Page 27 - 《广西植物》2020年第4期
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4 期 刘成等: 基于 SRAP 标记的紫溪山华山松种子园无性系遗传多样性分析 4 6 5
表 2 SRAP 引物序列
Table 2 SRAP primer sequences
序号 正向引物(5′-3′) 序号 反向引物(5′-3′)
Order number Forward primer(5′-3′) Order number Reverse primer(5′-3′)
ME1 TGAGTCCAAACCGGATA EM1 GACTGCGTACGAATTTGA
ME2 TGAGTCCAAACCGGAGC EM2 GACTGCGTACGAATTCTG
ME3 TGAGTCCAAACCGGACC EM3 GACACCGTACGAATTGAC
ME4 TGAGTCCAAACCGGTAA EM4 GACTGCGTACGAATTTGC
ME5 TGAGTCCAAACCGGAAT EM5 GACTGAGTACGAATTAAC
ME6 TGAGTCCAAACCGGAAG EM6 GACTGCGTACGAATTAAT
ME7 TGAGTGGAAACCGGTCC EM7 GACTGCGTACGAATTCAA
ME8 TGAGTCCAAACCGGTGC EM8 GACTGCGTACGAATTGAC
F7 GTAGCACAAGCCGGAGC EM9 GACTGCGTACGAATTCCA
FME6 TGAGTCCTTTCCGGTAA EM10 GACTGCGTACGAATTGCA
表 3 华山松 15 对多态性 SRAP 引物序列信息
Table 3 SRAP sequence information of the 15 pairs of polymorphic primers for Pinus armandii
引物组合 正向引物(5′-3′) 反向引物(5′-3′) 退火温度
Primer combination Forward primer(5′-3′) Reverse primer(5′-3′) Annealing temperature (℃ )
ME1 ̄EM5 TGAGTCCAAACCGGATA GACTGAGTACGAATTAAC 53
ME1 ̄EM8 TGAGTCCAAACCGGATA GACTGCGTACGAATTGAC 53
ME2 ̄EM4 TGAGTCCAAACCGGAGC GACTGCGTACGAATTTGC 53
ME2 ̄EM7 TGAGTCCAAACCGGAGC GACTGCGTACGAATTCAA 53
ME2 ̄EM9 TGAGTCCAAACCGGAGC GACTGCGTACGAATTCCA 53
ME3 ̄EM1 TGAGTCCAAACCGGACC GACTGCGTACGAATTTGA 53
ME3 ̄EM10 TGAGTCCAAACCGGACC GACTGCGTACGAATTGCA 53
ME3 ̄EM3 TGAGTCCAAACCGGACC GACACCGTACGAATTGAC 53
ME3 ̄EM5 TGAGTCCAAACCGGACC GACTGAGTACGAATTAAC 53
ME3 ̄EM8 TGAGTCCAAACCGGACC GACTGCGTACGAATTGAC 53
ME4 ̄EM1 TGAGTCCAAACCGGTAA GACTGCGTACGAATTTGA 53
ME4 ̄EM2 TGAGTCCAAACCGGTAA GACTGCGTACGAATTCTG 53
ME4 ̄EM3 TGAGTCCAAACCGGTAA GACACCGTACGAATTGAC 53
ME4 ̄EM7 TGAGTCCAAACCGGTAA GACTGCGTACGAATTCAA 53
ME4 ̄EM9 TGAGTCCAAACCGGTAA GACTGCGTACGAATTCCA 53
考带型ꎬ根据实验得到的聚丙烯凝胶电泳图ꎬ同一 利用 Excel 表对 60 株华山 松 进 行 多 态 位 点
位点清晰的条带ꎬ记“1”ꎻ无带或者弱带记“0”ꎬ模 数、多 态 性 百 分 比 统 计 计 算ꎻ 通 过 POPGENE
糊不清的不予计数ꎬ从而构成(0ꎬ1) 矩阵ꎬ调整格 version 1. 32 分析软件进行遗传多样性分析[ 观测
式以符合软件分析要求ꎮ 等位基因( Na)、有效等位基因数( Ne)、基因多样