Page 128 - 《广西植物》2020年第12期

ϟ԰ 期 付 春 等 ᧥ 原始小球藻 ዛۗ԰ 转录因子的生物信息学分析 ϟ ऐ ϟ ሕ
水性分 析 中ᖔ原始小 球 藻 ዶ۪԰ 成员蛋白与菠萝 单双子叶植物上ᖔ 如᧥ 在拟南芥 ྉ ዛʗᐹᤇᔠʐᅳᡓ໧ᔠ໧ ɯ
ዶዹ۪ጶ۪ऊ 蛋白ྉ马海洋等ᖔ԰ԡ԰ԡɯ和蔓花生 ۗጛۗࣷ 基 ྉȮᆍ஦ࣼҴࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔϟँँ࿗ɯ中发现 ϟ԰࿗ 个 ዛۗ԰ ᣑጛቴÞ 家族
因家族ྉ涂嘉琦等ᖔ԰ԡϟऐɯ相同ᖔ所有蛋白成员均为 基因ଫ水稻ྉ ᧣ʗᡥऊᐹ ໧ᐹᡙᔠצᐹɯ ྉ શᑕҴᑕႿᆍᖔ ԰ԡԡᤃɯ 中发现

亲水性蛋白ᖔ磷酸化位点分析中ᖔ原始小球藻 ዶ۪԰ 了 ϟሕँ 个 ዛۗ԰ ᣑ ጛቴÞ 家族基因ଫ大豆ྉ ᤩᤀᡥዞᔠႥᓣ ቂᐹଝɯ
蛋白家族成员含有多个潜在磷酸化位点ᖔ最有可 中发现了 ϟ԰ԡ 个 ዛۗ԰ ᣑጛቴÞ 家族基因ྉԻၤᑕႿ੫ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ

能 的磷酸化位 点为丝氨酸ᖔ 在蓖麻 ྉ ቴᔠዞᔠႥࣩ໧ ԰ԡԡऐɯଫ小兰屿蝴蝶兰ྉ ۗ၊ᐹᤀᐹᓣႥᅳᡓ໧ᔠ໧ ᓣफࣩᓣ໧ᡙʗᔠ໧ɯ 中发
ዞᅳቂቂࣩႥᔠ໧ɯዶ۪༁ 分析中潜在磷酸化位点同样为丝氨 现了 ϟԡᎮ 个 ዛۗ԰ ᣑ ጛቴÞ 家族基因等 ྉ 朱光哲ᖔ
酸ᤥ 在原始小球藻的二级结构分析中ᖔ其二级结 ԰ԡϟᤃɯଫ而在藻类上 ዛۗ԰ 转录因子的研究较少ᤥ 本
构的组分含量从大到小排序均为无规则卷曲ᢦም᥋ 研究主要描述的是对原始小球藻 ዶ۪԰ 所有蛋白成
螺旋ᢦ延伸链ᢦᏇ᥋转角ᖔም᥋螺旋和无规则卷曲是二 员进行了详细的生物信息学分析ᖔ系统进化分析
级结构的主要方式ᖔ延伸链和 Ꮗ᥋转角则分散在所 结果说明了原始小球藻最为原始ᖔ与原始小球藻

有蛋白成员的氨基酸链中ᖔ在中国樱桃ྉऊၤᔽႿᔀ༁ᔀ 亲 缘关系最 远的是细小微胞藻 ዹዹቝᡱϟጢ࿗ጢ
ዹၤᔀʢʢᢃɯ ྉ 王月ᖔ԰ԡϟᎮɯ 和甘薯 ྉ ᦵᔠᅳ໧ዞᅳʗᓣᐹ ᓣ໧ዞࣩᤀᓣႥᡙᐹɯ ྉ᤹ᔠዞʗᅳቂᅳႥᐹ໧ ᡓࣩ໧ᔠᤀᤀᐹ ऊऊᥘ۪ϟጢ࿗ጢɯᖔ亲缘关系最近的
ྉ阮先乐等ᖔ԰ԡϟᎮɯ中的二级结构占比分布和原始 是团藻ྉႬᅳᤀצᅳଝ ዞᐹʗᡙᓣʗᔠɯᤥ 本研究结果为今后进一步
小球藻相同ᖔም᥋螺旋和无规则卷曲占比最大ଫ但在 研究 ዛۗ԰ 转录因子在原始小球藻生长发育过程中
杨树ྉ ۗᡙᓣʗᅳዞᐹʗᡥᐹ ໧ᡙᓣႥᅳᡓᡙᓣʗᐹɯྉ 赵金玲等ᖔ԰ԡϟጢɯ 中ᖔ 的生理特点和分子功能提供了一定的参考依据ᤥ
其组分与原始小球藻有所差异ᖔ仅以无规则卷曲
为主ᤥ 在三级结构分析中ᖔ甘蓝与原始小球藻都
参考文献ᧅ
能明显观察到 ም᥋螺旋和 Ꮗ᥋折叠ᖔ但原始小球藻三
级结 构 家 族成员之间结构差异较大ᖔ 而甘蓝 ାᨃ ᣮᖔ ۼዶશ᥈ ᣮɟᖔ ऊ̀ጶશ ɟᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँ঎ ାᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁
ྉ ଧʗᐹ໧໧ᔠዞᐹ ᅳᤀᓣʗᐹዞᓣᐹ ɯྉ 郭慧等ᖔ ԰ԡϟᎮ ɯ 和甘 薯 ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᥈ቝዶશ᣽ఋᥘ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ ᑕᤦᔽᆍᡷᔽዹ ༁ᡷʢᔀ༁༁ ᔽႿ ༁ᆍᢃᤦᔀᑕႿ
ЏȮ૒঎ Ȯ શጶ ዶ੫ʢᔽዹ ВႿᔽ׹ᖔ ጢԡྉᎮɯ᧥ϟऐͱ԰Ꭾ঎ Џ柏锡ᖔ 王昕奕ᖔ 陈
ྉᦵᔠᅳ໧ዞᅳʗᓣᐹ ᓣ໧ዞࣩᤀᓣႥᡙᐹɯྉ阮先乐等ᖔ԰ԡϟᎮɯ的家族成员
云ᖔ 等ᖔ԰ԡϟँ঎ 大豆 ᥈ቝዶશ᣽ఋᥘ 家族非生物胁迫生物信
三级结构基本相似ᤥ 在原始小球藻保守基序中ᖔ
息学分析 ЏȮ૒঎ 东北农业大学学报ᖔጢԡྉᎮɯ᧥ϟऐͱ԰Ꭾ঎૒
将所有基序一共分为四类ᖔ其中所有成员共同含 ऊዶᨃ ऊᖔ ᥘዶ ᣽ᖔ ԰ԡϟᤃ঎ ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ ༁ᔀዹᆍႿʛᑕʢᢃ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᑕ༁༁ᔽ੫ႿቝᔀႿᡷ
有的是 ቝᆍᡷᔽ஦ሕܦቝᆍᡷᔽ஦ጢᖔ这两个可能是参与原始小球 ЏȮ૒঎ ऊၤᔽႿ Ȯ ାᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᖔ ྉϟ࿗ɯ᧥ϟऐᎮ঎ Џ曹晨ᖔ 马堃ᖔ԰ԡϟᤃ঎ 蛋
白质二级结构指定 ЏȮ૒঎ 生物信息学ᖔྉϟ࿗ɯ᧥ϟऐᎮ঎૒
藻细胞生长发育和逆境胁迫等多个生理过程有关
᥈В᧧ ᣮ̀ᖔ ԰ԡϟᎮ঎ ऊࣼ᤟ᡷࣼʢᔀ ዹᆍႿʛᔽᡷᔽᆍႿ༁ ஦ᆍʢ ᆍᔽ᤟ ᑕዹዹࣼቝࣼ᤟ᑕᡷᔽᆍႿ ᑕႿʛ
的功能基序ྉ 栗丽和佟少明ᖔ԰ԡϟᤃɯᤥ 在原始小球 ʢᔀ੫ࣼ᤟ᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ᤟ᔽᡱᔽʛ ༁ᢃႿᡷၤᔀᡷᔽዹ ቝᔀᡷᑕᤦᆍ᤟ᔽ༁ቝ ᆍ஦ ࣷ၊ᤀᅳʗᓣᤀᤀᐹ
ᡓʗᅳᡙᅳᡙ၊ᓣዞᅳᔠʐᓣ໧ Џ᧕૒঎ ۼࣼၤᑕႿ᧥̀ࣼᑕझၤᆍႿ੫ ВႿᔽ׹ᔀʢ༁ᔽᡷᢃ ᆍ஦ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ
藻 ዶ۪԰ 蛋白家族中不存在信号肽和跨膜结构域ᖔ
ᑕႿʛ ఋᔀዹၤႿᆍ᤟ᆍ੫ᢃ঎ Џ桂小华ᖔ԰ԡϟᎮ঎ 原始小球藻产油条件及
同样在沙棘ྉ̵ᔠᡓᡓᅳᡓ၊ᐹᓣ ʗ၊ᐹቂႥᅳᔠʐᓣ໧ɯ۩ቴᧇϟ 转录因子
油脂合成代谢调控的研究 Џ᧕૒঎ 武汉᧥华中科技大学঎૒
ྉ马倩等ᖔ԰ԡϟᤃɯ 蛋白序列和蔷薇科植物的 ϟँ 个 ᥈Вᨃ ̀ᖔ Ȯ᧧શ ୩ɟᖔ ᓂ᧧В ̀ᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟᎮ঎ ᧧Ⴟ ༁ᔽ᤟ᔽዹᆍ ዹ᤟ᆍႿᔽႿ੫ ᑕႿʛ
᧕ጶᓂᓂዶ 蛋白ྉ宋伟等ᖔ԰ԡϟሕɯ 序列中也均无信号肽 ᤦᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ዛۗ԰ᣑ ጛቴÞ ੫ᔀႿᔀ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ ஦ʢᆍቝ
ଧʗᐹ໧໧ᔠዞᐹ ᅳᤀᓣʗᐹዞᓣᐹ ЏȮ૒঎ ऊၤᔽႿ ۪ၤᑕʢቝᖔ ԰ԡྉϟɯ᧥ ᤃͱϟԡ঎ Џ郭慧ᖔ
和跨膜结构域ᖔ但同时也存在不同ᖔ例如᧥在花生
金司阳ᖔ 刘寒ᖔ 等ᖔ԰ԡϟᎮ঎ 甘蓝 ዛۗ԰ᣑ ጛቴÞ 转录因子的克
ᡱʢᆍ஦ᔽ᤟ᔽႿ 蛋白ྉ肖杰等ᖔ԰ԡϟϟɯ序列中ᖔ信号肽位于第 隆和生物信息学分析 ЏȮ૒঎ 中国药师ᖔ԰ԡྉϟɯ᧥ᤃͱϟԡ঎૒
ϟጲ ԰࿗ 位蛋白ᖔ 却 没 有 跨膜结构域ଫ 在大豆 ̀ዶશ ऊԻᖔ ۼዶશ᥈ Ȯᖔ ԰ԡϟᤃ঎ ାᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᡷᢃᡱᔀᤣ
༁ᔀዹʢᔀᡷᔀʛ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᔽႿ ᣏᐹႥᡙ၊ᅳቂᅳႥᐹ໧ ዞᐹቂᡓᓣ໧ᡙʗᔠ໧ ᡱ׹঎ ʗᐹᡓ၊ᐹႥᔠ
᥈ቝዶશ᣽ఋᥘ 家族ྉ 柏锡等ᖔ԰ԡϟँɯ 蛋白中存在跨膜
Ꭾጢᤃऊ ЏȮ૒঎ Ȯ ̀ࣼᑕझၤᆍႿ੫ ዶ੫ʢᔽዹ ВႿᔽ׹ᖔ ሕጢྉ࿗ɯ᧥ ࿗԰ͱ࿗ऐ঎ Џ韩长
结构域ଫ在小麦ྉ ௴ʗᔠᡙᔠዞࣩቂ ᐹᓣ໧ᡙᔠצࣩቂɯè᥋ᤦᆍ଴ 蛋白ྉ 王 志ᖔ 王娟ᖔ԰ԡϟᤃ঎ 黄单胞菌 ᣏᐹႥᡙ၊ᅳቂᅳႥᐹ໧ ዞᐹቂᡓᓣ໧ᡙʗᔠ໧ ᡱ׹঎
俊生等ᖔ԰ԡϟሕɯ基因序列中ᖔ第 ँ࿗ 至第 ϟϟጢ 位存在 ʗᐹᡓ၊ᐹႥᔠ Ꭾጢᤃऊ 中ᤣ型分泌蛋白的生物信息学分析 ЏȮ૒঎ 华
一个可能的跨膜区ᖔ且在该蛋白质 શ 端序列不存 中农业大学学报ᖔሕጢྉ࿗ɯ᧥࿗԰ͱ࿗ऐ঎૒
Ȯ᧧ ͐ᖔ Ի̀ᨃВ èᖔ Ի̀ᨃВ Ȯᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟऐ঎ ۼၤᆍ᤟ᔀ ੫ᔀႿᆍቝᔀ
在信号肽ᤥ
ᔽʛᔀႿᡷᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᑕႿʛ ᤦᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ዛۗ԰ᣑ ጛቴጛଧۗ
目前在植物界对 ዛۗ԰ 转录因子的研究主要在 ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ஦ᑕዹᡷᆍʢ༁ ᆍ஦ Ԯᔠऊᔠᡓ၊ࣩ໧ ᢝࣩᢝࣩᤇᓣ ЏȮ૒঎ ᥈ᔀႿᆍቝ ዶᡱᡱ᤟ ାᔽᆍ᤟ᖔ