解速率不同ᖔ可能会影响特定实验条件下的基
ྉ ᓂᔀʢዹၤᔀʢ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ԰ଫ郭政等ᖔ԰ԡԡሕɯ等不同物种上 因表达水平ྉ᣽ʢࣼ੫᤟ᢃᑕҴ ᪲ ఋᑕႿ੫ᖔ ԰ԡԡԡɯᤥ 因此ᖔ系统
陆续发现了染色体上邻近基因表达相关这一现 追踪这些相关基因在排胶过程中的表达相关性是

象ᤥ 酵母 中互作蛋白质的编码基因 ྉ 王磊等ᖔ 今后的一个研究方向ᤥ
԰ԡԡ࿗ଫ王晨光等ᖔ԰ԡԡᤃଫ欧阳玉梅ᖔ԰ԡԡऐɯܦ蛋白质复

合物 的编码基因 ྉ ȮᑕႿ༁ᔀႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ԰ଫ 王磊等ᖔ
԰ԡԡ࿗ɯ表达显著相关ᖔ并且功能联系越强基因表达 参考文献ᧅ
相关性越高ྉ王磊等ᖔ԰ԡԡ࿗ɯᖔ相互作用蛋白质更倾
ዶ୩ዶۼዶఋ኏ጶ኏ዶఋዶશዶ᣽Вᓂ ᣽ᖔ Ի̀ዶશ᥈ ɟۼᖔ
向于对具有相同的亚细胞定位ྉ 王晨光等ᖔ԰ԡԡᤃଫ ۼ᧧ఋ᧧ఋ୩Вۼዶશશዶ᣽Вᓂ ᧕ᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡሕ঎ ᥘᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᑕʢ ዹ᤟ᆍႿᔽႿ੫ᖔ
欧阳玉梅ᖔ԰ԡԡऐɯଫ对基因数据库的分析表明ᖔ同一 ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ᑕႿʛ ዹၤᑕʢᑕዹᡷᔀʢᔽझᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ዹ᧕શዶ ᔀႿዹᆍʛᔽႿ੫ ዹᔽ༁᥋
ᡱʢᔀႿᢃ᤟ᡷʢᑕႿ༁஦ᔀʢᑕ༁ᔀ༁ ஦ʢᆍቝ ̵ᓣצᓣᐹ ᤇʗᐹ໧ᔠᤀᔠᓣႥ໧ᔠ໧ ᗵዶ Ҵᔀᢃ ஦ᑕዹᡷᆍʢ
代谢通路上的基因表达倾向于高度相关ྉ̀ᑕʢʢᔽ༁ ᔀᡷ
ᡱᑕʢᡷᔽዹᔽᡱᑕᡷᔽႿ੫ ᔽႿ Ⴟᑕᡷࣼʢᑕ᤟ ʢࣼᤦᤦᔀʢ ᤦᔽᆍ༁ᢃႿᡷၤᔀ༁ᔽ༁ Џ Ȯ ૒঎ ጶࣼʢ Ȯ
ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ࿗ଫ ᣽ᑕႿᔀၤᔽ༁ᑕ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ࿗ଫ ऊࣼʢᡷᔽ༁ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ
ାᔽᆍዹၤᔀቝᖔ ԰Ꭾԡྉ԰ሕɯ᧥ ࿗ᤃᎮϟͱ࿗ᤃऐԡ঎
԰ԡԡጢɯᖔ在酵母ྉ 李传星等ᖔ԰ԡԡ࿗ଫ王晨光等ᖔ԰ԡԡᤃɯ
ାዶ᧕ጶ኏ Ȯ୩ᖔ ऊ̀ዶВ᧕̀В኏᧧ ዶᖔ ኏ᨃఋ̀ାጶ኏᥈ Ȯᥘᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ
和狗ྉ华琳等ᖔ԰ԡԡऐɯ 的研究中进一步证实了这种 ԰ԡԡ࿗঎ ᥈ᑕᔽႿᔽႿ੫ ዹᆍႿ஦ᔽʛᔀႿዹᔀ ᔽႿ ၤᔽ੫ၤ᥋ᡷၤʢᆍࣼ੫ၤᡱࣼᡷ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ
相关性ᤥ 以上结果表明真核生物中的基因存在模 ᔽႿᡷᔀʢᑕዹᡷᔽᆍႿ ႿᔀᡷऔᆍʢҴ༁ ЏȮ૒঎ શᑕᡷ ାᔽᆍᡷᔀዹၤႿᆍ᤟ᖔ ԰԰ ྉϟɯ᧥ Ꭾऐͱऐጢ঎
ାዶᨃ Ȯᖔ ԰ԡϟ࿗঎ ୩ᡷࣼʛᔽᔀ༁ ᆍႿ ᡷၤᔀ ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿᑕ᤟ ʢᔀ੫ࣼ᤟ᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ Ҵᔀᢃ
块化的共表达趋势ᤥ
ᔀႿझᢃቝᔀ༁ ᆍ஦ Ⴟᑕᡷࣼʢᑕ᤟ ʢࣼᤦᤦᔀʢ ᤦᔽᆍ༁ᢃႿᡷၤᔀ༁ᔽ༁ ᤦᢃ ᥘɟऊ ᑕႿʛ ᥘᢃᤦ
ᥥ功能相关基因的表达相关ɼ 具有实验条件依
ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ஦ᑕዹᡷᆍʢ༁ Џ ᧕૒঎ ̀ᑕᔽҴᆍࣼ᧥ ̀ᑕᔽႿᑕႿ ВႿᔽ׹ᔀʢ༁ᔽᡷᢃ᧥ ϟ ͱ
赖性᧥不同的实验条件对这种相关性有一定的影 Ꭾԡ঎ Џ包杰ᖔ԰ԡϟ࿗঎ ᥘɟऊ 和 ᥘᢃᤦ 转录因子对橡胶生物合成
响ྉାᑕʛᔀʢ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ࿗ଫ王晨光等ᖔ԰ԡԡᤃɯᤥ 橡胶生 关键酶转录调节的研究 Џ᧕૒঎ 海口᧥ 海南大学᧥ϟͱᎮԡ঎૒
物合成途径中也存在类似的实验条件依赖性ᖔ如 ା̀ዶ኏᧕ۼዶȮ શᖔ ᓂВ ̀ᖔ ԰ԡԡጢ঎ ऊᆍʢʢᔀ᤟ᑕᡷᔽᆍႿ ᤦᔀᡷऔᔀᔀႿ ੫ᔀႿᔀ
ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ᡱʢᆍ஦ᔽ᤟ᔀ༁ ᑕႿʛ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ᥋ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᔽႿᡷᔀʢᑕዹᡷᔽᆍႿ༁ औᔽᡷၤᔽႿ ᑕႿʛ
在该 研 究 的 ୩ᣰ ԰᧕ ʛሕ 的割胶制度下ᖔ ᤹ɔࣷϟ 和
ᑕዹʢᆍ༁༁ ੫ᔀႿᆍቝᔀ༁ ЏȮ૒঎ ାᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁ᖔ ԰ϟྉϟϟɯ᧥ ԰Ꭾሕԡͱ԰Ꭾሕऐ঎
᤹ɔࣷ԰ 显著正偏相关ᖔ而在 ୩ᣰ ԰᧕ ʛϟ 的割胶制度下 ऊ̀᧧શ᧧ ዶᖔ ାᨃఋጶ኏ ᥘᖔ ୩ᨃᓂዶશᨃ ኏ᖔ ԰ԡԡँ঎ ۪᤟ᑕႿᡷ ᆍ଴ᢃ᤟ᔽᡱᔽႿ༁᧥
相反ྉԻၤᑕᆍ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟϟɯᤥ 研究基因组内和跨基因 ऊᨃ᧧ϟᣰ ȮዶԻ༁ᣰ ᥘɟऊ԰ ᑕ༁ ᡷၤᔀ ዹᆍʢᔀ ᢼᑕ༁ቝᆍႿᔽዹ ᑕዹᔽʛ᥋༁ᔽ੫Ⴟᑕ᤟᤟ᔽႿ੫
组的基因表达谱与蛋白质相互作用之间的相关 ቝᆍʛࣼ᤟ᔀ ЏȮ૒঎ èᔀᤦ༁ Ȯᖔ ԰ᎮᤃྉϟᎮɯ᧥ ࿗ᤃऐ԰ͱ࿗ᤃँ԰঎
ऊ̀᧧શ᧧ ዶᖔ èᨃશ୩ጶऊዶ ୩ᖔ èጶ኏શᬲ શ᧕ጶԻ ᥈ᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡᎮ঎ ఋၤᔀ
性ᖔ发现与人类ܦ小鼠等物种相比ᖔ酵母的蛋白质
ȮዶԻ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ ᆍ஦ ʢᔀᡱʢᔀ༁༁ᆍʢ༁ ᔽ༁ ᡷၤᔀ ቝᔽ༁༁ᔽႿ੫ ᤟ᔽႿҴ ᔽႿ ᢼᑕ༁ቝᆍႿᑕᡷᔀ
相互作用与基因表达谱的相关性最弱ྉାၤᑕʢʛऔᑕᢼ ᪲ ༁ᔽ੫Ⴟᑕ᤟᤟ᔽႿ੫ ЏȮ૒঎ શᑕᡷࣼʢᔀᖔ ࿗࿗ऐྉᎮϟጢ࿗ɯ᧥ ᤃᤃᤃͱᤃᎮϟ঎
ᓂࣼᖔ ԰ԡԡጢɯᖔ推测ᥥ功能相关基因的表达相关ɼ 具有 ऊ̀ɟጶ ᥘᓂᖔ ఋዶશ ऊఋᖔ ऊ̀Вዶ શ̀ᖔ ϟँँ԰঎ ఋၤʢᔀᔀ ੫ᔀႿᔀ༁ ᔀႿዹᆍʛᔀ
ሕ᥋ၤᢃʛʢᆍ଴ᢃ᥋ሕ᥋ቝᔀᡷၤᢃ᤟੫᤟ࣼᡷᑕʢᢃ᤟᥋ዹᆍᔀႿझᢃቝᔀ ዶ ʢᔀʛࣼዹᡷᑕ༁ᔀ ᔽႿ ̵ᓣצᓣᐹ
进化程度依赖性ᤥ
ᤇʗᐹ໧ᔠᤀᔠᓣႥ໧ᔠ໧᧥ ၤቝ੫ʢϟ ᑕႿʛ ၤቝ੫ʢሕ ᑕʢᔀ ʛᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷᔽᑕ᤟᤟ᢃ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔀʛ
ᥥ̀ᤦऊᨃ᧧ϟ᥋̀ᤦȮዶԻ༁᥋̀ᤦᥘɟऊ༁ɼ彼此间ܦ家族成员
ЏȮ૒঎ ۪᤟ᑕႿᡷ ᥘᆍ᤟ ାᔽᆍ᤟ᖔ ϟँྉሕɯ᧥ ࿗Ꭾሕͱ࿗ऐ࿗঎
间以及他们与 è۪୩ܦ୩኏۪۪ܦ኏ጶèܦ̀኏ఋ԰ 等橡胶生物
ऊᨃ̀ጶશ ାዶᖔ ᥘ᧧ఋ኏ዶ ኏᧕ᖔ ̀В᥈̀ጶ୩ Ȯ᧕ᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡԡ঎ ዶ
合成 关键酶的相互作用 ྉ 马弗 明ᖔ ԰ԡϟԡଫ 赵悦ᖔ ዹᆍቝᡱࣼᡷᑕᡷᔽᆍႿᑕ᤟ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ औၤᆍ᤟ᔀ᥋੫ᔀႿᆍቝᔀ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ʛᑕᡷᑕ