Page 73 - 《广西植物》2020年第4期
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4 期 樊航等: 西番莲 PeERG 基因克隆及其表达模式分析 5 1 1
程中发挥重要作用ꎮ 州省平塘县西番莲种质资源库(106°48′45.44″ E、
植物 ERG 蛋白定位于线粒体或叶绿体ꎬ它们 25°44′24.77″ Nꎬ海拔 884 m)ꎬ其不同组织器官根、
在植物的生长发育过程中扮演重要角色(Ingram et 茎、叶、花、果(R、S、L、Fl、Fr) 采集于 2 年生的大田
al.ꎬ 1998ꎻ Suwastika et al.ꎬ 2014ꎻ Cheng et al.ꎬ 扦插苗ꎮ 盆栽的 1 年生扦插苗ꎬ用于 4 ℃ 低温胁
2018)ꎮ 迄今ꎬ还没有木本植物 ERG 基因克隆和 迫及 25 ℃ 常温恢复试验ꎬ并在其低温胁迫 0 h( 对
功能验证的相关报道ꎮ 西番莲抗寒新品种‘ 平塘 1 照)、1 h( LST ̄1h)、4 h( LST ̄4h)、8 h( LST ̄8h)、24
号’ꎬ经受过 2008 年中国南方雪凝冰冻极端天气 h(LST ̄24h)、72 h(LST ̄72h) 及其放置于常温恢复
的考验ꎬ是目前选育出的唯一能在贵州喀斯特山 1 h( NTR ̄1h)、4 h( NTR ̄4h)、8 h( NTR ̄8h)、24 h
区不经任何保暖防护措施而在零下温度条件能顺 (NTR ̄24h)、72 h(NTR ̄72h)11 个时间点取其叶片
利越冬的西番莲新种质ꎮ 课题组前期开展了西番 用于目的基因在低温胁迫及常温恢复过程中的表
莲抗 寒 性 状 的 分 子 调 控 模 式 研 究 ( Liu et al.ꎬ 达谱分析ꎮ 所用三个生物学重复的上述样品经液
2017)ꎬ差异基因表达谱分析发现ꎬERG 基因参与 氮速冻后保存于-80 ℃ 超低温冰箱备用ꎮ
调控西番莲低温应答响应ꎮ 本研究以此为切入 1.2 总 RNA 提取与 cDNA 合成
点ꎬ通过 RACE 技术克隆西番莲 ERG 基因ꎬ开展该 采用天根生物科技( 北京) 有限公司提供的
基因编码蛋白质序列的同源性比对、保守结构域 RNAprep Pure Plant Kit( TIANGENꎬ北京) 抽提纯
及系统进化分析ꎬ并利用实时定量 PCR 平台检测 化植物总 RNAꎬ并用宝生物工程( 大连) 有限公司
该转录本在低温胁迫条件下的动态变化模式ꎬ为 的 PrimeScript RT Master Mix(TaKaRaꎬ大连)进行
TM
深入揭示 ERG 基因在植物生长发育和逆境应答响 反转录合成 cDNA 用于后续基因表达分析ꎮ
应中的生物学功能提供新思路ꎮ 1.3 cDNA 末端快速克隆(RACE)
根据实验室前期研究获得的候选基因 unigene
1 材料与方法 序列(Liu et al.ꎬ 2017)ꎬ设计 PCR 引物( 表 1)ꎬ以
‘平塘 1 号’ 叶片 cDNA 为模板ꎬ开展候选基因片
1.1 植物材料及低温胁迫试验 段的 PCR 扩增和测序验证ꎮ 基于测序验证获得的
西番莲抗寒新品种‘平塘 1 号’ 材料来自于贵 基因片段序列设计 RACE 特异引物 (表 1)ꎬ 按照
表 1 引物序列
Table 1 Primer sequences
引物名称 正向引物(5′ ̄3′) 反向引物(5′ ̄3′)
Primer_ID Forward PCR primer(5′ ̄3′) Reverse PCR primer(5′ ̄3′)
PeERG_基因片段 GACGGCGACGAAGAGGACGAAGAA TGGCCCAGAGCAAGACAACGTAG
PeERG _Unigene
PeERG_3 外引物 CCGATAAGCACAGACAACAAGGC ACTCTGCGTTGATACCACTGCTTGCCCTATAGTGAGTCGTATTAG
PeERG _3OUTER
PeERG_3 内引物 ATGAAGAATGTCCGCAGTGCTG GCCCTATAGTGAGTCGTATTAG
PeERG _3INNER
PeERG_5 外引物 GCGAGGCATGGAATCATCCTGTGCTAA CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT
PeERG _5OUTER
PeERG_5 内引物 CAACAAAAGGGACGGCTACGAA CTAATACGACTCACTATAGGGC
PeERG _5INNER
开放阅读框 ATGGAGCTAGTTTTAAACGTCTC TAATGCTGCGATTTTCCCTC
PeERG _ORF
PeERG 定量引物 CAGATGCGGATTAGCGAGC CGTCTTCTTCGTCCTCTTC
PeERG _qRT ̄PCR
内参基因定量引物 TGGGCCGATGTCCTTGAGAGA GGATGACTTGAGGCTCCCAACTG
eIF ̄5A_qRT ̄PCR