Page 134 - 《广西植物》2020年第12期
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ϟ 期 原 增 艳 等 ᧥ 地黄 ቴࣷᦵۗᣞ 基因的克隆与表达分析 ϟ ऐ ϟ ँ
一个大小为 ϟ ᎮᎮԡ ᤦᡱ 的完整的开放阅读框ᖔ编码 有 ऐँ 个 ྉዶʢ੫ շ ᓂᢃ༁ɯᤥ 蛋白质稳定性分析发现
ጢऐँ 个氨基酸ᤥ 测序结果使用 ᧕શዶᥘዶશ 软件与转 ऊ༁ऊ᧕۪ϟᎮ 的脂肪指数 为 Ꭾሕ ԡᤃᖔ 不稳定系数为
录组序列进行多序列比对发现ᖔ克隆所得序列与 ࿗ጢᖔ推测其为不稳定蛋白质ᤥ 总平均亲水系数为
转录组所得序列完全一致ᤥ 通过 ାᓂዶ୩ఋ 程序检 ͱԡጢऐ࿗ᖔ属于亲水性蛋白ᤥ
索ᖔ 该片段与紫花风铃木 ྉ ̵ᐹႥʐʗᅳᐹႥᡙ၊ࣩ ੫ऊ᧕۪ 蛋白质特性分析জ 使用 ఋᥘᡱʢᔀʛ 软
ᔠቂᡓᓣᡙᔠᔠႥᅳࣩᖔ ۪᧧શԡऐँԡሕ ϟ ɯܦ 猴面花 ྉ ጛʗᡥᡙ၊ʗᐹႥᡙ၊ᓣ 件ᖔ 预测 ੫ऊ᧕۪ 蛋白的跨膜区ᖔ 结果 显 示ᖔ
ࣩᡙᡙᐹᡙᐹᖔ ᣮ۪ᡸԡϟऐጢᎮᤃᤃϟ ɯܦ 旋蒴苣 苔 ྉ ᦵᅳʗዞᅳዞᓣʗᐹ ੫ऊ᧕۪ 蛋白可能存在一个跨膜螺旋ᖔ位置为 ሕԡँ ጲ
၊ᡥʗᅳቂᓣᡙʗᔠዞࣩቂᖔԻ࿗ԡᎮँ࿗ϟɯ ऊ᧕۪ 蛋白序列的同 ሕᎮᖔ方向由外到内ᤥ 使用 ୩ᔽ੫Ⴟᑕ۪ ࿗ϟ 分析 ੫ऊ᧕۪
源性分别为 ऐँᠮܦऐᤃᠮܦऐᠮᤥ 的信号肽ᖔ结果显示无明显信号肽ᤥ੫ऊ᧕۪ 可能
采用 ᧧Ⴟᡷᔀʢ۪ʢᆍ୩ዹᑕႿ 在线预测工具对地黄 定位于叶绿体ᤥ 通过在线软件对地黄 ੫ऊ᧕۪ 蛋
੫ऊ᧕۪ 蛋白的保守结构域进行分析ᖔ੫ऊ᧕۪ 具 白进行磷酸化位点预测ᖔ结果显示ᖔ੫ऊ᧕۪ 蛋白整
有 ጢ 个保守结构域ᖔ分别是在 ϟᤃ ጲ ሕऐᤃ 位的丝氨 个多肽链有 Ꭾϟ 个磷酸化位点ྉᢦԡጢɯᖔ其中丝氨酸
酸 ᣰ 苏氨酸蛋白激酶催化结构域和 ࿗ 个 ጶè᥋ၤᑕႿʛᖔ
࿗ 个ᖔ苏氨酸 ሕ 个ᖔ酪氨酸 ᤃ 个ᤥ
钙离 子结合结构域 ྉ ࿗ሕሕ ጲ ࿗ᤃϟᖔ࿗Ꭾԡ ጲ ࿗ँऐᖔጢϟ ጲ ሕ ੫ऊ᧕۪ 的结构预测জ 使用 શ۪୩ዶ ༁ᔀʢᔀʢ 在
ጢ࿗ԡᖔጢ࿗ ጲ ጢᎮԡɯ由此确定该序列为地黄 ࣷᦵۗᣞ 基因
线软 件 预 测 ੫ऊ᧕۪ 的二级结构ᖔ 结果 表 明
的 ዹ᧕શዶ 全长序列ᖔ将其命名为 ቴࣷᦵۗᣞᖔ将其序
੫ऊ᧕۪ 蛋白由 ࿗ϟँ࿗ᠮ的 ም᥋螺旋ܦϟԡጢᠮ的延伸
列提交至 ᥈ᔀႿାᑕႿҴᖔ获得登录号为 ᥘఋԡ࿗ሕጢᤥ
链ܦᤃᤃᠮ 的 Ꮗ᥋转角和 ሕँሕँᠮ 的无规卷曲组成ᤥ
使用 ୩औᔽ༁༁᥋ቝᆍʛᔀ 在线软件预测地黄 ੫ऊ᧕۪ 的三
级结构ᤥ 同源建模结果显示ྉ 图 ɯᖔ ੫ऊ᧕۪ 与
拟南 芥 ऊ᧕۪ ྉ ୩ᥘఋᓂ ᧧᧕᧥ ሕीጢᔽ ϟ ɯ 相似度为
ሕሕँ࿗ᠮᖔ具有较高可信度ྉᢦሕԡᠮɯᤥ
ϓ ᧕શዶ 标准分子量ଫ ԣ ቴࣷᦵۗᣞ 基因扩增产物ᤥ
ϓ ᧕શዶ ቝᑕҴᔀʢଫ ԣ ۪ऊ ᑕቝᡱᔽᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍʛࣼዹᡷ ᆍ ቴࣷᦵۗᣞॹ
图 ϟজ ੫ऊ᧕۪ 基因克隆
èᔽ੫ ϟজ ᥈ᔀႿᔀ ዹᆍႿᔀ ᆍ ቴࣷᦵۗᣞ
ԣॹԣ ቴࣷᦵۗᣞ 的生物信息学分析
ϟ ੫ऊ᧕۪ 蛋白质理化性质及疏水性分析জ
ቴࣷᦵۗᣞ 基因的开放阅读框大小为 ϟ ᎮᎮԡ ᤦᡱᖔ共编
码 ጢऐँ 个氨基酸残基ᤥ੫ऊ᧕۪ 蛋白质的相对分
子质量为 ᤃᤃԡᤃ Ҵ᧕ଫ理论等电点ྉ۪᧧ɯ为 ጢँϟᖔ原子
图 জ ੫ऊ᧕۪ 蛋白的三级结构
组成 ऊ ̀ શ ᨃ ୩ ᖔ总原子数为 ँ Ꭾᖔ带负 èᔽ੫ জ ੫ऊ᧕۪ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᡷᔀʢᡷᔽᑕʢᢃ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ
ँԡऐ ࿗ᤃ࿗ ऐሕ ऐँԡ ϟऐ
电的氨基酸有 ऐԡ 个ྉዶ༁ᡱ շ ᥈ࣼɯᖔ带正电的氨基酸
