Page 117 - 《广西植物》2020年第12期

ϟ ऐ ԡ ԰ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ԡ 卷
莉莉ᖔ԰ԡϟᤃɯᖔ而且与其他因子相互协作ᖔ参与到复 数ܦ脂肪指数ܦ亲疏水性ܦ分子式ܦ原子总数等方面
杂的花发育调控网络ྉ刘杨ᖔ԰ԡԡँɯᤥ 虽然关于藻类 ྉ韩长志和王娟ᖔ԰ԡϟᤃɯᤥ 通过在线程序 ऊᔀ᤟᤟᥋۪ᓂᆍዹ
ዛۗ԰ 基因家族的研究较多ᖔ但是未见关于原始小球 ԰঎ ԡ ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ ዹ༁ᤦᔽᆍ঎ ༁ᢼᡷࣼ঎ ᔀʛࣼ঎ ዹႿ ᣰ ᤦᔽᆍᔽႿ஦ᣰ ऊᔀ᤟᤟᥋
藻 ዛۗ԰ 转录因子的生物信息学分析的报道ᤥ 本研 ۪ᓂᆍዹ᥋԰ ᣰ ɯ对原始小球藻 ዛۗ԰ 转录因子的 ऐ 个蛋白
究通过分析原始小球藻的 ዛۗ԰ 转录因子编码蛋白 成员进行亚细胞定位分析ྉ 徐志军等ᖔ԰ԡϟँɯᖔ参数

的理化特性ܦ亲疏水性ܦ跨膜域ܦ保守结构域ܦ保守 设置᧥物种选择为真核生物ᤥ
基序ܦ亚细胞定位以及 ዛۗ԰ 转录因子在不同物种中 ϟ঎԰঎԰ 氨基酸的保守结构域ܓ跨膜结构及信号肽分
的进化起源关系ᖔ为进一步研究原始小球藻 ዛۗ԰ 基 析জ 用 ۪஦ᑕቝ ሕ঎԰ԡ ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ ᡱ஦ᑕቝ঎଴஦ᑕቝ঎ᆍʢ੫ ᣰ ɯ 对原始
因家族的生物学功能奠定一定的理论依据ᤥ 小球藻的蛋白成员进行保守结构域预测ྉ 张海燕
等ᖔ԰ԡϟሕɯᖔ统计分析蛋白成员氨基酸保守结构域
ϟজ 材料与方法 的个数及位置ᤥ 在 ఋᥘ̀ᥘᥘ ୩ᔀ׹ᔀʢ׹঎ ԰঎ ԡ ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ
औऔऔ঎ዹᤦ༁঎ʛᡷࣼ঎ʛҴ ᣰ ༁ᔀʢ׹ᔽዹᔀ༁ᣰ ఋᥘ̀ᥘᥘ ᣰ ɯ在线程序中输
ϓॹϓ 材料 入 ዛۗ԰ 转录因子基因蛋白成员ᖔ分析跨膜螺旋的

从 ᡱ᤟ᑕႿᡷఋè᧕ା ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ ᡱ᤟ᑕႿᡷᡷ஦ʛᤦ঎ ዹᤦᔽ঎ ᡱҴࣼ঎ ᔀʛࣼ঎ 数量以及跨膜结构的区域ᖔ确定基因蛋白成员是
ዹႿ ᣰ ɯ数 据 库中下载原始小球藻 ྉ ዛࣩଝᓣႥᅳዞ၊ᤀᅳʗᓣᤀᤀᐹ 否 具有跨膜区域ᖔ 判断是否为跨膜蛋白ᤥ 用
ᡓʗᅳᡙᅳᡙ၊ᓣዞᅳᔠʐᓣ໧ɯዛۗ԰ 基因家族中所有成员的蛋白序 ୩ᔽ੫Ⴟᑕ᧧۪ሕ঎ԡ ୩ᔀʢ׹ᔀʢྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ዹᤦ༁঎ʛᡷࣼ঎ʛҴ ᣰ ༁ᔀʢ׹ᔽዹᔀ༁ᣰ
列和 岩 藻 ྉ ଧᐹᡙ၊ᡥዞᅳዞዞࣩ໧ ᡓʗᐹ໧ᔠႥᅳ໧ ɯܦ 莱茵衣藻 ୩ᔽ੫Ⴟᑕ᤟۪᥋ሕ঎ԡ ᣰ ɯ对原始小球藻蛋白成员进行信号肽
ྉ ࣷ၊ᤀᐹቂᡥʐᅳቂᅳႥᐹ໧ ʗᓣᔠႥ၊ᐹʗʐᡙᔠᔠ ɯܦ 小球藻 ྉ ࣷ၊ᤀᅳʗᓣᤀᤀᐹ 分析ྉ柳燕等ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ
צᐹʗᔠᐹᤇᔠᤀᔠ໧ શऊᤃ࿗ዶɯܦ胶球藻ྉ ࣷᅳዞዞᅳቂᡥଝᐹ ໧ࣩᤇᓣᤀᤀᔠᡓ໧ᅳᔠʐᓣᐹ ϟ঎԰঎ሕ 氨基酸的亲疏水性和磷酸化位点 预 测 分
ऊ᥋ϟᤃँɯܦ盐生杜氏藻ྉ ᦵࣩႥᐹᤀᔠᓣᤀᤀᐹ ໧ᐹᤀᔠႥᐹɯܦ胸状盘藻 析জ 用 ۪ʢᆍᡷ༁ዹᑕ᤟ᔀ ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ औᔀᤦ঎ ᔀ଴ᡱᑕ༁ᢃ঎ ᆍʢ੫ ᣰ

ྉᤩᅳႥᔠࣩቂ ᡓᓣዞᡙᅳʗᐹᤀᓣɯܦ螺旋孢子虫ྉ ̵ᓣᤀᔠዞᅳ໧ᡓᅳʗᔠʐᔠࣩቂɯܦ ᡱʢᆍᡷ༁ዹᑕ᤟ᔀ ᣰ ɯ在线工具ᖔ对该转录因子基因蛋白成员
细小微胞藻ྉ ᤹ᔠዞʗᅳቂᅳႥᐹ໧ ᡓࣩ໧ᔠᤀᤀᐹ ऊऊᥘ۪ϟጢ࿗ጢɯܦ微单 进行亲疏水性预测分析ᖔ确定最大亲水值和最大
胞藻 ྉ ᤹ᔠዞʗᅳቂᅳႥᐹ໧ ༁ᡱ঎ ኏ऊऊ԰ँँ ɯܦ 深蓝单壳缝藻 疏水值及其相对应的位置ᖔ判断该基因蛋白成员

ྉ ᤹ᅳႥᅳʗᐹᡓ၊ᔠʐᔠࣩቂ Ⴅᓣ੖ᤀᓣዞᡙࣩቂ ɯܦ 透明介球菌 为亲水蛋白还是疏水蛋白ᤥ 用 શᔀᡷ۪ၤᆍ༁ ሕ঎ϟ ୩ᔀʢ׹ᔀʢ
ྉ ᧣໧ᡙʗᓣᅳዞᅳዞዞࣩ໧ ᤀࣩዞᔠቂᐹʗᔠႥࣩ໧ ɯܦ 介球菌 ྉ ᧣໧ᡙʗᓣᅳዞᅳዞዞࣩ໧ ྉၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ዹᤦ༁঎ʛᡷࣼ঎ʛҴ ᣰ ༁ᔀʢ׹ᔽዹᔀ༁ᣰ શᔀᡷ۪ၤᆍ༁ᣰ ɯ在线程
༁ᡱ঎ ኏ऊऊऐԡँɯܦ金牛介球菌ྉ ᧣໧ᡙʗᓣᅳዞᅳዞዞࣩ໧ ᡙᐹࣩʗᔠɯܦ苦 序对转录因子基因蛋白成员进行潜在磷酸化位点
参 ሕ 号 ྉ ۗᔠዞᅳዞ၊ᤀᅳʗࣩቂ ༁ᡱ঎ ୩ጶશጶۼሕ ɯ 以及团藻 预测分析ᖔ并统计磷酸化位点种类和数量ᤥ
ྉႬᅳᤀצᅳଝ ዞᐹʗᡙᓣʗᔠɯ 等物种的 ዶ۪԰ 成员蛋白序列ᤥ 对 ϟ঎԰঎࿗ 编码蛋白的二级结构和三级结构 预 测 分
原始小球藻的 ዶ۪԰ 所有成员的蛋白质序列进行详 析জ 用୩ᨃ۪ᥘዶ ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ Ⴟᡱ༁ᑕ᥋ᡱʢᑕᤦᔽ঎ᔽᤦዹᡱ঎஦ʢ ᣰ ዹ੫ᔽ᥋ᤦᔽႿ ᣰ
细的生物信息学分 析ᖔ 且将原始小球藻与岩藻 Ⴟᡱ༁ᑕᡸᑕࣼᡷᆍቝᑕᡷ঎ ᡱ᤟ᥳ ᡱᑕ੫ᔀ ᢉ Ⴟᡱ༁ᑕᡸ༁ᆍᡱቝᑕ঎ ၤᡷቝ᤟ɯ 在线程
ྉଧᐹᡙ၊ᡥዞᅳዞዞࣩ໧ ᡓʗᐹ໧ᔠႥᅳ໧ɯ 等 ϟᤃ 个物种 ዶ۪԰ 蛋白进行 序对该转录因子蛋白成员的二级结构进行预测分

同源序列比对分析并构建进化树ᖔ探究 ϟᤃ 个物种 析ᖔ统计该蛋白成员中 ም᥋螺旋ܦ无规则卷曲ܦ延伸
间的进化起源关系ᤥ 链和 Ꮗ᥋转角相对应的百分比ᤥ 通过同源建模法ᖔ
ϓॹԣ 方法 利用 ୩ۼ᧧୩୩᥋ᥘᨃ᧕ጶᓂ ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ ༁औᔽ༁༁ቝᆍʛᔀ᤟঎
ϟ঎԰঎ϟ ዛۗ԰ 转录因子基因的蛋白成员的一级结构和 ᔀ଴ᡱᑕ༁ᢃ঎ᆍʢ੫ ᣰ ɯ 在线工具ྉ ୩ዹၤऔᔀʛᔀ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡሕɯᖔ对
理化性质分析জ 用在线程序 ۪ʢᡷᆍ۪ᑕʢᑕቝ ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ 该蛋白家族的三级结构进行预测分析ᖔ确定其三
औᔀᤦ঎ᔀ଴ᡱᑕ༁ᢃ঎ ᆍʢ੫ ᣰ ᡱʢᆍᡷᡱᑕʢᑕቝ ᣰ ɯ 对原始小球藻 ዛۗ԰ 转 级结构的组成和构象变化ᤥ
录因子蛋白成员的一级结构和理化性质进行分 ϟ঎԰঎ጢ 保守基序分析জ 用 ᥘጶᥘጶᎮ঎ԡ ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ ቝᔀቝᔀ᥋

析ᖔ包括了蛋白成员氨基酸数目ܦ理论 ᡱ᧧ܦ分子量ܦ ༁ࣼᔽᡷᔀ঎ᆍʢ੫ ᣰ ɯ在线工具对原始小球藻 ዛۗ԰ 转录因子
带负电氨基酸残基ܦ带正电氨基酸残基ܦ不稳定系 的蛋白成员进行保守基序 ቝᆍᡷᔽ஦ 分析ᖔ参数设置᧥