Page 115 - 《广西植物》2020年第12期

၊ᡙᡙᡓ᧥ᣑ ᣑ ँँँॹ੖ࣩᔠ၊ᐹᔠᐹͱᢝᅳࣩʗႥᐹᤀॹዞᅳቂ
জ ᤩࣩᔠ၊ᐹᔠᐹজ ᧕ᔀዹ঎ ԰ԡ԰ԡᖔ ྽Ԕྉϟ԰ɯ᧥ ϟऐԡԡͱϟऐϟጢ

ᦵ᧣ᧇᧅ ϓԔॹϓϓ࣮ᇺϓᣑ ੖ࣩᔠ၊ᐹᔠᐹॹ੖ଝऊँԣԔϓ࣮ϓԔԔԣࣽ
付春ᖔ 唐易ᖔ 江纳ᖔ 等঎ 原始小球藻 ዛۗ԰ 转录因子的生物信息学分析 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ԰ԡ԰ԡᖔ ࿗ԡྉϟ԰ɯ᧥ϟऐԡԡͱϟऐϟጢ঎
èВ ऊᖔ ఋዶશ᥈ ɟᖔ Ȯ᧧ዶશ᥈ શᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ ାᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ዛۗ԰ ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ஦ᑕዹᡷᆍʢ ᔽႿ ዛࣩଝᓣႥᅳዞ၊ᤀᅳʗᓣᤀᤀᐹ ᡓʗᅳᡙᅳᡙ၊ᓣዞᅳᔠʐᓣ໧ ЏȮ૒঎ ᥈ࣼᔽၤᑕᔽᑕᖔ ԰ԡ԰ԡᖔ
࿗ԡྉϟ԰ɯ᧥ ϟऐԡԡͱϟऐϟጢ঎

原始小球藻 ዛۗԣ 转录因子的生物信息学分析

付জ 春 ϟᕷ԰᥍ ᕷ 唐জ 易 ϟᕷ԰ ᕷ 江জ 纳 ᕷ 杨瑶君 ϟᕷ԰
ሕ
ྉϟ঎ 竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室 乐山师范学院ᖔ 四川 乐山 ᤃϟ࿗ԡԡԡଫ ԰঎ 乐山师范学院 生命科学学院ᖔ
四川 乐山 ᤃϟ࿗ԡԡԡଫ ሕ঎ 乐山师范学院 数学与信息科学学院ᖔ 四川 乐山 ᤃϟ࿗ԡԡԡ ɯ
摘জ 要ᧅ 为了揭示原始小球藻 ዛۗ԰ 基因家族编码蛋白的理化特性ܦ分子功能和遗传进化特征ᖔ该文对原始

小球藻 ዛۗ԰ 基因家族的蛋白成员进行了详细的生物信息学预测和分析ᖔ并利用 ۪ʢᡷᆍ۪ᑕʢᑕቝܦ۪஦ᑕቝ ሕ঎ ԰ԡܦ
۪ʢᆍᡷ༁ዹᑕ᤟ᔀ 等在线工具分析了原始小球藻 ዛۗ԰ 家族所包含的 ऐ 个蛋白成员ᤥ 结果表明᧥该家族成员含有的氨

基酸数为 ԰࿗Ꭾ ྉᣮ۪ᡸԡϟϟሕँጢᤃ࿗ᤃ঎ϟɯ到 Ꭾϟጢ ྉᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡϟँԡ࿗঎ϟɯᖔ理论等电点最大为 ँ঎ሕँ ྉᣮ۪ᡸԡϟϟሕँᤃԡϟϟ঎ϟɯܦ
最小为 ጢ঎ऐϟ ྉᣮ۪ᡸԡϟϟሕँऐϟጢऐ঎ϟɯଫ家族中各个成员所含有的保守结构域的位置和数量都各不相同ଫ所有蛋白

成员均无信号 肽ᖔ 均不包含跨膜螺旋ᖔ 不具有跨膜区域ଫ 蛋白成员中最大亲水性值为 ͱ ሕ঎ ԰԰԰
ྉᣮ۪ᡸԡϟϟሕँऐϟጢऐ঎ϟɯᖔ最大疏水性值为 ԰঎ሕሕሕ ྉᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡϟँԡ࿗঎ϟɯᖔ且所有成员的平均亲疏水性值均小于 ԡଫ成
员中有多个磷酸化位点值远超标准值 ԡ঎ጢᖔ最大磷酸化位点值为 ԡ঎ँँऐଫ该基因家族的蛋白成员二级结构的
组分含量从大到小排序均为无规则卷曲ᢦም᥋螺旋ᢦ延伸链ᢦᏇ᥋转角ᖔ推测 ም᥋螺旋和无规则卷曲是其二级结构
的主要方式ᖔ延伸链和 Ꮗ᥋转角则分散在所有蛋白成员的氨基酸链中ଫ所有成员的三级结构分析中均能观察
到 ም᥋螺旋ܦᏇ᥋折叠ܦᏇ᥋转角以及 શ 端和 ऊ 端ଫ系统进化分析结果表明ᖔ在其余 ϟጢ 个物种中ᖔ与原始小球藻亲
缘关系最远的是金牛介球菌ྉ᧣໧ᡙʗᓣᅳዞᅳዞዞࣩ໧ ᡙᐹࣩʗᔠɯᖔ亲缘关系最接近的是小球藻ྉࣷ၊ᤀᅳʗᓣᤀᤀᐹ צᐹʗᔠᐹᤇᔠᤀᔠ໧ શऊᤃ࿗ዶɯ 和
螺旋孢子虫ྉ̵ᓣᤀᔠዞᅳ໧ᡓᅳʗᔠʐᔠࣩቂɯᖔ较接近的是苦参 ሕ 号ྉۗᔠዞᅳዞ၊ᤀᅳʗࣩቂ ༁ᡱॹ ୩ጶશጶۼሕɯᤥ 该研究较系统地分析了原
始小球藻 ዶ۪԰ 蛋白家族的理化特性ܦ保守基序及系统进化关系ᖔ为进一步研究原始小球藻 ዛۗ԰ 转录因子功
能和互作关系提供一定参考依据ᤥ
关键词ᧅ 原始小球藻ᖔ ዛۗ԰ 转录因子ᖔ 生物信息学
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶ
文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰ԡɯϟ԰᥋ϟऐԡԡ᥋ϟᤃ 开放科学ྉ资源服务ɯ标识码ྉ᧣୒ᧇᦵɯ᧥

ଧᔠᅳᔠႥஏᅳʗቂᐹᡙᔠዞ໧ ᐹႥᐹᤀᡥ໧ᔠ໧ ᅳஏ ዛۗԣ ᡙʗᐹႥ໧ዞʗᔠᡓᡙᔠᅳႥ

ஏᐹዞᡙᅳʗ ᔠႥ ዛࣩଝᓣႥᅳዞ၊ᤀᅳʗᓣᤀᤀᐹ ᡓʗᅳᡙᅳᡙ၊ᓣዞᅳᔠʐᓣ໧

ϟᖔ԰᥍ ϟᖔ԰ ሕ ϟᖔ԰
èВ ऊၤࣼႿ ᖔఋዶશ᥈ ɟᔽ ᖔȮ᧧ዶશ᥈ શᑕ ᖔ ɟዶશ᥈ ɟᑕᆍᢼࣼႿ

收稿日期ᧅ ԰ԡ԰ԡͱԡሕͱϟԡ
基金项目ᧅ 四川省科技厅项目ྉϟᎮԻԻԡϟँɯଫ乐山市科技局重点研究项目ྉϟऐȮԻ᧕ϟԡϟɯଫ乐山师范学院人才启动项目ྉ ᣮȮ኏ϟᎮԡԡጢɯ
Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ୩ᔽዹၤࣼᑕႿ ۪ʢᆍ׹ᔽႿዹᔽᑕ᤟ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ ᑕႿʛ ఋᔀዹၤႿᆍ᤟ᆍ੫ᢃ ᧕ᔀᡱᑕʢᡷቝᔀႿᡷ ۪ʢᆍ੫ʢᑕቝ ྉϟᎮԻԻԡϟँɯଫ ᣽ᔀᢃ ኏ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ۪ʢᆍ੫ʢᑕቝ ᆍ஦ ᓂᔀ༁ၤᑕႿ ᥘࣼႿᔽዹᔽᡱᑕ᤟
୩ዹᔽᔀႿዹᔀ ᑕႿʛ ఋᔀዹၤႿᆍ᤟ᆍ੫ᢃ ାࣼʢᔀᑕࣼ ྉϟऐȮԻ᧕ϟԡϟɯଫ ᓂᔀ༁ၤᑕႿ શᆍʢቝᑕ᤟ ВႿᔽ׹ᔀʢ༁ᔽᡷᢃ ఋᑕ᤟ᔀႿᡷ ᓂᑕࣼႿዹၤ ۪ʢᆍ੫ʢᑕቝ ྉᣮȮ኏ϟᎮԡԡጢɯ૒ᤥ
作者简介ᧅ 付春ྉϟँऐ࿗ͱɯᖔ男ᖔ江西高安人ᖔ博士ᖔ讲师ᖔ主要从事经济植物的生物信息学研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ ஦ࣼዹၤࣼႿ࿗԰ϟ݀ ᑕ᤟ᔽᢃࣼႿ঎ዹᆍቝᤥ
通信作者
᥍